RNA regulation during viral infection

Informations projet

VIRUSES AND RNA

N° de convention de subvention: 802899

DOI

10.3030/802899

Projet clôturé

Date de signature de la CE 11 Octobre 2018

Date de début 1 Juillet 2019

Date de fin 30 Juin 2024

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 500 000,00

Contribution de l’UE

€ 1 500 000,00

Coordonné par

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Denmark

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Publications

Peer reviewed articles (11)

Host genetic variation guides hepacivirus clearance, chronicity, and liver fibrosis in mice

Auteurs: Brown AJ, Won JJ, Wolfisberg R, Fahnøe U, Catanzaro N, West A, Moreira FR, Nogueira Batista M, Ferris MT, Linnertz CL, Leist SR, Nguyen C, De la Cruz G, Midkiff BR, Xia Y, Evangelista MD, Montgomery SA, Billerbeck E, Bukh J, Scheel TKH, Rice CM, Sheahan TP.
Publié dans: Hepatology, Numéro 79(1), 2023, Page(s) 183-197, ISSN 0270-9139
Éditeur: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1097/hep.0000000000000547

Identification of the viral and cellular microRNA interactomes during SARS-CoV-2 infection

Auteurs: Nicolas Fossat; Emma A. Lundsgaard; Rui Costa; Lizandro R. Rivera-Rangel; Louise Nielsen; Lotte S. Mikkelsen; Santseharay Ramirez; Jens Bukh; Troels K.H. Scheel
Publié dans: Cell Reports, Numéro 42(4), 2023, Page(s) 112282, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2023.112282

Pathogenesis, MicroRNA-122 Gene-Regulation, and Protective Immune Responses After Acute Equine Hepacivirus Infection`

Auteurs: Joy E. Tomlinson, Raphael Wolfisberg, Ulrik Fahnøe, Roosheel S. Patel, Sheetal Trivedi, Arvind Kumar, Himanshu Sharma, Louise Nielsen, Sean P. McDonough, Jens Bukh, Bud C. Tennant, Amit Kapoor, Brad R. Rosenberg, Charles M. Rice, Thomas J. Divers, Gerlinde R. Van de Walle, Troels K.H. Scheel
Publié dans: Hepatology, Numéro 74 (3), 2021, Page(s) 1148-1163, ISSN 1527-3350
Éditeur: John Wiley & Sons
DOI: 10.1002/hep.31802

Hepatitis C virus RNA is 5'-capped with flavin adenine dinucleotide

Auteurs: Anna V. Sherwood, Lizandro R. Rivera-Rangel, Line A. Ryberg, Helena S. Larsen, Klara M. Anker, Rui Costa, Cathrine B. Vågbø, Eva Jakljevič, Long V. Pham, Carlota Fernandez-Antunez, Gabriele Indrisiunaite, Agnieszka Podolska-Charlery, Julius E. R. Grothen, Nicklas W. Langvad, Nicolas Fossat, Anna Offersgaard, Amal Al-Chaer, Louise Nielsen, Anna Kuśnierczyk, Christina Sølund, Nina Weis, Judith
Publié dans: Nature, Numéro 619(7971), 2023, Page(s) 811-818, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-023-06301-3

Characterising the RNA-binding protein atlas of the mammalian brain uncovers RBM5 misregulation in mouse models of Huntington’s disease

Auteurs: Meeli Mullari; Nicolas Fossat; Niels H. Skotte; Andrea Asenjo-Martinez; David T. Humphreys; Jens Bukh; Agnete Kirkeby; Troels K. H. Scheel; Michael L. Nielsen
Publié dans: Nature Communications, Numéro 14(1), 2023, Page(s) 4348, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-39936-x

Replicons of a Rodent Hepatitis C Model Virus Permit Selection of Highly Permissive Cells

Auteurs: Raphael Wolfisberg, Kenn Holmbeck, Louise Nielsen, Amit Kapoor, Charles M. Rice, Jens Bukh, Troels K. H. Scheel
Publié dans: Journal of Virology, Numéro 93/19, 2019, ISSN 0022-538X
Éditeur: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/jvi.00733-19

A Distinct Dexamethasone-Dependent Gene Expression Profile in the Lungs of COVID-19 Patients

Auteurs: Ulrik Fahnøe, Andreas Ronit, Ronan M G Berg, Sofie E Jørgensen, Trine H Mogensen, Alexander P Underwood, Troels K H Scheel, Jens Bukh, Ronni R Plovsing
Publié dans: Journal of Infectious Diseases, Numéro 226(12), 2022, Page(s) 2137-2141, ISSN 0022-1899
Éditeur: University of Chicago Press
DOI: 10.1093/infdis/jiac218

Evolutionary selection of pestivirus variants with altered or no microRNA dependency

Auteurs: Konstantinos G Kokkonos, Nicolas Fossat, Louise Nielsen, Christina Holm, Wytske M Hepkema, Jens Bukh, Troels K H Scheel
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 48/10, 2020, Page(s) 5555-5571, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaa300

Molecular Determinants of Mouse Adaptation of Rat Hepacivirus

Auteurs: Raphael Wolfisberg; Kenn Holmbeck; Eva Billerbeck; Caroline E. Thorselius; Mariana N. Batista; Ulrik Fahnøe; Emma A. Lundsgaard; Matthew J. Kennedy; Louise Nielsen; Charles M. Rice; Jens Bukh; Troels K. H. Scheel
Publié dans: Journal of Virology, Numéro 97(4), 2023, Page(s) e0181222, ISSN 0022-538X
Éditeur: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/jvi.01812-22

Neutralization and receptor use of infectious culture–derived rat hepacivirus as a model for HCV

Auteurs: Raphael Wolfisberg; Caroline E. Thorselius; Eduardo Salinas; Elizabeth Elrod; Sheetal Trivedi; Louise Nielsen; Ulrik Fahnøe; Amit Kapoor; Arash Grakoui; Charles M. Rice; Jens Bukh; Kenn Holmbeck; Troels K. H. Scheel
Publié dans: Hepatology, Numéro 76(5), 2022, Page(s) 1506-1519, ISSN 1527-3350
Éditeur: John Wiley & Sons
DOI: 10.1002/hep.32535

Functional Interplay between RNA Viruses and Non-Coding RNA in Mammals

Auteurs: Nkerorema Djodji Damas, Nicolas Fossat, Troels K. H. Scheel
Publié dans: Non-Coding RNA, Numéro 5/1, 2019, Page(s) 7, ISSN 2311-553X
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/ncrna5010007