The role of cell-to-cell variability in pneumococcal virulence and antibiotic resistance

Projektinformationen

PneumoCaTChER

ID Finanzhilfevereinbarung: 771534

DOI 10.3030/771534

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 13 April 2018

Startdatum 1 November 2018

Enddatum 31 Oktober 2023

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten € 1 999 735,00

EU-Beitrag € 1 999 735,00

Koordiniert durch

UNIVERSITE DE LAUSANNE
Switzerland

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (17)

Amoxicillin-resistant Streptococcus pneumoniae can be resensitized by targeting the mevalonate pathway as indicated by sCRilecs-seq

Autoren: Liselot Dewachter, Julien Dénéréaz, Xue Liu, Vincent de Bakker, Charlotte Costa, Mara Baldry, Jean-Claude Sirard, Jan-Willem Veening
Veröffentlicht in: eLife, 2022, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.75607

Harnessing CRISPR-Cas9 for Genome Editing in Streptococcus pneumoniae D39V

Autoren: Dimitra Synefiaridou, Jan-Willem Veening
Veröffentlicht in: Applied and Environmental Microbiology, Ausgabe 87/6, 2021, ISSN 0099-2240
Herausgeber: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/aem.02762-20

CcrZ is a pneumococcal spatiotemporal cell cycle regulator that interacts with FtsZ and controls DNA replication by modulating the activity of DnaA

Autoren: Clement Gallay, Stefano Sanselicio, Mary E. Anderson, Young Min Soh, Xue Liu, Gro A. Stamsås, Simone Pelliciari, Renske van Raaphorst, Julien Dénéréaz, Morten Kjos, Heath Murray, Stephan Gruber, Alan D. Grossman, Jan-Willem Veening
Veröffentlicht in: Nature Microbiology, Ausgabe 6/9, 2021, Seite(n) 1175-1187, ISSN 2058-5276
Herausgeber: NPG
DOI: 10.1038/s41564-021-00949-1

Switching off: The phenotypic transition to the uninduced state of the lactose uptake pathway

Autoren: Prasanna M Bhogale, Robin A Sorg, Jan-Willem Veening, Johannes Berg
Veröffentlicht in: Biophys J ., 2022, ISSN 0006-3495
Herausgeber: Biophysical Society
DOI: 10.1016/j.bpj.2021.12.027

Exploration of Bacterial Bottlenecks and Streptococcus pneumoniae Pathogenesis by CRISPRi-Seq

Autoren: Xue Liu, Jacqueline M Kimmey, Laura Matarazzo, Vincent de Bakker, Laurye Van Maele, Jean-Claude Sirard, Victor Nizet, Jan-Willem Veening
Veröffentlicht in: Cell Host & Microbe, 2021, ISSN 1931-3128
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2020.10.001

The acquisition of clinically relevant amoxicillin resistance in Streptococcus pneumoniae requires ordered horizontal gene transfer of four loci

Autoren: Paddy S Gibson, Evan Bexkens, Sylvia Zuber, Lauren A Cowley , Jan-Willem Veening
Veröffentlicht in: Plos Pathogens, 2022, ISSN 1553-7366
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.ppat.1010727

2FAST2Q: a general-purpose sequence search and counting program for FASTQ files

Autoren: Afonso M Bravo, Athanasios Typas, Jan-Willem Veening
Veröffentlicht in: PeerJ, 2022, ISSN 2167-8359
Herausgeber: PeerJ
DOI: 10.7717/peerj.14041

Unbiased homeologous recombination during pneumococcal transformation allows for multiple chromosomal integration events

Autoren: Jun Kurushima, Nathalie Campo, Renske van Raaphorst, Guillaume Cerckel, Patrice Polard, Jan-Willem Veening
Veröffentlicht in: eLife, Ausgabe 9, 2020, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.58771

Mechanistic basis of choline import involved in teichoic acids and lipopolysaccharide modification

Autoren: Natalie Bärland, Anne-Stéphanie Rueff, Gonzalo Cebrero, Cedric A J Hutter, Markus A Seeger, Jan-Willem Veening, Camilo Perez
Veröffentlicht in: Science Advances, 2022, ISSN 2375-2548
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.abm1122

RocS drives chromosome segregation and nucleoid protection in Streptococcus pneumoniae

Autoren: Chryslène Mercy, Adrien Ducret, Jelle Slager, Jean-Pierre Lavergne, Céline Freton, Sathya Narayanan Nagarajan, Pierre Simon Garcia, Marie-Francoise Noirot-Gros, Nelly Dubarry, Julien Nourikyan, Jan-Willem Veening, Christophe Grangeasse
Veröffentlicht in: Nature Microbiology, 2019, ISSN 2058-5276
Herausgeber: Nature
DOI: 10.1038/s41564-019-0472-z

Three New Integration Vectors and Fluorescent Proteins for Use in the Opportunistic Human Pathogen Streptococcus pneumoniae

Autoren: Lance E. Keller, Anne-Stéphanie Rueff, Jun Kurushima, Jan-Willem Veening
Veröffentlicht in: Genes, Ausgabe 10/5, 2019, Seite(n) 394, ISSN 2073-4425
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/genes10050394

Refining the Pneumococcal Competence Regulon by RNA Sequencing

Autoren: Jelle Slager, Rieza Aprianto, Jan-Willem Veening
Veröffentlicht in: Journal of Bacteriology, Ausgabe 201/13, 2019, ISSN 0021-9193
Herausgeber: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/jb.00780-18

BactMAP: An R package for integrating, analyzing and visualizing bacterial microscopy data

Autoren: Renske Raaphorst, Morten Kjos, Jan‐Willem Veening
Veröffentlicht in: Molecular Microbiology, Ausgabe 113/1, 2019, Seite(n) 297-308, ISSN 0950-382X
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/mmi.14417

Structure of a proton-dependent lipid transporter involved in lipoteichoic acids biosynthesis

Autoren: Bing Zhang, Xue Liu, Elisabeth Lambert, Guillaume Mas, Sebastian Hiller, Jan-Willem Veening, Camilo Perez
Veröffentlicht in: Nature Structural & Molecular Biology, 2020, ISSN 1545-9993
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-020-0425-5

Gaps in the wall: understanding cell wall biology to tackle amoxicillin resistance in Streptococcus pneumoniae

Autoren: Paddy S Gibson, Jan-Willem Veening
Veröffentlicht in: Curr Opin Microbiol., 2023, ISSN 1369-5274
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.mib.2022.102261

Synthetic genetic oscillators demonstrate the functional importance of phenotypic variation in pneumococcal-host interactions

Autoren: Anne-Stéphanie Rueff, Renske van Raaphorst, Surya D Aggarwal, Javier Santos-Moreno, Géraldine Laloux, Yolanda Schaerli, Jeffrey N Weiser, Jan-Willem Veening
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 14(1):7454, 2023, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-43241-y

Competence remodels the pneumococcal cell wall exposing key surface virulence factors that mediate increased host adherence

Autoren: Vikrant Minhas, Arnau Domenech, Dimitra Synefiaridou, Daniel Straume, Max Brendel, Gonzalo Cebrero, Xue Liu, Charlotte Costa, Mara Baldry, Jean-Claude Sirard, Camilo Perez, Nicolas Gisch, Sven Hammerschmidt, Leiv Sigve Håvarstein, Jan-Willem Veening
Veröffentlicht in: Plos Biology, 2023, ISSN 1544-9173
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.3001990