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Muscle Specific C. elegans Genome in health and disease: finding novel factors in 3D organization

Obiettivo

The loss of structural integrity in the interphase nucleus leads to tissue-specific pathologies in a set of human diseases collectively called laminopathies. These are late-onset, tissue-specific degenerative diseases, such as Emery Dreifuss Muscular Dystrophy (EDMD). While rare, these conditions provide insight into more common degenerative disorders linked to aging. A Caennorhabditis elegans mutant that recreates the EDMD phenotypes arises from introduction of a specific gain-of-function mutation into lamin (LMN-1 Y59C), which in turn affects the subnuclear distribution of muscle-specific promoters. This proposal plans to identify novel factors that establish and/or maintain the 3D organization of the genome in differentiated nuclei and to determine how this contributes to the differentiated muscle cell fate. I propose that compromised or altered sequestration of chromatin at the nuclear envelope alters cell-type specific promoter induction and in turn compromises the integrity of the tissue in question.
The specific aims of the project are 1) To identify factors that establish and/or maintain 3D genome organization in muscle nuclei. 2) To determine if the integrity of the perinuclear chromatin binding machinery helps maintain differentiated cell states. 3) To test inhibitors of epigenetic regulators for compounds that overcome the EDMD-like LMN-1 Y59C mutation. I will take two complementary approaches to determine how muscle specific chromatin organization maintains tissue integrity. I will use in vivo biochemical tagging in the LMN-1 Y59C mutant to identify perinuclear components that mediate sequestration of muscle-specific gene promoters. In parallel, a drug screen will find compounds that reverse the nuclear disorganization linked to the EDMD-like phenotype. The pathways identified will explain how lamin-induced mis-organization of the genome influences muscle integrity, a topic relevant for muscular dystrophies, sarcopenia, and other degenerative disease.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MSCA-IF-EF-ST - Standard EF

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2016

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

FRIEDRICH MIESCHER INSTITUTE FOR BIOMEDICAL RESEARCH FONDATION
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 187 419,60
Indirizzo
FABRIKSTRASSE 2
4056 BASEL
Svizzera

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Regione
Schweiz/Suisse/Svizzera Nordwestschweiz Basel-Stadt
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 187 419,60
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