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SPIDIA for Personalized Medicine - Standardisation of generic Pre-analytical procedures for In-vitro DIAgnostics for Personalized Medicine

Leistungen

List of standards available
Definition of the communication campaign and reviewed (M24)

Definition of the communication campaign and reviewed once a year

Summary of the validation studies for demonstrating a reduction of diagnostic mistake
List of reference biobanks providing biological resources complying with the standards
Education and training curriculum
Definition of the communication campaign and reviewed (M36)

Definition of the communication campaign and reviewed once a year

Definition of the communication campaign and reviewed (M54)

Definition of the communication campaign and reviewed once a year

Definition of the communication campaign and reviewed (M12)

Definition of the communication campaign and reviewed once a year ( M12, M24, M36, M48)

Statistics, summary of incidents and measures taken published in the public domain (M18)

Statistics, summary of incidents and measures taken published in the public domain and any updated figures will be included in the periodic reports (M36 and M48)

Veröffentlichungen

A Novel HPLC-Based Method to Investigate on RNA after Fixation

Autoren: Paolo Fattorini, Cristina Forzato, Domenico Tierno, Eleonora De Martino, Eros Azzalini, Vincenzo Canzonieri, Giorgio Stanta, Serena Bonin
Veröffentlicht in: International Journal of Molecular Sciences, Ausgabe 21/20, 2020, Seite(n) 7540, ISSN 1422-0067
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms21207540

Multicenter Evaluation of Circulating Cell-Free DNA Extraction and Downstream Analyses for the Development of Standardized (Pre)analytical Work Flows

Autoren: Rita Lampignano, Martin H.D Neumann, Sabrina Weber, Vera Kloten, Andrei Herdean, Thorsten Voss, Daniel Groelz, Anna Babayan, Marco Tibbesma, Martin Schlumpberger, Francesca Chemi, Dominic G Rothwell, Harriet Wikman, Jean-Pierre Galizzi, Inger Riise Bergheim, Hege Russnes, Benedetta Mussolin, Serena Bonin, Christine Voigt, Hanny Musa, Pamela Pinzani, Evi Lianidou, Ged Brady, Michael R Speicher, Kla
Veröffentlicht in: Clinical Chemistry, Ausgabe 66/1, 2019, Seite(n) 149-160, ISSN 0009-9147
Herausgeber: American Association for Clinical Chemistry, Inc.
DOI: 10.1373/clinchem.2019.306837

Standardization of generic pre-analytical procedures for in vitro diagnostics for personalized medicine

Autoren: Uwe Oelmueller
Veröffentlicht in: New Biotechnology, Ausgabe 60, 2021, Seite(n) 1, ISSN 1871-6784
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.nbt.2020.07.003

Metabolomic Fingerprints in Large Population Cohorts: Impact of Preanalytical Heterogeneity

Autoren: Veronica Ghini, Peter M Abuja, Ozren Polasek, Lukasz Kozera, Päivi Laiho, Gabriele Anton, Marie Zins, Janis Klovins, Andres Metspalu, H -Erich Wichmann, Christian Gieger, Claudio Luchinat, Kurt Zatloukal, Paola Turano
Veröffentlicht in: Clinical Chemistry, 2021, ISSN 0009-9147
Herausgeber: American Association for Clinical Chemistry, Inc.
DOI: 10.1093/clinchem/hvab092

The pre-analytical phase of the liquid biopsy

Autoren: Francesca Salvianti, Stefania Gelmini, Filomena Costanza, Irene Mancini, Gemma Sonnati, Lisa Simi, Mario Pazzagli, Pamela Pinzani
Veröffentlicht in: New Biotechnology, Ausgabe 55, 2020, Seite(n) 19-29, ISSN 1871-6784
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.nbt.2019.09.006

Impact of storage conditions on the quality of nucleic acids in paraffin embedded tissues

Autoren: Daniel Groelz, Christian Viertler, Daniela Pabst, Nadine Dettmann, Kurt Zatloukal
Veröffentlicht in: PLOS ONE, Ausgabe 13/9, 2018, Seite(n) e0203608, ISSN 1932-6203
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0203608

Biobanks in personalized medicine

Autoren: Kurt Zatloukal, Cornelia Stumptner, Penelope Kungl, Heimo Mueller
Veröffentlicht in: Expert Review of Precision Medicine and Drug Development, Ausgabe 3/4, 2018, Seite(n) 265-273, ISSN 2380-8993
Herausgeber: Expert Review of Precision Medecine and Drug Development
DOI: 10.1080/23808993.2018.1493921

High-throughput metabolomics by 1D NMR

Autoren: Alessia Vignoli, Veronica Ghini, Gaia Meoni, Cristina Licari, Panteleimon G. Takis, Leonardo Tenori, Paola Turano, Claudio Luchinat
Veröffentlicht in: Angewandte Chemie International Edition, Ausgabe -, 2018, Seite(n) -, ISSN 1433-7851
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.201804736

Advancing Biomarker Development Through Convergent Engagement: Summary Report of the 2nd International Danube Symposium on Biomarker Development, Molecular Imaging and Applied Diagnostics; March 14–16, 2018; Vienna, Austria

