Ziel
Within clonal bacterial populations not all cells exhibit the same phenotype, even though they grow in the same environment. The molecular sources contributing to phenotypic variation are diverse and can originate from noise in gene expression to heterogeneity in growth rates or cell cycle state. Phenotypic variation helps pathogenic bacteria to elude the host immune response or resist antibiotic pressure. Vice versa, there is cell-to-cell variability in the host’s response towards pathogens that can be exploited by bacteria. How the combined cellular heterogeneity of both host and microbe contribute to infection outcome is poorly understood. The role of phenotypic variation on antibiotic resistance development is also unclear.
Recently, we developed novel single cell imaging systems as well as genetic engineering and screening platforms for application to the important opportunistic human pathogen Streptococcus pneumoniae. In addition, we generated a dual-transcriptomics overview of pneumococcal infection of human lung epithelial cells and setup collaborations to perform several infection models. This now places us in an excellent position to investigate the mechanisms and the importance of single cell behaviour for pneumococcal virulence and antibiotic resistance.
The driving hypothesis of this application is that the combined heterogeneity of host cells and pneumococci influences infection and antibiotic therapy outcome. To test this, we will use innovative approaches for infection biology by combining synthetic biology and quantitative single cell biology including single cell RNA-seq, CRISPRi, engineered bistable switches and microfluidics. We will reveal the molecular mechanisms underlying cell-to-cell variability and its importance in virulence and antibiotic resistance.
Insights obtained in this project will lead to a better understanding of phenotypic variation and might result in new treatment strategies for pneumococcal infections.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
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ERC-COG - Consolidator Grant
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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(öffnet in neuem Fenster) ERC-2017-COG
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1015 LAUSANNE
Schweiz
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