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Exposing nature’s view of ligand recognition in ionotropic glutamate receptors

Descrizione del progetto

Comprendere il riconoscimento dei ligandi da parte dei recettori cerebrali

I recettori ionotropici del glutammato (iGluR, Ionotropic glutamate receptors) sono proteine transmembrana, presenti nelle cellule cerebrali, che legano il neurotrasmettitore glutammato e promuovono la trasmissione neurale nelle sinapsi. Gli iGluR mediano la plasticità sinaptica e la nostra capacità di apprendere e formare ricordi. Non è possibile prevedere la funzione degli iGluR solo sulla base del codice genetico. Il progetto iGLURs - A NEW VIEW, finanziato dall’UE, raccoglierà informazioni filogenetiche e fisiologiche sugli iGluR in diverse specie e registrerà i cambiamenti molecolari che portano al riconoscimento dei ligandi. Inoltre, il progetto caratterizzerà le interazioni chimiche che determinano il riconoscimento specifico di alcuni ligandi da parte degli iGluR.

Obiettivo

Molecular biology strives for the prediction of function, based on the genetic code. Within neuroscience, this is reflected in the intense study of the molecular basis for ligand recognition by neurotransmitter receptors. Consequently, structural and functional studies have rendered a profoundly high-resolution view of ionotropic glutamate receptors (iGluRs), the archetypal excitatory receptor in the brain. But even this view is obsolete: we don’t know why some receptors recognize glutamate yet others recognize other ligands; and we have been unable to functionally test the underlying chemical interactions. In other words, our view differs substantially from nature’s own view of ligand recognition. I plan to lead a workgroup attacking this problem on three fronts. First, bioinformatic identification and electrophysiological characterization of a broad and representative sample of iGluRs from across the spectrum of life will unveil the diversity of ligand recognition in iGluRs. Second, phylogenetic analyses combined with functional experiments will reveal the molecular changes that nature employed in arriving at existing means of ligand recognition in iGluRs. Finally, chemical-scale mutagenesis will be employed to overcome previous technical limitations and dissect the precise chemical interactions that determine the specific recognition of certain ligands. With my experience in combining phylogenetics and functional experiments and in the use of chemical-scale mutagenesis, the objectives are within reach. Together, they form a unique approach that will expose nature’s own view of ligand recognition in iGluRs, revealing the molecular blueprint for protein function in the nervous system.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

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Meccanismo di finanziamento

ERC-STG - Starting Grant

Istituzione ospitante

UNIVERSITETET I BERGEN
Contribution nette de l'UE
€ 1 500 000,00
Indirizzo
MUSEPLASSEN 1
5020 Bergen
Norvegia

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Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale
€ 1 500 000,00

Beneficiari (2)