A Google Earth Approach to Understanding Collagen Mineralization

Informazioni relative al progetto

COLMIN

ID dell’accordo di sovvenzione: 788982

DOI

10.3030/788982

Progetto chiuso

Data della firma CE 24 Maggio 2018

Data di avvio 1 Gennaio 2019

Data di completamento 30 Aprile 2025

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 3 498 006,25

Contributo UE

€ 3 498 006,00

Coordinato da

STICHTING RADBOUD UNIVERSITAIR MEDISCH CENTRUM
Netherlands

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I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Thesis and dissertations (1)

Unravelling the Role of Glycosylation on the Mineralization of Collagen Type I - Model Systems and Advanced Transmission Electron Microscopy

Autori: Rutten, L.J.
Pubblicato in: Numero 1, 2024, ISBN 978-94-6473-655-6
Editore: Luco Rutten

Peer reviewed articles (17)

A Cryo‐to‐Liquid Phase Correlative Light Electron Microscopy Workflow for the Visualization of Biological Processes in Graphene Liquid Cells

Autori: Luco Rutten, Ben Joosten, Judith Schaart, Marit de Beer, Rona Roverts, Steffen Gräber, Willi Jahnen‐Dechent, Anat Akiva, Elena Macías‐Sánchez, Nico Sommerdijk
Pubblicato in: Advanced Functional Materials, Numero 35, 2025, ISSN 1616-301X
Editore: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/adfm.202416938

Involvement of ceramide biosynthesis in increased extracellular vesicle release in Pkd1 knock out cells

Autori: Valentina Carotti, Jenny van der Wijst, Eric H. J. Verschuren, Luco Rutten, Nico Sommerdijk, Charlotte Kaffa, Vera Sommers, Juan P. Rigalli, Joost G. J. Hoenderop
Pubblicato in: Frontiers in Endocrinology, Numero 13, 2022, ISSN 1664-2392
Editore: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/fendo.2022.1005639

Bioinspired Silk Fibroin Mineralization for Advanced In Vitro Bone Remodeling Models

Autori: Bregje W. M. de Wildt,Robin van der Meijden,Paul A. A. Bartels,Nico A. J. M. Sommerdijk,Anat Akiva,Keita Ito,Sandra Hofmann
Pubblicato in: ADVANCED FUNCTIONAL MATERIALS, Numero 1616301X, 2022, ISSN 1616-301X
Editore: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/adfm.202206992

On the role of the glycosylation of type I collagen in bone

Autori: Luco Rutten, Elena Macías-Sánchez, Nico Sommerdijk
Pubblicato in: Journal of Structural Biology, Numero 216, 2025, Pagina/e 108145, ISSN 1047-8477
Editore: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jsb.2024.108145

Precise targeting for 3D cryo-correlative light and electron microscopy volume imaging of tissues using a FinderTOP

Autori: Marit de Beer, Deniz Daviran, Rona Roverts, Luco Rutten, Elena Macías-Sánchez, Juriaan R. Metz, Nico Sommerdijk, Anat Akiva
Pubblicato in: Communications Biology, Numero 6, 2023, ISSN 2399-3642
Editore: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s42003-023-04887-y

Comparative 3D ultrastructure of Plasmodium falciparum gametocytes

Autori: Felix Evers, Rona Roverts, Cas Boshoven, Mariska Kea-te Lindert, Julie M. J. Verhoef, Nico Sommerdijk, Robert E. Sinden, Anat Akiva, Taco W. A. Kooij
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 16, 2025, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-55413-5

Cell-induced collagen alignment in a 3D in vitro culture during extracellular matrix production

Autori: Judith M. Schaart, Mariska Kea-te Lindert, Rona Roverts, Wouter H. Nijhuis, Nico Sommerdijk, Anat Akiva
Pubblicato in: Journal of Structural Biology, Numero 216, 2024, Pagina/e 108096, ISSN 1047-8477
Editore: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jsb.2024.108096

Intermolecular channels direct crystal orientation in mineralized collagen

Autori: YiFei Xu, Fabio Nudelman, E. Deniz Eren, Maarten J. M. Wirix, Bram Cantaert, Wouter H. Nijhuis, Daniel Hermida-Merino, Giuseppe Portale, Paul H. H. Bomans, Christian Ottmann, Heiner Friedrich, Wim Bras, Anat Akiva, Joseph P. R. O. Orgel, Fiona C. Meldrum, Nico Sommerdijk
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-18846-2

Correlative Raman spectroscopy and electron microscopy identifies glycogen rich deposits correlated with local structural defects in long bones of type IV osteogenesis imperfecta patients

Autori: R.H.M. Van der Meijden, M.H. Scholten, W.H. Nijhuis, R.J.B. Sakkers, N. Sommerdijk, A. Akiva
Pubblicato in: Journal of Structural Biology, Numero 216, 2025, Pagina/e 108142, ISSN 1047-8477
Editore: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jsb.2024.108142

Visualizing Biological Tissues: A Multiscale Workflow from Live Imaging to 3D Cryo-CLEM

