Gene expression level as a keystone to understanding gene duplication: evolutionary constraints, opportunities, and disease

Informations projet

DOUBLE EXPRESS

N° de convention de subvention: 771419

DOI

10.3030/771419

Projet clôturé

Date de signature de la CE 15 Mai 2018

Date de début 1 Janvier 2019

Date de fin 31 Decembre 2024

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 824 793,75

Contribution de l’UE

€ 1 824 793,75

Coordonné par

THE PROVOST, FELLOWS, FOUNDATION SCHOLARS & THE OTHER MEMBERS OF BOARD, OF THE COLLEGE OF THE HOLY & UNDIVIDED TRINITY OF QUEEN ELIZABETH NEAR DUBLIN
Ireland

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Peer reviewed articles (9)

Independent rediploidization masks shared whole genome duplication in the sturgeon-paddlefish ancestor

Auteurs: Anthony K. Redmond, Dearbhaile Casey, Manu Kumar Gundappa, Daniel J. Macqueen, Aoife McLysaght
Publié dans: Nature Communications, Numéro 14, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-38714-z

Reply to: Available data do not rule out Ctenophora as the sister group to all other Metazoa

Auteurs: Anthony K. Redmond, Aoife McLysaght
Publié dans: Nature Communications, Numéro 14, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-36152-5

Evidence from Drosophila Supports Higher Duplicability of Faster Evolving Genes

Auteurs: Zoe Vance, Lukasz Niezabitowski, Laurence D Hurst, Aoife McLysaght
Publié dans: Genome Biology and Evolution, Numéro 1, 2022, ISSN 1759-6653
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gbe/evac003

Reconstruction of proto-vertebrate, proto-cyclostome and proto-gnathostome genomes provides new insights into early vertebrate evolution

Auteurs: Yoichiro Nakatani, Prashant Shingate, Vydianathan Ravi, Nisha E. Pillai, Aravind Prasad, Aoife McLysaght, Byrappa Venkatesh
Publié dans: Nature Communications, Numéro 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24573-z

Synteny-based analyses indicate that sequence divergence is not the main source of orphan genes

Auteurs: Nikolaos Vakirlis, Anne-Ruxandra Carvunis, Aoife McLysaght
Publié dans: eLife, Numéro 9, 2020, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.53500

Evidence for sponges as sister to all other animals from partitioned phylogenomics with mixture models and recoding

Auteurs: Anthony K. Redmond, Aoife McLysaght
Publié dans: Nature Communications, Numéro 12/1, 2021, Page(s) 1-14, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-22074-7

De novo emergence of adaptive membrane proteins from thymine-rich genomic sequences

Auteurs: Nikolaos Vakirlis, Omer Acar, Brian Hsu, Nelson Castilho Coelho, S. Branden Van Oss, Aaron Wacholder, Kate Medetgul-Ernar, Ray W. Bowman, Cameron P. Hines, John Iannotta, Saurin Bipin Parikh, Aoife McLysaght, Carlos J. Camacho, Allyson F. O’Donnell, Trey Ideker, Anne-Ruxandra Carvunis
Publié dans: Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-14500-z

De novo birth of functional microproteins in the human lineage

Auteurs: Nikolaos Vakirlis, Zoe Vance, Kate M. Duggan, Aoife McLysaght
Publié dans: Cell Reports, Numéro 41, 2022, Page(s) 111808, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2022.111808

Horizontal transfer of vertebrate vision gene <i>IRBP</i> into the chordate ancestor

Auteurs: Anthony K. Redmond, Aoife McLysaght
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 120, 2023, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2310390120

Other (1)

Evidence for increased stress resistance due to polyploidy from synthetic autotetraploid<i>Caenorhabditis elegans</i>

Auteurs: Laetitia Chauve, Emma Bazzani, Clément Verdier, Liam Butler, Martha E. Atimise, Aoibhín McGarry, Aoife McLysaght
Publié dans: BioRXiV, 2025
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2023.06.28.546823