Mapping connections in signaling networks with ambiguous modularity
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Daniel Lill, Oleksii S. Rukhlenko, Anthony James Mc Elwee, Eugene Kashdan, Jens Timmer, Boris N. Kholodenko
Opublikowane w:
npj Systems Biology and Applications, Numer 5/1, 2019, ISSN 2056-7189
Wydawca:
Springer Nature
DOI:
10.1038/s41540-019-0096-1
Reconstructing static and dynamic models of signaling pathways using Modular Response Analysis
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Tapesh Santra, Oleksii Rukhlenko, Vadim Zhernovkov, Boris N. Kholodenko
Opublikowane w:
Current Opinion in Systems Biology, Numer 9, 2018, Strona(/y) 11-21, ISSN 2452-3100
Wydawca:
Elsevier
DOI:
10.1016/j.coisb.2018.02.003
New insights into RAS biology reinvigorate interest in mathematical modeling of RAS signaling
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Keesha E. Erickson, Oleksii S. Rukhlenko, Richard G. Posner, William S. Hlavacek, Boris N. Kholodenko
Opublikowane w:
Seminars in Cancer Biology, Numer 54, 2019, Strona(/y) 162-173, ISSN 1044-579X
Wydawca:
Academic Press
DOI:
10.1016/j.semcancer.2018.02.008
Dissecting RAF Inhibitor Resistance by Structure-based Modeling Reveals Ways to Overcome Oncogenic RAS Signaling
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Oleksii S. Rukhlenko, Fahimeh Khorsand, Aleksandar Krstic, Jan Rozanc, Leonidas G. Alexopoulos, Nora Rauch, Keesha E. Erickson, William S. Hlavacek, Richard G. Posner, Silvia Gómez-Coca, Edina Rosta, Cheree Fitzgibbon, David Matallanas, Jens Rauch, Walter Kolch, Boris N. Kholodenko
Opublikowane w:
Cell Systems, Numer 7/2, 2018, Strona(/y) 161-179.e14, ISSN 2405-4712
Wydawca:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.cels.2018.06.002
Impact of measurement noise, experimental design, and estimation methods on Modular Response Analysis based network reconstruction
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Caterina Thomaseth, Dirk Fey, Tapesh Santra, Oleksii S. Rukhlenko, Nicole E. Radde, Boris N. Kholodenko
Opublikowane w:
Scientific Reports, Numer 8/1, 2018, ISSN 2045-2322
Wydawca:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41598-018-34353-3
Modeling cell line-specific recruitment of signaling proteins to the insulin-like growth factor 1 receptor
(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
Autorzy:
Keesha E. Erickson, Oleksii S. Rukhlenko, Md Shahinuzzaman, Kalina P. Slavkova, Yen Ting Lin, Ryan Suderman, Edward C. Stites, Marian Anghel, Richard G. Posner, Dipak Barua, Boris N. Kholodenko, William S. Hlavacek
Opublikowane w:
PLOS Computational Biology, Numer 15/1, 2019, Strona(/y) e1006706, ISSN 1553-7358
Wydawca:
Public Library of Science (United States)
DOI:
10.1371/journal.pcbi.1006706
