RNA regulation during viral infection

Informazioni relative al progetto

VIRUSES AND RNA

ID dell’accordo di sovvenzione: 802899

DOI

10.3030/802899

Progetto chiuso

Data della firma CE 11 Ottobre 2018

Data di avvio 1 Luglio 2019

Data di completamento 30 Giugno 2024

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 500 000,00

Contributo UE

€ 1 500 000,00

Coordinato da

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Denmark

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Pubblicazioni

Peer reviewed articles (11)

Host genetic variation guides hepacivirus clearance, chronicity, and liver fibrosis in mice

Autori: Brown AJ, Won JJ, Wolfisberg R, Fahnøe U, Catanzaro N, West A, Moreira FR, Nogueira Batista M, Ferris MT, Linnertz CL, Leist SR, Nguyen C, De la Cruz G, Midkiff BR, Xia Y, Evangelista MD, Montgomery SA, Billerbeck E, Bukh J, Scheel TKH, Rice CM, Sheahan TP.
Pubblicato in: Hepatology, Numero 79(1), 2023, Pagina/e 183-197, ISSN 0270-9139
Editore: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1097/hep.0000000000000547

Identification of the viral and cellular microRNA interactomes during SARS-CoV-2 infection

Autori: Nicolas Fossat; Emma A. Lundsgaard; Rui Costa; Lizandro R. Rivera-Rangel; Louise Nielsen; Lotte S. Mikkelsen; Santseharay Ramirez; Jens Bukh; Troels K.H. Scheel
Pubblicato in: Cell Reports, Numero 42(4), 2023, Pagina/e 112282, ISSN 2211-1247
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2023.112282

Pathogenesis, MicroRNA-122 Gene-Regulation, and Protective Immune Responses After Acute Equine Hepacivirus Infection`

Autori: Joy E. Tomlinson, Raphael Wolfisberg, Ulrik Fahnøe, Roosheel S. Patel, Sheetal Trivedi, Arvind Kumar, Himanshu Sharma, Louise Nielsen, Sean P. McDonough, Jens Bukh, Bud C. Tennant, Amit Kapoor, Brad R. Rosenberg, Charles M. Rice, Thomas J. Divers, Gerlinde R. Van de Walle, Troels K.H. Scheel
Pubblicato in: Hepatology, Numero 74 (3), 2021, Pagina/e 1148-1163, ISSN 1527-3350
Editore: John Wiley & Sons
DOI: 10.1002/hep.31802

Hepatitis C virus RNA is 5'-capped with flavin adenine dinucleotide

Autori: Anna V. Sherwood, Lizandro R. Rivera-Rangel, Line A. Ryberg, Helena S. Larsen, Klara M. Anker, Rui Costa, Cathrine B. Vågbø, Eva Jakljevič, Long V. Pham, Carlota Fernandez-Antunez, Gabriele Indrisiunaite, Agnieszka Podolska-Charlery, Julius E. R. Grothen, Nicklas W. Langvad, Nicolas Fossat, Anna Offersgaard, Amal Al-Chaer, Louise Nielsen, Anna Kuśnierczyk, Christina Sølund, Nina Weis, Judith
Pubblicato in: Nature, Numero 619(7971), 2023, Pagina/e 811-818, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-023-06301-3

Characterising the RNA-binding protein atlas of the mammalian brain uncovers RBM5 misregulation in mouse models of Huntington’s disease

Autori: Meeli Mullari; Nicolas Fossat; Niels H. Skotte; Andrea Asenjo-Martinez; David T. Humphreys; Jens Bukh; Agnete Kirkeby; Troels K. H. Scheel; Michael L. Nielsen
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 14(1), 2023, Pagina/e 4348, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-39936-x

Replicons of a Rodent Hepatitis C Model Virus Permit Selection of Highly Permissive Cells

Autori: Raphael Wolfisberg, Kenn Holmbeck, Louise Nielsen, Amit Kapoor, Charles M. Rice, Jens Bukh, Troels K. H. Scheel
Pubblicato in: Journal of Virology, Numero 93/19, 2019, ISSN 0022-538X
Editore: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/jvi.00733-19

A Distinct Dexamethasone-Dependent Gene Expression Profile in the Lungs of COVID-19 Patients

Autori: Ulrik Fahnøe, Andreas Ronit, Ronan M G Berg, Sofie E Jørgensen, Trine H Mogensen, Alexander P Underwood, Troels K H Scheel, Jens Bukh, Ronni R Plovsing
Pubblicato in: Journal of Infectious Diseases, Numero 226(12), 2022, Pagina/e 2137-2141, ISSN 0022-1899
Editore: University of Chicago Press
DOI: 10.1093/infdis/jiac218

Evolutionary selection of pestivirus variants with altered or no microRNA dependency

Autori: Konstantinos G Kokkonos, Nicolas Fossat, Louise Nielsen, Christina Holm, Wytske M Hepkema, Jens Bukh, Troels K H Scheel
Pubblicato in: Nucleic Acids Research, Numero 48/10, 2020, Pagina/e 5555-5571, ISSN 0305-1048
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaa300

Molecular Determinants of Mouse Adaptation of Rat Hepacivirus

Autori: Raphael Wolfisberg; Kenn Holmbeck; Eva Billerbeck; Caroline E. Thorselius; Mariana N. Batista; Ulrik Fahnøe; Emma A. Lundsgaard; Matthew J. Kennedy; Louise Nielsen; Charles M. Rice; Jens Bukh; Troels K. H. Scheel
Pubblicato in: Journal of Virology, Numero 97(4), 2023, Pagina/e e0181222, ISSN 0022-538X
Editore: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/jvi.01812-22

Neutralization and receptor use of infectious culture–derived rat hepacivirus as a model for HCV

Autori: Raphael Wolfisberg; Caroline E. Thorselius; Eduardo Salinas; Elizabeth Elrod; Sheetal Trivedi; Louise Nielsen; Ulrik Fahnøe; Amit Kapoor; Arash Grakoui; Charles M. Rice; Jens Bukh; Kenn Holmbeck; Troels K. H. Scheel
Pubblicato in: Hepatology, Numero 76(5), 2022, Pagina/e 1506-1519, ISSN 1527-3350
Editore: John Wiley & Sons
DOI: 10.1002/hep.32535

Functional Interplay between RNA Viruses and Non-Coding RNA in Mammals

Autori: Nkerorema Djodji Damas, Nicolas Fossat, Troels K. H. Scheel
Pubblicato in: Non-Coding RNA, Numero 5/1, 2019, Pagina/e 7, ISSN 2311-553X
Editore: MDPI
DOI: 10.3390/ncrna5010007