Programmable Readers, Writers, and Erasers of the Epigenetic Cytosine Code

Informazioni relative al progetto

EPICODE

ID dell’accordo di sovvenzione: 723863

DOI

10.3030/723863

Progetto chiuso

Data della firma CE 22 Aprile 2017

Data di avvio 1 Novembre 2017

Data di completamento 30 Aprile 2023

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 979 679,00

Contributo UE

€ 1 979 679,00

Coordinato da

TECHNISCHE UNIVERSITAT DORTMUND
Germany

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I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (12)

Encoded, click-reactive DNA-binding domains for programmable capture of specific chromatin segments.

Autori: Anna Witte; Álvaro Muñoz-López; Malte Metz; Michal R. Schweiger; Petra Janning; Daniel Summerer
Pubblicato in: Chemical Science, Numero 1, 2020, Pagina/e 12506-12511, ISSN 2041-6520
Editore: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d0sc02707c

Epigenetic chromatin modification by amber suppression technology

Autori: Heinz Neumann, Petra Neumann-Staubitz, Anna Witte, Daniel Summerer
Pubblicato in: Current Opinion in Chemical Biology, Numero 45, 2018, Pagina/e 1-9, ISSN 1367-5931
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cbpa.2018.01.017

Overcoming conservation in TALE–DNA interactions: a minimal repeat scaffold enables selective recognition of an oxidized 5-methylcytosine

Autori: Sara Maurer, Benjamin Buchmuller, Christiane Ehrt, Julia Jasper, Oliver Koch, Daniel Summerer
Pubblicato in: Chemical Science, Numero 9/36, 2018, Pagina/e 7247-7252, ISSN 2041-6520
Editore: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c8sc01958d

Expanding the Genetic Code for Site-Directed Spin-Labeling

Autori: Theresa Braun, Malte Drescher, Daniel Summerer
Pubblicato in: International Journal of Molecular Sciences, Numero 20/2, 2019, Pagina/e 373, ISSN 1422-0067
Editore: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms20020373

Programmable Protein–DNA Cross-Linking for the Direct Capture and Quantification of 5-Formylcytosine

Autori: Mario Gieß, Álvaro Muñoz-López, Benjamin Buchmuller, Grzegorz Kubik, Daniel Summerer
Pubblicato in: Journal of the American Chemical Society, Numero 141/24, 2019, Pagina/e 9453-9457, ISSN 0002-7863
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.9b01432

Complete Profiling of Methyl-CpG-Binding Domains for Combinations of Cytosine Modifications at CpG Dinucleotides Reveals Differential Read-out in Normal and Rett-Associated States

Autori: Benjamin C. Buchmuller, Brinja Kosel, Daniel Summerer
Pubblicato in: Scientific Reports, Numero 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-61030-1

Designer Receptors for Nucleotide‐Resolution Analysis of Genomic 5‐Methylcytosine by Cellular Imaging

Autori: Álvaro Muñoz‐López, Benjamin Buchmuller, Jan Wolffgramm, Anne Jung, Michelle Hussong, Julian Kanne, Michal R. Schweiger, Daniel Summerer
Pubblicato in: Angewandte Chemie International Edition, Numero 59/23, 2020, Pagina/e 8927-8931, ISSN 1433-7851
Editore: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202001935

Light-Activatable TET-Dioxygenases Reveal Dynamics of 5-Methylcytosine Oxidation and Transcriptome Reorganization

Autori: Shubhendu Palei, Benjamin Buchmuller, Jan Wolffgramm, Álvaro Muñoz-Lopez, Sascha Jung, Paul Czodrowski, Daniel Summerer
Pubblicato in: Journal of the American Chemical Society, Numero 142/16, 2020, Pagina/e 7289-7294, ISSN 0002-7863
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.0c01193

Optochemical Control of TET Dioxygenases Enables Kinetic Insights into the Domain-Dependent Interplay of TET1 and MBD1 while Oxidizing and Reading 5-Methylcytosine

Autori: Tzu-Chen Lin, Shubhendu Palei, and Daniel Summerer
Pubblicato in: ACS Chemical Biology, 2022, ISSN 1554-8929
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acschembio.2c00245

Light-activation of DNA-methyltransferases

Autori: Wolffgramm, Jan; Buchmuller, Benjamin; Palei, Shubhendu; Muñoz-López, Álvaro; Kanne, Julian; Janning, Petra; Schweiger, Michal R.; Summerer, Daniel
Pubblicato in: Angewandte Chemie, 2021, Pagina/e 13507-13512, ISSN 1433-7851
Editore: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202103945

Engineered TALE Repeats for Enhanced Imaging-Based Analysis of Cellular 5-Methylcytosine.

Autori: Álvaro Muñoz-López; Anne Jung; Benjamin Buchmuller; Jan Wolffgramm; Sara Maurer; Anna Witte; Daniel Summerer
Pubblicato in: ChemBioChem, 2020, ISSN 1439-7633
Editore: Wiley
DOI: 10.1002/cbic.202000563

Evolved DNA Duplex Readers for Strand-Asymmetrically Modified 5-Hydroxymethylcytosine/5-Methylcytosine CpG Dyads

Autori: Benjamin C. Buchmuller; Jessica Dröden; Himanshu Singh; Shubhendu Palei; Malte Drescher; Rasmus Linser; Daniel Summerer
Pubblicato in: JACS, 2022, Pagina/e 2987-2993, ISSN 0002-7863
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.1c10678