RNA regulation during viral infection

Projektinformationen

VIRUSES AND RNA

ID Finanzhilfevereinbarung: 802899

DOI

10.3030/802899

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 11 Oktober 2018

Startdatum 1 Juli 2019

Enddatum 30 Juni 2024

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 500 000,00

EU-Beitrag

€ 1 500 000,00

Koordiniert durch

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Denmark

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (11)

Host genetic variation guides hepacivirus clearance, chronicity, and liver fibrosis in mice

Autoren: Brown AJ, Won JJ, Wolfisberg R, Fahnøe U, Catanzaro N, West A, Moreira FR, Nogueira Batista M, Ferris MT, Linnertz CL, Leist SR, Nguyen C, De la Cruz G, Midkiff BR, Xia Y, Evangelista MD, Montgomery SA, Billerbeck E, Bukh J, Scheel TKH, Rice CM, Sheahan TP.
Veröffentlicht in: Hepatology, Ausgabe 79(1), 2023, Seite(n) 183-197, ISSN 0270-9139
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1097/hep.0000000000000547

Identification of the viral and cellular microRNA interactomes during SARS-CoV-2 infection

Autoren: Nicolas Fossat; Emma A. Lundsgaard; Rui Costa; Lizandro R. Rivera-Rangel; Louise Nielsen; Lotte S. Mikkelsen; Santseharay Ramirez; Jens Bukh; Troels K.H. Scheel
Veröffentlicht in: Cell Reports, Ausgabe 42(4), 2023, Seite(n) 112282, ISSN 2211-1247
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2023.112282

Pathogenesis, MicroRNA-122 Gene-Regulation, and Protective Immune Responses After Acute Equine Hepacivirus Infection`

Autoren: Joy E. Tomlinson, Raphael Wolfisberg, Ulrik Fahnøe, Roosheel S. Patel, Sheetal Trivedi, Arvind Kumar, Himanshu Sharma, Louise Nielsen, Sean P. McDonough, Jens Bukh, Bud C. Tennant, Amit Kapoor, Brad R. Rosenberg, Charles M. Rice, Thomas J. Divers, Gerlinde R. Van de Walle, Troels K.H. Scheel
Veröffentlicht in: Hepatology, Ausgabe 74 (3), 2021, Seite(n) 1148-1163, ISSN 1527-3350
Herausgeber: John Wiley & Sons
DOI: 10.1002/hep.31802

Hepatitis C virus RNA is 5'-capped with flavin adenine dinucleotide

Autoren: Anna V. Sherwood, Lizandro R. Rivera-Rangel, Line A. Ryberg, Helena S. Larsen, Klara M. Anker, Rui Costa, Cathrine B. Vågbø, Eva Jakljevič, Long V. Pham, Carlota Fernandez-Antunez, Gabriele Indrisiunaite, Agnieszka Podolska-Charlery, Julius E. R. Grothen, Nicklas W. Langvad, Nicolas Fossat, Anna Offersgaard, Amal Al-Chaer, Louise Nielsen, Anna Kuśnierczyk, Christina Sølund, Nina Weis, Judith
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 619(7971), 2023, Seite(n) 811-818, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-023-06301-3

Characterising the RNA-binding protein atlas of the mammalian brain uncovers RBM5 misregulation in mouse models of Huntington’s disease

Autoren: Meeli Mullari; Nicolas Fossat; Niels H. Skotte; Andrea Asenjo-Martinez; David T. Humphreys; Jens Bukh; Agnete Kirkeby; Troels K. H. Scheel; Michael L. Nielsen
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 14(1), 2023, Seite(n) 4348, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-39936-x

Replicons of a Rodent Hepatitis C Model Virus Permit Selection of Highly Permissive Cells

Autoren: Raphael Wolfisberg, Kenn Holmbeck, Louise Nielsen, Amit Kapoor, Charles M. Rice, Jens Bukh, Troels K. H. Scheel
Veröffentlicht in: Journal of Virology, Ausgabe 93/19, 2019, ISSN 0022-538X
Herausgeber: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/jvi.00733-19

A Distinct Dexamethasone-Dependent Gene Expression Profile in the Lungs of COVID-19 Patients

Autoren: Ulrik Fahnøe, Andreas Ronit, Ronan M G Berg, Sofie E Jørgensen, Trine H Mogensen, Alexander P Underwood, Troels K H Scheel, Jens Bukh, Ronni R Plovsing
Veröffentlicht in: Journal of Infectious Diseases, Ausgabe 226(12), 2022, Seite(n) 2137-2141, ISSN 0022-1899
Herausgeber: University of Chicago Press
DOI: 10.1093/infdis/jiac218

Evolutionary selection of pestivirus variants with altered or no microRNA dependency

Autoren: Konstantinos G Kokkonos, Nicolas Fossat, Louise Nielsen, Christina Holm, Wytske M Hepkema, Jens Bukh, Troels K H Scheel
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 48/10, 2020, Seite(n) 5555-5571, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaa300

Molecular Determinants of Mouse Adaptation of Rat Hepacivirus

Autoren: Raphael Wolfisberg; Kenn Holmbeck; Eva Billerbeck; Caroline E. Thorselius; Mariana N. Batista; Ulrik Fahnøe; Emma A. Lundsgaard; Matthew J. Kennedy; Louise Nielsen; Charles M. Rice; Jens Bukh; Troels K. H. Scheel
Veröffentlicht in: Journal of Virology, Ausgabe 97(4), 2023, Seite(n) e0181222, ISSN 0022-538X
Herausgeber: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/jvi.01812-22

Neutralization and receptor use of infectious culture–derived rat hepacivirus as a model for HCV

Autoren: Raphael Wolfisberg; Caroline E. Thorselius; Eduardo Salinas; Elizabeth Elrod; Sheetal Trivedi; Louise Nielsen; Ulrik Fahnøe; Amit Kapoor; Arash Grakoui; Charles M. Rice; Jens Bukh; Kenn Holmbeck; Troels K. H. Scheel
Veröffentlicht in: Hepatology, Ausgabe 76(5), 2022, Seite(n) 1506-1519, ISSN 1527-3350
Herausgeber: John Wiley & Sons
DOI: 10.1002/hep.32535

Functional Interplay between RNA Viruses and Non-Coding RNA in Mammals

Autoren: Nkerorema Djodji Damas, Nicolas Fossat, Troels K. H. Scheel
Veröffentlicht in: Non-Coding RNA, Ausgabe 5/1, 2019, Seite(n) 7, ISSN 2311-553X
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/ncrna5010007