A Google Earth Approach to Understanding Collagen Mineralization

Projektinformationen

COLMIN

ID Finanzhilfevereinbarung: 788982

DOI

10.3030/788982

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 24 Mai 2018

Startdatum 1 Januar 2019

Enddatum 30 April 2025

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 3 498 006,25

EU-Beitrag

€ 3 498 006,00

Koordiniert durch

STICHTING RADBOUD UNIVERSITAIR MEDISCH CENTRUM
Netherlands

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Veröffentlichungen

Thesis and dissertations (1)

Unravelling the Role of Glycosylation on the Mineralization of Collagen Type I - Model Systems and Advanced Transmission Electron Microscopy

Autoren: Rutten, L.J.
Veröffentlicht in: Ausgabe 1, 2024, ISBN 978-94-6473-655-6
Herausgeber: Luco Rutten

Peer reviewed articles (17)

A Cryo‐to‐Liquid Phase Correlative Light Electron Microscopy Workflow for the Visualization of Biological Processes in Graphene Liquid Cells

Autoren: Luco Rutten, Ben Joosten, Judith Schaart, Marit de Beer, Rona Roverts, Steffen Gräber, Willi Jahnen‐Dechent, Anat Akiva, Elena Macías‐Sánchez, Nico Sommerdijk
Veröffentlicht in: Advanced Functional Materials, Ausgabe 35, 2025, ISSN 1616-301X
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/adfm.202416938

Involvement of ceramide biosynthesis in increased extracellular vesicle release in Pkd1 knock out cells

Autoren: Valentina Carotti, Jenny van der Wijst, Eric H. J. Verschuren, Luco Rutten, Nico Sommerdijk, Charlotte Kaffa, Vera Sommers, Juan P. Rigalli, Joost G. J. Hoenderop
Veröffentlicht in: Frontiers in Endocrinology, Ausgabe 13, 2022, ISSN 1664-2392
Herausgeber: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/fendo.2022.1005639

Bioinspired Silk Fibroin Mineralization for Advanced In Vitro Bone Remodeling Models

Autoren: Bregje W. M. de Wildt,Robin van der Meijden,Paul A. A. Bartels,Nico A. J. M. Sommerdijk,Anat Akiva,Keita Ito,Sandra Hofmann
Veröffentlicht in: ADVANCED FUNCTIONAL MATERIALS, Ausgabe 1616301X, 2022, ISSN 1616-301X
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/adfm.202206992

On the role of the glycosylation of type I collagen in bone

Autoren: Luco Rutten, Elena Macías-Sánchez, Nico Sommerdijk
Veröffentlicht in: Journal of Structural Biology, Ausgabe 216, 2025, Seite(n) 108145, ISSN 1047-8477
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jsb.2024.108145

Precise targeting for 3D cryo-correlative light and electron microscopy volume imaging of tissues using a FinderTOP

Autoren: Marit de Beer, Deniz Daviran, Rona Roverts, Luco Rutten, Elena Macías-Sánchez, Juriaan R. Metz, Nico Sommerdijk, Anat Akiva
Veröffentlicht in: Communications Biology, Ausgabe 6, 2023, ISSN 2399-3642
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s42003-023-04887-y

Comparative 3D ultrastructure of Plasmodium falciparum gametocytes

Autoren: Felix Evers, Rona Roverts, Cas Boshoven, Mariska Kea-te Lindert, Julie M. J. Verhoef, Nico Sommerdijk, Robert E. Sinden, Anat Akiva, Taco W. A. Kooij
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 16, 2025, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-55413-5

Cell-induced collagen alignment in a 3D in vitro culture during extracellular matrix production

Autoren: Judith M. Schaart, Mariska Kea-te Lindert, Rona Roverts, Wouter H. Nijhuis, Nico Sommerdijk, Anat Akiva
Veröffentlicht in: Journal of Structural Biology, Ausgabe 216, 2024, Seite(n) 108096, ISSN 1047-8477
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jsb.2024.108096

Intermolecular channels direct crystal orientation in mineralized collagen

Autoren: YiFei Xu, Fabio Nudelman, E. Deniz Eren, Maarten J. M. Wirix, Bram Cantaert, Wouter H. Nijhuis, Daniel Hermida-Merino, Giuseppe Portale, Paul H. H. Bomans, Christian Ottmann, Heiner Friedrich, Wim Bras, Anat Akiva, Joseph P. R. O. Orgel, Fiona C. Meldrum, Nico Sommerdijk
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-18846-2

Correlative Raman spectroscopy and electron microscopy identifies glycogen rich deposits correlated with local structural defects in long bones of type IV osteogenesis imperfecta patients

Autoren: R.H.M. Van der Meijden, M.H. Scholten, W.H. Nijhuis, R.J.B. Sakkers, N. Sommerdijk, A. Akiva
Veröffentlicht in: Journal of Structural Biology, Ausgabe 216, 2025, Seite(n) 108142, ISSN 1047-8477
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jsb.2024.108142

Visualizing Biological Tissues: A Multiscale Workflow from Live Imaging to 3D Cryo-CLEM

