Gene expression level as a keystone to understanding gene duplication: evolutionary constraints, opportunities, and disease

Información del proyecto

DOUBLE EXPRESS

Identificador del acuerdo de subvención: 771419

DOI

10.3030/771419

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 15 Mayo 2018

Fecha de inicio 1 Enero 2019

Fecha de finalización 31 Diciembre 2024

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 1 824 793,75

Aportación de la UE

€ 1 824 793,75

Coordinado por

THE PROVOST, FELLOWS, FOUNDATION SCHOLARS & THE OTHER MEMBERS OF BOARD, OF THE COLLEGE OF THE HOLY & UNDIVIDED TRINITY OF QUEEN ELIZABETH NEAR DUBLIN
Ireland

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Publicaciones

Peer reviewed articles (9)

Independent rediploidization masks shared whole genome duplication in the sturgeon-paddlefish ancestor

Autores: Anthony K. Redmond, Dearbhaile Casey, Manu Kumar Gundappa, Daniel J. Macqueen, Aoife McLysaght
Publicado en: Nature Communications, Edición 14, 2023, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-38714-z

Reply to: Available data do not rule out Ctenophora as the sister group to all other Metazoa

Autores: Anthony K. Redmond, Aoife McLysaght
Publicado en: Nature Communications, Edición 14, 2023, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-36152-5

Evidence from Drosophila Supports Higher Duplicability of Faster Evolving Genes

Autores: Zoe Vance, Lukasz Niezabitowski, Laurence D Hurst, Aoife McLysaght
Publicado en: Genome Biology and Evolution, Edición 1, 2022, ISSN 1759-6653
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gbe/evac003

Reconstruction of proto-vertebrate, proto-cyclostome and proto-gnathostome genomes provides new insights into early vertebrate evolution

Autores: Yoichiro Nakatani, Prashant Shingate, Vydianathan Ravi, Nisha E. Pillai, Aravind Prasad, Aoife McLysaght, Byrappa Venkatesh
Publicado en: Nature Communications, Edición 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24573-z

Synteny-based analyses indicate that sequence divergence is not the main source of orphan genes

Autores: Nikolaos Vakirlis, Anne-Ruxandra Carvunis, Aoife McLysaght
Publicado en: eLife, Edición 9, 2020, ISSN 2050-084X
Editor: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.53500

Evidence for sponges as sister to all other animals from partitioned phylogenomics with mixture models and recoding

Autores: Anthony K. Redmond, Aoife McLysaght
Publicado en: Nature Communications, Edición 12/1, 2021, Página(s) 1-14, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-22074-7

De novo emergence of adaptive membrane proteins from thymine-rich genomic sequences

Autores: Nikolaos Vakirlis, Omer Acar, Brian Hsu, Nelson Castilho Coelho, S. Branden Van Oss, Aaron Wacholder, Kate Medetgul-Ernar, Ray W. Bowman, Cameron P. Hines, John Iannotta, Saurin Bipin Parikh, Aoife McLysaght, Carlos J. Camacho, Allyson F. O’Donnell, Trey Ideker, Anne-Ruxandra Carvunis
Publicado en: Nature Communications, Edición 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-14500-z

De novo birth of functional microproteins in the human lineage

Autores: Nikolaos Vakirlis, Zoe Vance, Kate M. Duggan, Aoife McLysaght
Publicado en: Cell Reports, Edición 41, 2022, Página(s) 111808, ISSN 2211-1247
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2022.111808

Horizontal transfer of vertebrate vision gene <i>IRBP</i> into the chordate ancestor

Autores: Anthony K. Redmond, Aoife McLysaght
Publicado en: Proceedings of the National Academy of Sciences, Edición 120, 2023, ISSN 0027-8424
Editor: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2310390120

Other (1)

Evidence for increased stress resistance due to polyploidy from synthetic autotetraploid<i>Caenorhabditis elegans</i>

Autores: Laetitia Chauve, Emma Bazzani, Clément Verdier, Liam Butler, Martha E. Atimise, Aoibhín McGarry, Aoife McLysaght
Publicado en: BioRXiV, 2025
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2023.06.28.546823