RNA regulation during viral infection

Información del proyecto

VIRUSES AND RNA

Identificador del acuerdo de subvención: 802899

DOI

10.3030/802899

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 11 Octubre 2018

Fecha de inicio 1 Julio 2019

Fecha de finalización 30 Junio 2024

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 1 500 000,00

Aportación de la UE

€ 1 500 000,00

Coordinado por

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Denmark

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Publicaciones

Peer reviewed articles (11)

Host genetic variation guides hepacivirus clearance, chronicity, and liver fibrosis in mice

Autores: Brown AJ, Won JJ, Wolfisberg R, Fahnøe U, Catanzaro N, West A, Moreira FR, Nogueira Batista M, Ferris MT, Linnertz CL, Leist SR, Nguyen C, De la Cruz G, Midkiff BR, Xia Y, Evangelista MD, Montgomery SA, Billerbeck E, Bukh J, Scheel TKH, Rice CM, Sheahan TP.
Publicado en: Hepatology, Edición 79(1), 2023, Página(s) 183-197, ISSN 0270-9139
Editor: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1097/hep.0000000000000547

Identification of the viral and cellular microRNA interactomes during SARS-CoV-2 infection

Autores: Nicolas Fossat; Emma A. Lundsgaard; Rui Costa; Lizandro R. Rivera-Rangel; Louise Nielsen; Lotte S. Mikkelsen; Santseharay Ramirez; Jens Bukh; Troels K.H. Scheel
Publicado en: Cell Reports, Edición 42(4), 2023, Página(s) 112282, ISSN 2211-1247
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2023.112282

Pathogenesis, MicroRNA-122 Gene-Regulation, and Protective Immune Responses After Acute Equine Hepacivirus Infection`

Autores: Joy E. Tomlinson, Raphael Wolfisberg, Ulrik Fahnøe, Roosheel S. Patel, Sheetal Trivedi, Arvind Kumar, Himanshu Sharma, Louise Nielsen, Sean P. McDonough, Jens Bukh, Bud C. Tennant, Amit Kapoor, Brad R. Rosenberg, Charles M. Rice, Thomas J. Divers, Gerlinde R. Van de Walle, Troels K.H. Scheel
Publicado en: Hepatology, Edición 74 (3), 2021, Página(s) 1148-1163, ISSN 1527-3350
Editor: John Wiley & Sons
DOI: 10.1002/hep.31802

Hepatitis C virus RNA is 5'-capped with flavin adenine dinucleotide

Autores: Anna V. Sherwood, Lizandro R. Rivera-Rangel, Line A. Ryberg, Helena S. Larsen, Klara M. Anker, Rui Costa, Cathrine B. Vågbø, Eva Jakljevič, Long V. Pham, Carlota Fernandez-Antunez, Gabriele Indrisiunaite, Agnieszka Podolska-Charlery, Julius E. R. Grothen, Nicklas W. Langvad, Nicolas Fossat, Anna Offersgaard, Amal Al-Chaer, Louise Nielsen, Anna Kuśnierczyk, Christina Sølund, Nina Weis, Judith
Publicado en: Nature, Edición 619(7971), 2023, Página(s) 811-818, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-023-06301-3

Characterising the RNA-binding protein atlas of the mammalian brain uncovers RBM5 misregulation in mouse models of Huntington’s disease

Autores: Meeli Mullari; Nicolas Fossat; Niels H. Skotte; Andrea Asenjo-Martinez; David T. Humphreys; Jens Bukh; Agnete Kirkeby; Troels K. H. Scheel; Michael L. Nielsen
Publicado en: Nature Communications, Edición 14(1), 2023, Página(s) 4348, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-39936-x

Replicons of a Rodent Hepatitis C Model Virus Permit Selection of Highly Permissive Cells

Autores: Raphael Wolfisberg, Kenn Holmbeck, Louise Nielsen, Amit Kapoor, Charles M. Rice, Jens Bukh, Troels K. H. Scheel
Publicado en: Journal of Virology, Edición 93/19, 2019, ISSN 0022-538X
Editor: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/jvi.00733-19

A Distinct Dexamethasone-Dependent Gene Expression Profile in the Lungs of COVID-19 Patients

Autores: Ulrik Fahnøe, Andreas Ronit, Ronan M G Berg, Sofie E Jørgensen, Trine H Mogensen, Alexander P Underwood, Troels K H Scheel, Jens Bukh, Ronni R Plovsing
Publicado en: Journal of Infectious Diseases, Edición 226(12), 2022, Página(s) 2137-2141, ISSN 0022-1899
Editor: University of Chicago Press
DOI: 10.1093/infdis/jiac218

Evolutionary selection of pestivirus variants with altered or no microRNA dependency

Autores: Konstantinos G Kokkonos, Nicolas Fossat, Louise Nielsen, Christina Holm, Wytske M Hepkema, Jens Bukh, Troels K H Scheel
Publicado en: Nucleic Acids Research, Edición 48/10, 2020, Página(s) 5555-5571, ISSN 0305-1048
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaa300

Molecular Determinants of Mouse Adaptation of Rat Hepacivirus

Autores: Raphael Wolfisberg; Kenn Holmbeck; Eva Billerbeck; Caroline E. Thorselius; Mariana N. Batista; Ulrik Fahnøe; Emma A. Lundsgaard; Matthew J. Kennedy; Louise Nielsen; Charles M. Rice; Jens Bukh; Troels K. H. Scheel
Publicado en: Journal of Virology, Edición 97(4), 2023, Página(s) e0181222, ISSN 0022-538X
Editor: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/jvi.01812-22

Neutralization and receptor use of infectious culture–derived rat hepacivirus as a model for HCV

Autores: Raphael Wolfisberg; Caroline E. Thorselius; Eduardo Salinas; Elizabeth Elrod; Sheetal Trivedi; Louise Nielsen; Ulrik Fahnøe; Amit Kapoor; Arash Grakoui; Charles M. Rice; Jens Bukh; Kenn Holmbeck; Troels K. H. Scheel
Publicado en: Hepatology, Edición 76(5), 2022, Página(s) 1506-1519, ISSN 1527-3350
Editor: John Wiley & Sons
DOI: 10.1002/hep.32535

Functional Interplay between RNA Viruses and Non-Coding RNA in Mammals

Autores: Nkerorema Djodji Damas, Nicolas Fossat, Troels K. H. Scheel
Publicado en: Non-Coding RNA, Edición 5/1, 2019, Página(s) 7, ISSN 2311-553X
Editor: MDPI
DOI: 10.3390/ncrna5010007