Autoren: M. S. Lim, Thomas Beyer, A. Babayan, M. Bergmann, M. Brehme, A. Buyx, J. Czernin, G. Egger, K. S. J. Elenitoba-Johnson, B. Gückel, A. Jačan, H. Haslacher, R. J. Hicks, L. Kenner, M. Langanke, M. Mitterhauser, B. J. Pichler, H. R. Salih, R. Schibli, S. Schulz, J. Simecek, J. Simon, M. O. Soares, U. Stelzl, W. Wadsak, K. Zatloukal, M. Zeitlinger, M. Hacker
Veröffentlicht in: Molecular Imaging and Biology, Ausgabe 22/1, 2020, Seite(n) 47-65, ISSN 1536-1632
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1007/s11307-019-01361-2

NMR for sample quality assessment in metabolomics

Autoren: Veronica Ghini, Deborah Quaglio, Claudio Luchinat, Paola Turano
Veröffentlicht in: New Biotechnology, Ausgabe 52, 2019, Seite(n) 25-34, ISSN 1871-6784
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.nbt.2019.04.004

Pre-analytics and tumor heterogeneity

Autoren: Serena Bonin, Giorgio Stanta
Veröffentlicht in: New Biotechnology, Ausgabe 55, 2020, Seite(n) 30-35, ISSN 1871-6784
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.nbt.2019.09.007

The impact of crosslinking and non-crosslinking fixatives on antigen retrieval and immunohistochemistry

Autoren: Cornelia Stumptner, Daniela Pabst, Martina Loibner, Christian Viertler, Kurt Zatloukal
Veröffentlicht in: New Biotechnology, Ausgabe 52, 2019, Seite(n) 69-83, ISSN 1871-6784
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.nbt.2019.05.003

Methodological and statistical issues in developing an External Quality Assessment scheme in laboratory medicine: Focus on biomarker research

Autoren: Paolo Verderio, Sara Pizzamiglio, Chiara Maura Ciniselli
Veröffentlicht in: New Biotechnology, Ausgabe 52, 2019, Seite(n) 54-59, ISSN 1871-6784
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.nbt.2019.05.001

Pre-analytical processes in medical diagnostics: New regulatory requirements and standards

Autoren: Georges Dagher, Karl-Friedrich Becker, Serena Bonin, Carole Foy, Stefania Gelmini, Mikael Kubista, Penelope Kungl, Uwe Oelmueller, Helen Parkes, Pamela Pinzani, Peter Riegman, Ulrike Schröder, Cornelia Stumptner, Paola Turano, Robert Sjöback, Andrea Wutte, Kurt Zatloukal
Veröffentlicht in: New Biotechnology, Ausgabe 52, 2019, Seite(n) 121-125, ISSN 1871-6784
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.nbt.2019.05.002

Tissues under-vacuum to overcome suboptimal preservation

Autoren: Laura Annaratone, Caterina Marchiò, Anna Sapino
Veröffentlicht in: New Biotechnology, Ausgabe 52, 2019, Seite(n) 104-109, ISSN 1871-6784
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.nbt.2019.05.007

How standardization of the pre-analytical phase of both research and diagnostic biomaterials can increase reproducibility of biomedical research and diagnostics

Autoren: P.H.J. Riegman, K.F. Becker, K. Zatloukal, M. Pazzagli, U. Schröder, U. Oelmuller
Veröffentlicht in: New Biotechnology, Ausgabe 53, 2019, Seite(n) 35-40, ISSN 1871-6784
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.nbt.2019.06.007

Biobanks for life sciences and personalized medicine: importance of standardization, biosafety, biosecurity, and data management

Autoren: Heimo Müller, Georges Dagher, Martina Loibner, Cornelia Stumptner, Penelope Kungl, Kurt Zatloukal
Veröffentlicht in: Current Opinion in Biotechnology, Ausgabe 65, 2020, Seite(n) 45-51, ISSN 0958-1669
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.copbio.2019.12.004

Cold Formalin Fixation Guarantees DNA Integrity in Formalin Fixed Paraffin Embedded Tissues: Premises for a Better Quality of Diagnostic and Experimental Pathology With a Specific Impact on Breast Cancer

Autoren: Enrico Berrino, Laura Annaratone, Umberto Miglio, Elena Maldi, Chiara Piccinelli, Erica Peano, Davide Balmativola, Paola Cassoni, Alberto Pisacane, Ivana Sarotto, Tiziana Venesio, Anna Sapino, Caterina Marchiò
Veröffentlicht in: Frontiers in Oncology, Ausgabe 10, 2020, ISSN 2234-943X
Herausgeber: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fonc.2020.00173

Metabolomic Fingerprints in Large Population Cohorts: Impact of Preanalytical Heterogeneity

Autoren: Ghini V, Abuja M P, Polasek O, Kozera L, Laiho P, Anton G, Zins M, Klovins J, Metspalu A, Wichmann H E, Gieger C, Luchinat C, Zatloukal K, Turano P
Veröffentlicht in: Oxford ACADEMIE, 2021
Herausgeber: Chinical chemistry

Antibody validation: a view from the mountains

Autoren: Michael J. Taussig, Cláudia Fonseca, James S. Trimmer
Veröffentlicht in: New Biotechnology, Ausgabe 45, 2018, Seite(n) 1-8, ISSN 1871-6784
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.nbt.2018.08.002

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