Computationally Active DNA Nanostructures

Projektinformationen

Active-DNA

ID Finanzhilfevereinbarung: 772766

DOI

10.3030/772766

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 2 Oktober 2018

Startdatum 1 November 2018

Enddatum 31 Oktober 2024

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 2 349 603,00

EU-Beitrag

€ 2 349 603,00

Koordiniert durch

NATIONAL UNIVERSITY OF IRELAND MAYNOOTH
Ireland

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Leistungen

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

Open Research Data Pilot

Veröffentlichungen

Book chapters (4)

The Collatz Process Embeds a Base Conversion Algorithm

Autoren: Tristan Stérin, Damien Woods
Veröffentlicht in: Reachability Problems - 14th International Conference, RP 2020, Paris, France, October 19–21, 2020, Proceedings, Ausgabe 12448, 2020, Seite(n) 131-147, ISBN 978-3-030-61738-7
Herausgeber: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-030-61739-4_9

Hardness of Busy Beaver Value BB(15)

Autoren: Tristan Stérin, Damien Woods
Veröffentlicht in: Lecture Notes in Computer Science, Reachability Problems, Ausgabe 15050, 2024, Seite(n) 120-137, ISBN 978-3-031-72620-0
Herausgeber: Springer Nature Switzerland
DOI: 10.1007/978-3-031-72621-7_9

Binary Expression of Ancestors in the Collatz Graph

Autoren: Tristan Stérin
Veröffentlicht in: Reachability Problems - 14th International Conference, RP 2020, Paris, France, October 19–21, 2020, Proceedings, Ausgabe 12448, 2020, Seite(n) 115-130, ISBN 978-3-030-61738-7
Herausgeber: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-030-61739-4_8

Non-cooperatively Assembling Large Structures

Autoren: Pierre-Étienne Meunier, Damien Regnault
Veröffentlicht in: DNA Computing and Molecular Programming - 25th International Conference, DNA 25, Seattle, WA, USA, August 5–9, 2019, Proceedings, Ausgabe 11648, 2019, Seite(n) 120-139, ISBN 978-3-030-26806-0
Herausgeber: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-030-26807-7_7

Thesis and dissertations (1)

Six Tiles: From Collatz Sequences to Algorithmic DNA Origami

Autoren: Tristan Stérin
Veröffentlicht in: PhD thesis, 2023
Herausgeber: Maynooth University

Conference proceedings (5)

Turning Machines

Autoren: Irina Kostitsyna, Cai Wood, Damien Woods
Veröffentlicht in: 26th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming (DNA 26), Ausgabe 174, 2020, Seite(n) 1--21
Herausgeber: Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs)
DOI: 10.4230/lipics.dna.2020.11

Small tile sets that compute while solving mazes

Autoren: Matthew Cook, Tristan Stérin, Damien Woods
Veröffentlicht in: 27th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming (DNA27), Ausgabe 205, 2021, Seite(n) 8:1--8:20
Herausgeber: LIPICS
DOI: 10.4230/lipics.dna.27.8

The program-size complexity of self-assembled paths

Autoren: Pierre-Étienne Meunier, Damien Regnault, Damien Woods
Veröffentlicht in: Proceedings of the 52nd Annual ACM SIGACT Symposium on Theory of Computing, Ausgabe Yearly, 2020, Seite(n) 727-737, ISBN 9781-450369794
Herausgeber: ACM
DOI: 10.1145/3357713.3384263

Minimum Free Energy, Partition Function and Kinetics Simulation Algorithms for a Multistranded Scaffolded DNA Computer

Autoren: Ahmed Shalaby, Chris Thachuk, Damien Woods
Veröffentlicht in: 29th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming (DNA 29), Ausgabe 276, 2023, Seite(n) 1:1--1:22, ISBN 978-3-95977-297-6
Herausgeber: Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs)
DOI: 10.4230/lipics.dna.29.1

scadnano: A Browser-Based, Scriptable Tool for Designing DNA Nanostructures

Autoren: David Doty, Benjamin L Lee, Tristan Stérin
Veröffentlicht in: 26th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming (DNA 26), Ausgabe 174, 2020, Seite(n) 9:1--9:17, ISBN 978-3-95977-163-4
Herausgeber: Schloss Dagstuhl--Leibniz-Zentrum für Informatik
DOI: 10.4230/lipics.dna.2020.9

Peer reviewed articles (2)

Pattern recognition in the nucleation kinetics of non-equilibrium self-assembly

Autoren: Constantine Glen Evans, Jackson O’Brien, Erik Winfree, Arvind Murugan
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 625, 2024, Seite(n) 500-507, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-023-06890-z

Turning machines: a simple algorithmic model for molecular robotics

Autoren: Irina Kostitsyna, Cai Wood, Damien Woods
Veröffentlicht in: Natural Computing, Ausgabe Open Access published on 22/2/22, 2022, ISSN 1572-9796
Herausgeber: Springer
DOI: 10.1007/s11047-022-09880-8