Investigation of adaptive design and rewiring of Survival-Apoptosis-Mitogenic (SAM) signalling transduction network

Información del proyecto

SAMNets

Identificador del acuerdo de subvención: 750688

DOI

10.3030/750688

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 14 Marzo 2017

Fecha de inicio 1 Mayo 2017

Fecha de finalización 30 Abril 2019

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coste total

€ 187 866,00

Aportación de la UE

€ 187 866,00

Coordinado por

UNIVERSITY COLLEGE DUBLIN, NATIONAL UNIVERSITY OF IRELAND, DUBLIN
Ireland

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Publicaciones

Peer reviewed articles (6)

Mapping connections in signaling networks with ambiguous modularity

Autores: Daniel Lill, Oleksii S. Rukhlenko, Anthony James Mc Elwee, Eugene Kashdan, Jens Timmer, Boris N. Kholodenko
Publicado en: npj Systems Biology and Applications, Edición 5/1, 2019, ISSN 2056-7189
Editor: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41540-019-0096-1

Reconstructing static and dynamic models of signaling pathways using Modular Response Analysis

Autores: Tapesh Santra, Oleksii Rukhlenko, Vadim Zhernovkov, Boris N. Kholodenko
Publicado en: Current Opinion in Systems Biology, Edición 9, 2018, Página(s) 11-21, ISSN 2452-3100
Editor: Elsevier
DOI: 10.1016/j.coisb.2018.02.003

New insights into RAS biology reinvigorate interest in mathematical modeling of RAS signaling

Autores: Keesha E. Erickson, Oleksii S. Rukhlenko, Richard G. Posner, William S. Hlavacek, Boris N. Kholodenko
Publicado en: Seminars in Cancer Biology, Edición 54, 2019, Página(s) 162-173, ISSN 1044-579X
Editor: Academic Press
DOI: 10.1016/j.semcancer.2018.02.008

Dissecting RAF Inhibitor Resistance by Structure-based Modeling Reveals Ways to Overcome Oncogenic RAS Signaling

Autores: Oleksii S. Rukhlenko, Fahimeh Khorsand, Aleksandar Krstic, Jan Rozanc, Leonidas G. Alexopoulos, Nora Rauch, Keesha E. Erickson, William S. Hlavacek, Richard G. Posner, Silvia Gómez-Coca, Edina Rosta, Cheree Fitzgibbon, David Matallanas, Jens Rauch, Walter Kolch, Boris N. Kholodenko
Publicado en: Cell Systems, Edición 7/2, 2018, Página(s) 161-179.e14, ISSN 2405-4712
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cels.2018.06.002

Impact of measurement noise, experimental design, and estimation methods on Modular Response Analysis based network reconstruction

Autores: Caterina Thomaseth, Dirk Fey, Tapesh Santra, Oleksii S. Rukhlenko, Nicole E. Radde, Boris N. Kholodenko
Publicado en: Scientific Reports, Edición 8/1, 2018, ISSN 2045-2322
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-018-34353-3

Modeling cell line-specific recruitment of signaling proteins to the insulin-like growth factor 1 receptor

Autores: Keesha E. Erickson, Oleksii S. Rukhlenko, Md Shahinuzzaman, Kalina P. Slavkova, Yen Ting Lin, Ryan Suderman, Edward C. Stites, Marian Anghel, Richard G. Posner, Dipak Barua, Boris N. Kholodenko, William S. Hlavacek
Publicado en: PLOS Computational Biology, Edición 15/1, 2019, Página(s) e1006706, ISSN 1553-7358
Editor: Public Library of Science (United States)
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1006706

Derechos de propiedad intelectual

Patent (1)

Compositions and Uses Thereof

Número de solicitud/publicación: UK 1808321.2
Fecha: 2018-05-21
Solicitante(s): UNIVERSITY COLLEGE DUBLIN, NATIONAL UNIVERSITY OF IRELAND, DUBLIN