A toolbox for fitness landscapes in evolution

Informations projet

FIT2GO

N° de convention de subvention: 804569

DOI

10.3030/804569

Projet clôturé

Date de signature de la CE 19 Novembre 2018

Date de début 1 Mars 2019

Date de fin 31 Août 2024

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 366 250,00

Contribution de l’UE

€ 1 366 250,00

Coordonné par

UNIVERSITAET BERN
Switzerland

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Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan (DMP)

Publications

Peer reviewed articles (25)

In search of the Goldilocks zone for hybrid speciation II: hard times for hybrid speciation?

Auteurs: A. Blanckaert, V. Sriram, C. Bank
Publié dans: Evolution, 2023, ISSN 0014-3820
Éditeur: Society for the Study of Evolution
DOI: 10.1093/evolut/qpad125

Adaptive Potential of Epigenetic Switching During Adaptation to Fluctuating Environments

Auteurs: Dragan Stajic, Claudia Bank, Isabel Gordo
Publié dans: Genome Biology and Evolution, 2022, ISSN 1759-6653
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gbe/evac065

Challenges and pitfalls of inferring microbial growth rates from lab cultures

Auteurs: Ana-Hermina Ghenu, Loïc Marrec, Claudia Bank
Publié dans: Frontiers in Ecology and Evolution, Numéro 11, 2024, ISSN 2296-701X
Éditeur: frontiers
DOI: 10.3389/fevo.2023.1313500

Towards evolutionary predictions: Current promises and challenges

Auteurs: Meike T. Wortel, Deepa Agashe, Susan F. Bailey, Claudia Bank, Karen Bisschop, Thomas Blankers, Johannes Cairns, Enrico Sandro Colizzi, Davide Cusseddu, Michael M. Desai, Bram van Dijk, Martijn Egas, Jacintha Ellers, Astrid T. Groot, David G. Heckel, Marcelle L. Johnson, Ken Kraaijeveld, Joachim Krug, Liedewij Laan, Michael Lässig, Peter A. Lind, Jeroen Meijer, Luke M. Noble, Samir Okasha, Paul B.
Publié dans: Evolutionary Applications, 2022, ISSN 1752-4571
Éditeur: Wiley-Blackwell
DOI: 10.1111/eva.13513

Deleterious mutation accumulation and the long-term fate of chromosomal inversions

Auteurs: Emma L. Berdan, Alexandre Blanckaert, Roger K. Butlin, Claudia Bank
Publié dans: PLOS Genetics, Numéro 17/3, 2021, Page(s) e1009411, ISSN 1553-7404
Éditeur: Plos
DOI: 10.1371/journal.pgen.1009411

Evolutionary models predict potential mechanisms of escape from mutational meltdown

Auteurs: C. Bank, M.A. Schmitz, A.Y. Morales-Arce
Publié dans: Frontiers in Virology, 2022, ISSN 2673-818X
Éditeur: Frontiers
DOI: 10.3389/fviro.2022.886655

Unpredictability of the Fitness Effects of Antimicrobial Resistance Mutations Across Environments in <i>Escherichia coli</i>

Auteurs: Aaron Hinz, André Amado, Rees Kassen, Claudia Bank, Alex Wong
Publié dans: Molecular Biology and Evolution, Numéro 41, 2024, ISSN 0737-4038
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msae086

Dominance and multi-locus interaction

Auteurs: Juan Li, Claudia Bank
Publié dans: Trends in Genetics, Numéro 40, 2024, Page(s) 364-378, ISSN 0168-9525
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tig.2023.12.003

Epistasis and Adaptation on Fitness Landscapes

Auteurs: Claudia Bank
Publié dans: Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics, 2022, ISSN 1545-2069
Éditeur: Annual Reviews
DOI: 10.1146/annurev-ecolsys-102320-112153

Patterns of selection against centrosome amplification in human cell lines

Auteurs: Marco António Dias Louro, Mónica Bettencourt-Dias, Claudia Bank
Publié dans: PLOS Computational Biology, Numéro 17/5, 2021, Page(s) e1008765, ISSN 1553-7358
Éditeur: Plos
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1008765

