Gene expression level as a keystone to understanding gene duplication: evolutionary constraints, opportunities, and disease

Projektinformationen

DOUBLE EXPRESS

ID Finanzhilfevereinbarung: 771419

DOI

10.3030/771419

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 15 Mai 2018

Startdatum 1 Januar 2019

Enddatum 31 Dezember 2024

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 824 793,75

EU-Beitrag

€ 1 824 793,75

Koordiniert durch

THE PROVOST, FELLOWS, FOUNDATION SCHOLARS & THE OTHER MEMBERS OF BOARD, OF THE COLLEGE OF THE HOLY & UNDIVIDED TRINITY OF QUEEN ELIZABETH NEAR DUBLIN
Ireland

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (9)

Independent rediploidization masks shared whole genome duplication in the sturgeon-paddlefish ancestor

Autoren: Anthony K. Redmond, Dearbhaile Casey, Manu Kumar Gundappa, Daniel J. Macqueen, Aoife McLysaght
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 14, 2023, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-38714-z

Reply to: Available data do not rule out Ctenophora as the sister group to all other Metazoa

Autoren: Anthony K. Redmond, Aoife McLysaght
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 14, 2023, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-36152-5

Evidence from Drosophila Supports Higher Duplicability of Faster Evolving Genes

Autoren: Zoe Vance, Lukasz Niezabitowski, Laurence D Hurst, Aoife McLysaght
Veröffentlicht in: Genome Biology and Evolution, Ausgabe 1, 2022, ISSN 1759-6653
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gbe/evac003

Reconstruction of proto-vertebrate, proto-cyclostome and proto-gnathostome genomes provides new insights into early vertebrate evolution

Autoren: Yoichiro Nakatani, Prashant Shingate, Vydianathan Ravi, Nisha E. Pillai, Aravind Prasad, Aoife McLysaght, Byrappa Venkatesh
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24573-z

Synteny-based analyses indicate that sequence divergence is not the main source of orphan genes

Autoren: Nikolaos Vakirlis, Anne-Ruxandra Carvunis, Aoife McLysaght
Veröffentlicht in: eLife, Ausgabe 9, 2020, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.53500

Evidence for sponges as sister to all other animals from partitioned phylogenomics with mixture models and recoding

Autoren: Anthony K. Redmond, Aoife McLysaght
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 12/1, 2021, Seite(n) 1-14, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-22074-7

De novo emergence of adaptive membrane proteins from thymine-rich genomic sequences

Autoren: Nikolaos Vakirlis, Omer Acar, Brian Hsu, Nelson Castilho Coelho, S. Branden Van Oss, Aaron Wacholder, Kate Medetgul-Ernar, Ray W. Bowman, Cameron P. Hines, John Iannotta, Saurin Bipin Parikh, Aoife McLysaght, Carlos J. Camacho, Allyson F. O’Donnell, Trey Ideker, Anne-Ruxandra Carvunis
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-14500-z

De novo birth of functional microproteins in the human lineage

Autoren: Nikolaos Vakirlis, Zoe Vance, Kate M. Duggan, Aoife McLysaght
Veröffentlicht in: Cell Reports, Ausgabe 41, 2022, Seite(n) 111808, ISSN 2211-1247
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2022.111808

Horizontal transfer of vertebrate vision gene <i>IRBP</i> into the chordate ancestor

Autoren: Anthony K. Redmond, Aoife McLysaght
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 120, 2023, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2310390120

Other (1)

Evidence for increased stress resistance due to polyploidy from synthetic autotetraploid<i>Caenorhabditis elegans</i>

Autoren: Laetitia Chauve, Emma Bazzani, Clément Verdier, Liam Butler, Martha E. Atimise, Aoibhín McGarry, Aoife McLysaght
Veröffentlicht in: BioRXiV, 2025
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2023.06.28.546823