Investigation of adaptive design and rewiring of Survival-Apoptosis-Mitogenic (SAM) signalling transduction network

Informazioni relative al progetto

SAMNets

ID dell’accordo di sovvenzione: 750688

DOI 10.3030/750688

Progetto chiuso

Data della firma CE 14 Marzo 2017

Data di avvio 1 Maggio 2017

Data di completamento 30 Aprile 2019

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Costo totale € 187 866,00

Contributo UE € 187 866,00

Coordinato da

UNIVERSITY COLLEGE DUBLIN, NATIONAL UNIVERSITY OF IRELAND, DUBLIN
Ireland

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (6)

Mapping connections in signaling networks with ambiguous modularity

Autori: Daniel Lill, Oleksii S. Rukhlenko, Anthony James Mc Elwee, Eugene Kashdan, Jens Timmer, Boris N. Kholodenko
Pubblicato in: npj Systems Biology and Applications, Numero 5/1, 2019, ISSN 2056-7189
Editore: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41540-019-0096-1

Reconstructing static and dynamic models of signaling pathways using Modular Response Analysis

Autori: Tapesh Santra, Oleksii Rukhlenko, Vadim Zhernovkov, Boris N. Kholodenko
Pubblicato in: Current Opinion in Systems Biology, Numero 9, 2018, Pagina/e 11-21, ISSN 2452-3100
Editore: Elsevier
DOI: 10.1016/j.coisb.2018.02.003

New insights into RAS biology reinvigorate interest in mathematical modeling of RAS signaling

Autori: Keesha E. Erickson, Oleksii S. Rukhlenko, Richard G. Posner, William S. Hlavacek, Boris N. Kholodenko
Pubblicato in: Seminars in Cancer Biology, Numero 54, 2019, Pagina/e 162-173, ISSN 1044-579X
Editore: Academic Press
DOI: 10.1016/j.semcancer.2018.02.008

Dissecting RAF Inhibitor Resistance by Structure-based Modeling Reveals Ways to Overcome Oncogenic RAS Signaling

Autori: Oleksii S. Rukhlenko, Fahimeh Khorsand, Aleksandar Krstic, Jan Rozanc, Leonidas G. Alexopoulos, Nora Rauch, Keesha E. Erickson, William S. Hlavacek, Richard G. Posner, Silvia Gómez-Coca, Edina Rosta, Cheree Fitzgibbon, David Matallanas, Jens Rauch, Walter Kolch, Boris N. Kholodenko
Pubblicato in: Cell Systems, Numero 7/2, 2018, Pagina/e 161-179.e14, ISSN 2405-4712
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cels.2018.06.002

Impact of measurement noise, experimental design, and estimation methods on Modular Response Analysis based network reconstruction

Autori: Caterina Thomaseth, Dirk Fey, Tapesh Santra, Oleksii S. Rukhlenko, Nicole E. Radde, Boris N. Kholodenko
Pubblicato in: Scientific Reports, Numero 8/1, 2018, ISSN 2045-2322
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-018-34353-3

Modeling cell line-specific recruitment of signaling proteins to the insulin-like growth factor 1 receptor

Autori: Keesha E. Erickson, Oleksii S. Rukhlenko, Md Shahinuzzaman, Kalina P. Slavkova, Yen Ting Lin, Ryan Suderman, Edward C. Stites, Marian Anghel, Richard G. Posner, Dipak Barua, Boris N. Kholodenko, William S. Hlavacek
Pubblicato in: PLOS Computational Biology, Numero 15/1, 2019, Pagina/e e1006706, ISSN 1553-7358
Editore: Public Library of Science (United States)
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1006706

Diritti di proprietà intellettuale

Patent (1)

Compositions and Uses Thereof

Numero candidatura/pubblicazione: UK 1808321.2
Data: 2018-05-21