Autori: Marit de Beer, Rona Roverts, Xavier Heiligenstein, Edwin Lamers, Nico Sommerdijk, Anat Akiva
Pubblicato in: Microscopy and Microanalysis, Numero 27, 2023, Pagina/e 11-12, ISSN 1431-9276
Editore: Cambridge University Press
DOI: 10.1017/s1431927621013635

An Organoid for Woven Bone

Autori: Anat Akiva, Johanna Melke, Sana Ansari, Nalan Liv, Robin Meijden, Merijn Erp, Feihu Zhao, Merula Stout, Wouter H. Nijhuis, Cilia Heus, Claudia Muñiz Ortera, Job Fermie, Judith Klumperman, Keita Ito, Nico Sommerdijk, Sandra Hofmann
Pubblicato in: Advanced Functional Materials, 2021, Pagina/e 2010524, ISSN 1616-301X
Editore: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/adfm.202010524

Imatinib attenuates reperfusion injury in a rat model of acute myocardial infarction

Autori: Lara S. F. Konijnenberg, Tom T. J. Luiken, Andor Veltien, Laween Uthman, Carolien T. A. Kuster, Laura Rodwell, Guus A. de Waard, Mariska Kea-te Lindert, Anat Akiva, Dick H. J. Thijssen, Robin Nijveldt, Niels van Royen
Pubblicato in: Basic Research in Cardiology, Numero 118, 2023, ISSN 1435-1803
Editore: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1007/s00395-022-00974-z

Human pluripotent stem cell-derived kidney organoids for personalized congenital and idiopathic nephrotic syndrome modeling

Autori: Jitske Jansen, Bartholomeus T. van den Berge, Martijn van den Broek, Rutger J. Maas, Deniz Daviran, Brigith Willemsen, Rona Roverts, Marit van der Kruit, Christoph Kuppe, Katharina C. Reimer, Gianluca Di Giovanni, Fieke Mooren, Quincy Nlandu, Helmer Mudde, Roy Wetzels, Dirk den Braanker, Naomi Parr, James S. Nagai, Vedran Drenic, Ivan G. Costa, Eric Steenbergen, Tom Nijenhuis, Henry Dijkman, Nicol
Pubblicato in: Development, Numero 149, 2022, ISSN 0950-1991
Editore: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/dev.200198

Endocytosis-like DNA uptake by cell wall-deficient bacteria

Autori: Renée Kapteijn, Shraddha Shitut, Dennis Aschmann, Le Zhang, Marit de Beer, Deniz Daviran, Rona Roverts, Anat Akiva, Gilles P. van Wezel, Alexander Kros, Dennis Claessen
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 13, 2022, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-33054-w

From bone regeneration to three-dimensional in vitro models: tissue engineering of organized bone extracellular matrix

Autori: Bregje W.M. de Wildt, Sana Ansari, Nico A.J.M. Sommerdijk, Keita Ito, Anat Akiva, Sandra Hofmann
Pubblicato in: Current Opinion in Biomedical Engineering, Numero 10, 2019, Pagina/e 107-115, ISSN 2468-4511
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cobme.2019.05.005

A 3D Cell‐Free Bone Model Shows Collagen Mineralization is Driven and Controlled by the Matrix

Autori: Robin H.M. van der Meijden, Deniz Daviran, Luco Rutten, X. Frank Walboomers, Elena Macías‐Sánchez, Nico Sommerdijk, Anat Akiva
Pubblicato in: Advanced Functional Materials, Numero 33, 2023, ISSN 1616-301X
Editore: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/adfm.202212339

SARS-CoV-2 infects the human kidney and drives fibrosis in kidney organoids

Autori: Jitske Jansen; Katharina C. Reimer; James S. Nagai; Finny S. Varghese; Gijs J. Overheul; Marit de Beer; Rona Roverts; Deniz Daviran; Liline A.S. Fermin; Brigith Willemsen; Marcel Beukenboom; Sonja Djudjaj; Saskia von Stillfried; Larissa E. van Eijk; Mirjam Mastik; Marian Bulthuis; Wilfred den Dunnen; Harry van Goor; Jan-Luuk Hillebrands; Sergio H. Triana; Theodore Alexandrov; Marie-Cherelle Timm;
Pubblicato in: CELL STEM CELL, Numero 19345909, 2021, ISSN 1934-5909
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.stem.2021.12.010

Book chapters (1)

HPM live μ for a full CLEM workflow

Autori: Xavier Heiligenstein, Marit de Beer, Jérôme Heiligenstein, Frédérique Eyraud, Laurent Manet, Fabrice Schmitt, Edwin Lamers, Joerg Lindenau, Mariska Kea-te Lindert, Jean Salamero, Graça Raposo, Nico Sommerdijk, Martin Belle, Anat Akiva
Pubblicato in: Correlative Light and Electron Microscopy IV, Numero 162, 2021, Pagina/e 115-149, ISBN 9780128220580
Editore: Elsevier
DOI: 10.1016/bs.mcb.2020.10.022