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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Development of novel computational biology pipeline for the efficient classification of titin SNPs for clinical use

Ziel

Mutations in the giant muscle protein titin are a major cause of heart disorders in human populations. Routine DNA screening of patient cohorts is now becoming feasible, with a staggering number of titin truncations and missense single nucleotide polymorphisms (mSNPs) rapidly accumulating in genomics databases (>17,000 mSNPs). While the link between titin truncation and disease is now becoming clarified, detecting the pathogenic potential of mSNPs remains a substantial challenge. In mSNPs classification, bioinformatics evaluation is a necessary first filtering step, but existing predictors are poorly reliable. To address this problem, we aim to develop a new titin-centric scoring function that predicts the mechanistic effect of an mSNP exchange in the titin protein by considering the specific characteristics of its poly-domain chain. For this work, we will build a medium-throughput molecular diagnostic pipeline that harvest existent structural models of titin components in estimating mSNPs-induced changes in free energy and conformational dynamics in the protein. Calculations will be benchmarked against experimentally obtained biophysical and biochemical data. To develop this methodology, we will use a clinically pertinent training set of 75 mSNPs. However, in a subsequent step, stable predictions will be extrapolated to the rest of the titin chain by exploiting the repetition of structural and functional loci within the chain. A titin map of vulnerability “hot-spots” so calculated will be distributed to the research community. Ultimately, we aim to produce a tool that can aid clinicians to identify patients at risk of developing a titin-based heart condition at early disease stages, where intervention is still possible.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

MSCA-IF-EF-ST - Standard EF

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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) H2020-MSCA-IF-2016

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

UNIVERSITAT KONSTANZ
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 171 460,80
Adresse
UNIVERSITATSSTRASSE 10
78464 Konstanz
Deutschland

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Region
Baden-Württemberg Freiburg Konstanz
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

€ 171 460,80
Mein Booklet 0 0