Investigation of adaptive design and rewiring of Survival-Apoptosis-Mitogenic (SAM) signalling transduction network

Informacje na temat projektu

SAMNets

Identyfikator umowy o grant: 750688

DOI 10.3030/750688

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 14 Marca 2017

Data rozpoczęcia 1 Maja 2017

Data zakończenia 30 Kwietnia 2019

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Koszt całkowity € 187 866,00

Wkład UE € 187 866,00

Koordynowany przez

UNIVERSITY COLLEGE DUBLIN, NATIONAL UNIVERSITY OF IRELAND, DUBLIN
Ireland

Publikacje

Peer reviewed articles (6)

Mapping connections in signaling networks with ambiguous modularity

Autorzy: Daniel Lill, Oleksii S. Rukhlenko, Anthony James Mc Elwee, Eugene Kashdan, Jens Timmer, Boris N. Kholodenko
Opublikowane w: npj Systems Biology and Applications, Numer 5/1, 2019, ISSN 2056-7189
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41540-019-0096-1

Reconstructing static and dynamic models of signaling pathways using Modular Response Analysis

Autorzy: Tapesh Santra, Oleksii Rukhlenko, Vadim Zhernovkov, Boris N. Kholodenko
Opublikowane w: Current Opinion in Systems Biology, Numer 9, 2018, Strona(/y) 11-21, ISSN 2452-3100
Wydawca: Elsevier
DOI: 10.1016/j.coisb.2018.02.003

New insights into RAS biology reinvigorate interest in mathematical modeling of RAS signaling

Autorzy: Keesha E. Erickson, Oleksii S. Rukhlenko, Richard G. Posner, William S. Hlavacek, Boris N. Kholodenko
Opublikowane w: Seminars in Cancer Biology, Numer 54, 2019, Strona(/y) 162-173, ISSN 1044-579X
Wydawca: Academic Press
DOI: 10.1016/j.semcancer.2018.02.008

Dissecting RAF Inhibitor Resistance by Structure-based Modeling Reveals Ways to Overcome Oncogenic RAS Signaling

Autorzy: Oleksii S. Rukhlenko, Fahimeh Khorsand, Aleksandar Krstic, Jan Rozanc, Leonidas G. Alexopoulos, Nora Rauch, Keesha E. Erickson, William S. Hlavacek, Richard G. Posner, Silvia Gómez-Coca, Edina Rosta, Cheree Fitzgibbon, David Matallanas, Jens Rauch, Walter Kolch, Boris N. Kholodenko
Opublikowane w: Cell Systems, Numer 7/2, 2018, Strona(/y) 161-179.e14, ISSN 2405-4712
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cels.2018.06.002

Impact of measurement noise, experimental design, and estimation methods on Modular Response Analysis based network reconstruction

Autorzy: Caterina Thomaseth, Dirk Fey, Tapesh Santra, Oleksii S. Rukhlenko, Nicole E. Radde, Boris N. Kholodenko
Opublikowane w: Scientific Reports, Numer 8/1, 2018, ISSN 2045-2322
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-018-34353-3

Modeling cell line-specific recruitment of signaling proteins to the insulin-like growth factor 1 receptor

Autorzy: Keesha E. Erickson, Oleksii S. Rukhlenko, Md Shahinuzzaman, Kalina P. Slavkova, Yen Ting Lin, Ryan Suderman, Edward C. Stites, Marian Anghel, Richard G. Posner, Dipak Barua, Boris N. Kholodenko, William S. Hlavacek
Opublikowane w: PLOS Computational Biology, Numer 15/1, 2019, Strona(/y) e1006706, ISSN 1553-7358
Wydawca: Public Library of Science (United States)
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1006706

Prawa własności intelektualnej

Patent (1)

Compositions and Uses Thereof

Numer wniosku/publikacji: UK 1808321.2
Data: 2018-05-21
Wnioskodawca/wnioskodawcy: UNIVERSITY COLLEGE DUBLIN, NATIONAL UNIVERSITY OF IRELAND, DUBLIN