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Muscle Specific C. elegans Genome in health and disease: finding novel factors in 3D organization

Ziel

The loss of structural integrity in the interphase nucleus leads to tissue-specific pathologies in a set of human diseases collectively called laminopathies. These are late-onset, tissue-specific degenerative diseases, such as Emery Dreifuss Muscular Dystrophy (EDMD). While rare, these conditions provide insight into more common degenerative disorders linked to aging. A Caennorhabditis elegans mutant that recreates the EDMD phenotypes arises from introduction of a specific gain-of-function mutation into lamin (LMN-1 Y59C), which in turn affects the subnuclear distribution of muscle-specific promoters. This proposal plans to identify novel factors that establish and/or maintain the 3D organization of the genome in differentiated nuclei and to determine how this contributes to the differentiated muscle cell fate. I propose that compromised or altered sequestration of chromatin at the nuclear envelope alters cell-type specific promoter induction and in turn compromises the integrity of the tissue in question.
The specific aims of the project are 1) To identify factors that establish and/or maintain 3D genome organization in muscle nuclei. 2) To determine if the integrity of the perinuclear chromatin binding machinery helps maintain differentiated cell states. 3) To test inhibitors of epigenetic regulators for compounds that overcome the EDMD-like LMN-1 Y59C mutation. I will take two complementary approaches to determine how muscle specific chromatin organization maintains tissue integrity. I will use in vivo biochemical tagging in the LMN-1 Y59C mutant to identify perinuclear components that mediate sequestration of muscle-specific gene promoters. In parallel, a drug screen will find compounds that reverse the nuclear disorganization linked to the EDMD-like phenotype. The pathways identified will explain how lamin-induced mis-organization of the genome influences muscle integrity, a topic relevant for muscular dystrophies, sarcopenia, and other degenerative disease.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

MSCA-IF-EF-ST - Standard EF

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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) H2020-MSCA-IF-2016

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

FRIEDRICH MIESCHER INSTITUTE FOR BIOMEDICAL RESEARCH FONDATION
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 187 419,60
Adresse
FABRIKSTRASSE 2
4056 BASEL
Schweiz

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Region
Schweiz/Suisse/Svizzera Nordwestschweiz Basel-Stadt
Aktivitätstyp
Research Organisations
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

€ 187 419,60
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