Programmable Readers, Writers, and Erasers of the Epigenetic Cytosine Code

Informacje na temat projektu

EPICODE

Identyfikator umowy o grant: 723863

DOI

10.3030/723863

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 22 Kwietnia 2017

Data rozpoczęcia 1 Listopada 2017

Data zakończenia 30 Kwietnia 2023

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 979 679,00

Wkład UE

€ 1 979 679,00

Koordynowany przez

TECHNISCHE UNIVERSITAT DORTMUND
Germany

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (12)

Encoded, click-reactive DNA-binding domains for programmable capture of specific chromatin segments.

Autorzy: Anna Witte; Álvaro Muñoz-López; Malte Metz; Michal R. Schweiger; Petra Janning; Daniel Summerer
Opublikowane w: Chemical Science, Numer 1, 2020, Strona(/y) 12506-12511, ISSN 2041-6520
Wydawca: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d0sc02707c

Epigenetic chromatin modification by amber suppression technology

Autorzy: Heinz Neumann, Petra Neumann-Staubitz, Anna Witte, Daniel Summerer
Opublikowane w: Current Opinion in Chemical Biology, Numer 45, 2018, Strona(/y) 1-9, ISSN 1367-5931
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cbpa.2018.01.017

Overcoming conservation in TALE–DNA interactions: a minimal repeat scaffold enables selective recognition of an oxidized 5-methylcytosine

Autorzy: Sara Maurer, Benjamin Buchmuller, Christiane Ehrt, Julia Jasper, Oliver Koch, Daniel Summerer
Opublikowane w: Chemical Science, Numer 9/36, 2018, Strona(/y) 7247-7252, ISSN 2041-6520
Wydawca: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c8sc01958d

Expanding the Genetic Code for Site-Directed Spin-Labeling

Autorzy: Theresa Braun, Malte Drescher, Daniel Summerer
Opublikowane w: International Journal of Molecular Sciences, Numer 20/2, 2019, Strona(/y) 373, ISSN 1422-0067
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms20020373

Programmable Protein–DNA Cross-Linking for the Direct Capture and Quantification of 5-Formylcytosine

Autorzy: Mario Gieß, Álvaro Muñoz-López, Benjamin Buchmuller, Grzegorz Kubik, Daniel Summerer
Opublikowane w: Journal of the American Chemical Society, Numer 141/24, 2019, Strona(/y) 9453-9457, ISSN 0002-7863
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.9b01432

Complete Profiling of Methyl-CpG-Binding Domains for Combinations of Cytosine Modifications at CpG Dinucleotides Reveals Differential Read-out in Normal and Rett-Associated States

Autorzy: Benjamin C. Buchmuller, Brinja Kosel, Daniel Summerer
Opublikowane w: Scientific Reports, Numer 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-61030-1

Designer Receptors for Nucleotide‐Resolution Analysis of Genomic 5‐Methylcytosine by Cellular Imaging

Autorzy: Álvaro Muñoz‐López, Benjamin Buchmuller, Jan Wolffgramm, Anne Jung, Michelle Hussong, Julian Kanne, Michal R. Schweiger, Daniel Summerer
Opublikowane w: Angewandte Chemie International Edition, Numer 59/23, 2020, Strona(/y) 8927-8931, ISSN 1433-7851
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202001935

Light-Activatable TET-Dioxygenases Reveal Dynamics of 5-Methylcytosine Oxidation and Transcriptome Reorganization

Autorzy: Shubhendu Palei, Benjamin Buchmuller, Jan Wolffgramm, Álvaro Muñoz-Lopez, Sascha Jung, Paul Czodrowski, Daniel Summerer
Opublikowane w: Journal of the American Chemical Society, Numer 142/16, 2020, Strona(/y) 7289-7294, ISSN 0002-7863
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.0c01193

Optochemical Control of TET Dioxygenases Enables Kinetic Insights into the Domain-Dependent Interplay of TET1 and MBD1 while Oxidizing and Reading 5-Methylcytosine

Autorzy: Tzu-Chen Lin, Shubhendu Palei, and Daniel Summerer
Opublikowane w: ACS Chemical Biology, 2022, ISSN 1554-8929
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acschembio.2c00245

Light-activation of DNA-methyltransferases

Autorzy: Wolffgramm, Jan; Buchmuller, Benjamin; Palei, Shubhendu; Muñoz-López, Álvaro; Kanne, Julian; Janning, Petra; Schweiger, Michal R.; Summerer, Daniel
Opublikowane w: Angewandte Chemie, 2021, Strona(/y) 13507-13512, ISSN 1433-7851
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202103945

Engineered TALE Repeats for Enhanced Imaging-Based Analysis of Cellular 5-Methylcytosine.

Autorzy: Álvaro Muñoz-López; Anne Jung; Benjamin Buchmuller; Jan Wolffgramm; Sara Maurer; Anna Witte; Daniel Summerer
Opublikowane w: ChemBioChem, 2020, ISSN 1439-7633
Wydawca: Wiley
DOI: 10.1002/cbic.202000563

Evolved DNA Duplex Readers for Strand-Asymmetrically Modified 5-Hydroxymethylcytosine/5-Methylcytosine CpG Dyads

Autorzy: Benjamin C. Buchmuller; Jessica Dröden; Himanshu Singh; Shubhendu Palei; Malte Drescher; Rasmus Linser; Daniel Summerer
Opublikowane w: JACS, 2022, Strona(/y) 2987-2993, ISSN 0002-7863
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.1c10678