Computational design of novel functions in helical proteins by deviating from ideal geometries

Projektinformationen

HelixMold

ID Finanzhilfevereinbarung: 802217

DOI

10.3030/802217

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 17 Dezember 2018

Startdatum 1 April 2019

Enddatum 31 März 2025

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 499 414,00

EU-Beitrag

€ 1 499 414,00

Koordiniert durch

TECHNISCHE UNIVERSITAET GRAZ
Austria

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (9)

Accelerating Biocatalysis Discovery with Machine Learning: A Paradigm Shift in Enzyme Engineering, Discovery, and Design

Autoren: Braun Markus, Gruber Christian C, Krassnigg Andreas, Kummer Arkadij, Lutz Stefan, Oberdorfer Gustav, Siirola Elina, Snajdrova Radka
Veröffentlicht in: ACS Catalysis, Ausgabe 13, 2023, Seite(n) 14454-14469, ISSN 2155-5435
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acscatal.3c03417

Affinity Maturated Transferrin Receptor Apical Domain Blocks Machupo Virus Glycoprotein Binding

Autoren: Dick J. Sjöström, Birgit Grill, Elena Ambrosetti, Anuthariq Alikkam Veetil, Camilla Mohlin, Ana I. Teixeira, Gustav Oberdofer, Sinisa Bjelic
Veröffentlicht in: Journal of Molecular Biology, Ausgabe 15th October 2023, 2023, ISSN 0022-2836
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2023.168262

Derivatives of Natural Organocatalytic Cofactors and Artificial Organocatalytic Cofactors as Catalysts in Enzymes

Autoren: Horst Lechner, Gustav Oberdorfer
Veröffentlicht in: ChemBioChem, 2022, ISSN 1439-4227
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.202100599

Computational backbone design enables soluble engineering of transferrin receptor apical domain

Autoren: Dick J. Sjöström, Sarah A. Berger, Gustav Oberdorfer, Sinisa Bjelic
Veröffentlicht in: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, Ausgabe 88/12, 2020, Seite(n) 1569-1577, ISSN 0887-3585
Herausgeber: Wiley-Liss Inc
DOI: 10.1002/prot.25974

Enzyme Machinery for Bacterial Glucoside Metabolism through a Conserved Non‐hydrolytic Pathway

Autoren: Klara Kastner, Johannes Bitter, Martin Pfeiffer, Christoph Grininger, Gustav Oberdorfer, Tea Pavkov‐Keller, Hansjörg Weber, Bernd Nidetzky
Veröffentlicht in: Angewandte Chemie International Edition, 2024, ISSN 1433-7851
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202410681

A local platform for user-friendly FAIR data management and reproducible analytics

Autoren: Florian Wieser, Sarah Stryeck, Konrad Lang, Christoph Hahn, Gerhard G. Thallinger, Julia Feichtinger, Philipp Hack, Manfred Stepponat, Nirav Merchant, Stefanie Lindstaedt, Gustav Oberdorfer
Veröffentlicht in: Journal of Biotechnology, Ausgabe 341, 2021, Seite(n) 43-50, ISSN 0168-1656
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jbiotec.2021.08.004

Engineering of Transmembrane Alkane Monooxygenases to Improve a Key Reaction Step in the Synthesis of Polymer Precursor Tulipalin A

Autoren: Andrea Nigl, Veronica Delsoglio, Lucija Sovic, Marina Grgić, Lenny Malihan‐Yap, Kamela Myrtollari, Jelena Spasic, Margit Winkler, Gustav Oberdorfer, Andreas Taden, Iva Anić, Robert Kourist
Veröffentlicht in: Angewandte Chemie International Edition, 2025, ISSN 1433-7851
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202503464

<scp>ESM</scp>‐scan—A tool to guide amino acid substitutions

Autoren: Massimo G. Totaro, Uršula Vide, Regina Zausinger, Andreas Winkler, Gustav Oberdorfer
Veröffentlicht in: Protein Science, Ausgabe 33, 2024, ISSN 0961-8368
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1002/pro.5221

Sterol interactions influence the function of Wsc sensors

Autoren: Lukas Bernauer, Paula Berzak, Leonie Lehmayer, Julia Messenlehne, Gustav Oberdorfer, Günther Zellnig, Heimo Wolinski, Christoph Augustin, Melanie Baeck, Anita Emmerstorfer-Augustin
Veröffentlicht in: Journal of Lipid Research, Ausgabe 2nd November 2023, 2023, ISSN 0022-2275
Herausgeber: Lipid Research, Inc.
DOI: 10.1016/j.jlr.2023.100466

Other (2)

Computational design of a thermostable de novo biocatalyst for whole cell biotransformations

Autoren: Wael Elaily, David Stoll, Morakot Chakatok, Matteo Aleotti, Birgit Grill, Horst Lechner, Melanie Hall, Gustav Oberdorfer
Veröffentlicht in: bioRxiv, Ausgabe bioRxiv 2024.10.07.617055, 2024
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.10.07.617055

Computational design of highly active de novo enzymes

Autoren: Markus Braun, Adrian Tripp, Morakot Chakatok, Sigrid Kaltenbrunner, Massimo G. Totaro, David Stoll, Aleksandar Bijelic, Wael Elaily, Shlomo Yakir Yakir Hoch, Matteo Aleotti, Melanie Hall, Gustav Oberdorfer
Veröffentlicht in: bioRxiv, Ausgabe bioRxiv 2024.08.02.606416, 2024
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.08.02.606416