Autoren: Marit de Beer, Rona Roverts, Xavier Heiligenstein, Edwin Lamers, Nico Sommerdijk, Anat Akiva
Veröffentlicht in: Microscopy and Microanalysis, Ausgabe 27, 2023, Seite(n) 11-12, ISSN 1431-9276
Herausgeber: Cambridge University Press
DOI: 10.1017/s1431927621013635

An Organoid for Woven Bone

Autoren: Anat Akiva, Johanna Melke, Sana Ansari, Nalan Liv, Robin Meijden, Merijn Erp, Feihu Zhao, Merula Stout, Wouter H. Nijhuis, Cilia Heus, Claudia Muñiz Ortera, Job Fermie, Judith Klumperman, Keita Ito, Nico Sommerdijk, Sandra Hofmann
Veröffentlicht in: Advanced Functional Materials, 2021, Seite(n) 2010524, ISSN 1616-301X
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/adfm.202010524

Imatinib attenuates reperfusion injury in a rat model of acute myocardial infarction

Autoren: Lara S. F. Konijnenberg, Tom T. J. Luiken, Andor Veltien, Laween Uthman, Carolien T. A. Kuster, Laura Rodwell, Guus A. de Waard, Mariska Kea-te Lindert, Anat Akiva, Dick H. J. Thijssen, Robin Nijveldt, Niels van Royen
Veröffentlicht in: Basic Research in Cardiology, Ausgabe 118, 2023, ISSN 1435-1803
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1007/s00395-022-00974-z

Human pluripotent stem cell-derived kidney organoids for personalized congenital and idiopathic nephrotic syndrome modeling

Autoren: Jitske Jansen, Bartholomeus T. van den Berge, Martijn van den Broek, Rutger J. Maas, Deniz Daviran, Brigith Willemsen, Rona Roverts, Marit van der Kruit, Christoph Kuppe, Katharina C. Reimer, Gianluca Di Giovanni, Fieke Mooren, Quincy Nlandu, Helmer Mudde, Roy Wetzels, Dirk den Braanker, Naomi Parr, James S. Nagai, Vedran Drenic, Ivan G. Costa, Eric Steenbergen, Tom Nijenhuis, Henry Dijkman, Nicol
Veröffentlicht in: Development, Ausgabe 149, 2022, ISSN 0950-1991
Herausgeber: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/dev.200198

Endocytosis-like DNA uptake by cell wall-deficient bacteria

Autoren: Renée Kapteijn, Shraddha Shitut, Dennis Aschmann, Le Zhang, Marit de Beer, Deniz Daviran, Rona Roverts, Anat Akiva, Gilles P. van Wezel, Alexander Kros, Dennis Claessen
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 13, 2022, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-33054-w

From bone regeneration to three-dimensional in vitro models: tissue engineering of organized bone extracellular matrix

Autoren: Bregje W.M. de Wildt, Sana Ansari, Nico A.J.M. Sommerdijk, Keita Ito, Anat Akiva, Sandra Hofmann
Veröffentlicht in: Current Opinion in Biomedical Engineering, Ausgabe 10, 2019, Seite(n) 107-115, ISSN 2468-4511
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cobme.2019.05.005

A 3D Cell‐Free Bone Model Shows Collagen Mineralization is Driven and Controlled by the Matrix

Autoren: Robin H.M. van der Meijden, Deniz Daviran, Luco Rutten, X. Frank Walboomers, Elena Macías‐Sánchez, Nico Sommerdijk, Anat Akiva
Veröffentlicht in: Advanced Functional Materials, Ausgabe 33, 2023, ISSN 1616-301X
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/adfm.202212339

SARS-CoV-2 infects the human kidney and drives fibrosis in kidney organoids

Autoren: Jitske Jansen; Katharina C. Reimer; James S. Nagai; Finny S. Varghese; Gijs J. Overheul; Marit de Beer; Rona Roverts; Deniz Daviran; Liline A.S. Fermin; Brigith Willemsen; Marcel Beukenboom; Sonja Djudjaj; Saskia von Stillfried; Larissa E. van Eijk; Mirjam Mastik; Marian Bulthuis; Wilfred den Dunnen; Harry van Goor; Jan-Luuk Hillebrands; Sergio H. Triana; Theodore Alexandrov; Marie-Cherelle Timm;
Veröffentlicht in: CELL STEM CELL, Ausgabe 19345909, 2021, ISSN 1934-5909
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.stem.2021.12.010

Book chapters (1)

HPM live μ for a full CLEM workflow

Autoren: Xavier Heiligenstein, Marit de Beer, Jérôme Heiligenstein, Frédérique Eyraud, Laurent Manet, Fabrice Schmitt, Edwin Lamers, Joerg Lindenau, Mariska Kea-te Lindert, Jean Salamero, Graça Raposo, Nico Sommerdijk, Martin Belle, Anat Akiva
Veröffentlicht in: Correlative Light and Electron Microscopy IV, Ausgabe 162, 2021, Seite(n) 115-149, ISBN 9780128220580
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/bs.mcb.2020.10.022