Programmable Readers, Writers, and Erasers of the Epigenetic Cytosine Code

Informations projet

EPICODE

N° de convention de subvention: 723863

DOI

10.3030/723863

Projet clôturé

Date de signature de la CE 22 Avril 2017

Date de début 1 Novembre 2017

Date de fin 30 Avril 2023

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 979 679,00

Contribution de l’UE

€ 1 979 679,00

Coordonné par

TECHNISCHE UNIVERSITAT DORTMUND
Germany

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Publications

Peer reviewed articles (12)

Encoded, click-reactive DNA-binding domains for programmable capture of specific chromatin segments.

Auteurs: Anna Witte; Álvaro Muñoz-López; Malte Metz; Michal R. Schweiger; Petra Janning; Daniel Summerer
Publié dans: Chemical Science, Numéro 1, 2020, Page(s) 12506-12511, ISSN 2041-6520
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d0sc02707c

Epigenetic chromatin modification by amber suppression technology

Auteurs: Heinz Neumann, Petra Neumann-Staubitz, Anna Witte, Daniel Summerer
Publié dans: Current Opinion in Chemical Biology, Numéro 45, 2018, Page(s) 1-9, ISSN 1367-5931
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cbpa.2018.01.017

Overcoming conservation in TALE–DNA interactions: a minimal repeat scaffold enables selective recognition of an oxidized 5-methylcytosine

Auteurs: Sara Maurer, Benjamin Buchmuller, Christiane Ehrt, Julia Jasper, Oliver Koch, Daniel Summerer
Publié dans: Chemical Science, Numéro 9/36, 2018, Page(s) 7247-7252, ISSN 2041-6520
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c8sc01958d

Expanding the Genetic Code for Site-Directed Spin-Labeling

Auteurs: Theresa Braun, Malte Drescher, Daniel Summerer
Publié dans: International Journal of Molecular Sciences, Numéro 20/2, 2019, Page(s) 373, ISSN 1422-0067
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms20020373

Programmable Protein–DNA Cross-Linking for the Direct Capture and Quantification of 5-Formylcytosine

Auteurs: Mario Gieß, Álvaro Muñoz-López, Benjamin Buchmuller, Grzegorz Kubik, Daniel Summerer
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 141/24, 2019, Page(s) 9453-9457, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.9b01432

Complete Profiling of Methyl-CpG-Binding Domains for Combinations of Cytosine Modifications at CpG Dinucleotides Reveals Differential Read-out in Normal and Rett-Associated States

Auteurs: Benjamin C. Buchmuller, Brinja Kosel, Daniel Summerer
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-61030-1

Designer Receptors for Nucleotide‐Resolution Analysis of Genomic 5‐Methylcytosine by Cellular Imaging

Auteurs: Álvaro Muñoz‐López, Benjamin Buchmuller, Jan Wolffgramm, Anne Jung, Michelle Hussong, Julian Kanne, Michal R. Schweiger, Daniel Summerer
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 59/23, 2020, Page(s) 8927-8931, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202001935

Light-Activatable TET-Dioxygenases Reveal Dynamics of 5-Methylcytosine Oxidation and Transcriptome Reorganization

Auteurs: Shubhendu Palei, Benjamin Buchmuller, Jan Wolffgramm, Álvaro Muñoz-Lopez, Sascha Jung, Paul Czodrowski, Daniel Summerer
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 142/16, 2020, Page(s) 7289-7294, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.0c01193

Optochemical Control of TET Dioxygenases Enables Kinetic Insights into the Domain-Dependent Interplay of TET1 and MBD1 while Oxidizing and Reading 5-Methylcytosine

Auteurs: Tzu-Chen Lin, Shubhendu Palei, and Daniel Summerer
Publié dans: ACS Chemical Biology, 2022, ISSN 1554-8929
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acschembio.2c00245

Light-activation of DNA-methyltransferases

Auteurs: Wolffgramm, Jan; Buchmuller, Benjamin; Palei, Shubhendu; Muñoz-López, Álvaro; Kanne, Julian; Janning, Petra; Schweiger, Michal R.; Summerer, Daniel
Publié dans: Angewandte Chemie, 2021, Page(s) 13507-13512, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202103945

Engineered TALE Repeats for Enhanced Imaging-Based Analysis of Cellular 5-Methylcytosine.

Auteurs: Álvaro Muñoz-López; Anne Jung; Benjamin Buchmuller; Jan Wolffgramm; Sara Maurer; Anna Witte; Daniel Summerer
Publié dans: ChemBioChem, 2020, ISSN 1439-7633
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/cbic.202000563

Evolved DNA Duplex Readers for Strand-Asymmetrically Modified 5-Hydroxymethylcytosine/5-Methylcytosine CpG Dyads

Auteurs: Benjamin C. Buchmuller; Jessica Dröden; Himanshu Singh; Shubhendu Palei; Malte Drescher; Rasmus Linser; Daniel Summerer
Publié dans: JACS, 2022, Page(s) 2987-2993, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.1c10678