The limits to parapatric speciation 3: evolution of strong reproductive isolation in presence of gene flow despite limited ecological differentiation

Auteurs: Alexandre Blanckaert, Claudia Bank, Joachim Hermisson
Publié dans: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Numéro 375/1806, 2020, Page(s) 20190532, ISSN 0962-8436
Éditeur: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rstb.2019.0532

Imbalanced segregation of recombinant haplotypes in hybrid populations reveals inter- and intrachromosomal Dobzhansky-Muller incompatibilities

Auteurs: Juan Li, Molly Schumer, Claudia Bank
Publié dans: Plos Genetics, 2022, ISSN 1553-7390
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pgen.1010120

Rapid adaptation of recombining populations on tunable fitness landscapes

Auteurs: J. Li, A. Amado, C. Bank
Publié dans: Molecular Ecology, 2023, ISSN 0962-1083
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/mec.16900

The role of gene presence–absence variations on genetic incompatibility in Asian rice

Auteurs: Juan Li, Cheng‐Ruei Lee
Publié dans: New Phytologist, Numéro 239, 2023, Page(s) 778-791, ISSN 0028-646X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.18969

The Adaptive Potential of the Middle Domain of Yeast Hsp90

Auteurs: Pamela A Cote-Hammarlof, Inês Fragata, Julia Flynn, David Mavor, Konstantin B Zeldovich, Claudia Bank, Daniel N A Bolon
Publié dans: Molecular Biology and Evolution, Numéro 38/2, 2020, Page(s) 368-379, ISSN 1537-1719
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1093/molbev/msaa211

STUN: forward-time simulation on TUnable fitNess landscapes in recombining populations

Auteurs: André Amado, Juan Li, Claudia Bank
Publié dans: Bioinformatics Advances, Numéro 3, 2023, ISSN 2635-0041
Éditeur: Oxford Academic
DOI: 10.1093/bioadv/vbad164

Ecological tradeoffs lead to complex evolutionary trajectories and sustained diversity on dynamic fitness landscapes

Auteurs: André Amado, Claudia Bank
Publié dans: Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical, Numéro 57, 2024, Page(s) 195601, ISSN 1751-8113
Éditeur: Institute of Physics Publishing
DOI: 10.1088/1751-8121/ad30d0

The extinction time under mutational meltdown driven by high mutation rates

Auteurs: L. Lansch-Justen, D. Cusseddu, M.A. Schmitz, C. Bank
Publié dans: Ecology and Evolution, 2022, ISSN 2045-7758
Éditeur: John Wiley and Sons Ltd
DOI: 10.1002/ece3.9046

Evolutionary rescue in a fluctuating environment: periodic versus quasi-periodic environmental changes

Auteurs: Loïc Marrec, Claudia Bank
Publié dans: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, Numéro 290, 2023, ISSN 0962-8452
Éditeur: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rspb.2023.0770

A multilocus perspective on the evolutionary dynamics of multistrain pathogens

Auteurs: David V. McLeod, Claudia Bank, Sylvain Gandon
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 121, 2024, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2401578121

Understanding Admixture: Haplodiploidy to the Rescue

Auteurs: Pierre Nouhaud, Alexandre Blanckaert, Claudia Bank, Jonna Kulmuni
Publié dans: Trends in Ecology & Evolution, Numéro 35/1, 2020, Page(s) 34-42, ISSN 0169-5347
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tree.2019.08.013

Epistasis decreases with increasing antibiotic pressure but not temperature

Auteurs: Ana-Hermina Ghenu, André Amado, Isabel Gordo, Claudia Bank
Publié dans: Philosophical Transactions B, 2023, ISSN 0962-8436
Éditeur: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rstb.2022.0058

Comprehensive fitness maps of Hsp90 show widespread environmental dependence

Auteurs: Julia M Flynn, Ammeret Rossouw, Pamela Cote-Hammarlof, Inês Fragata, David Mavor, Carl Hollins, Claudia Bank, Daniel NA Bolon
Publié dans: eLife, Numéro 9, 2020, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/eLife.53810

Low mutational load and high mutation rate variation in gut commensal bacteria.

Auteurs: Paulo Durao; Claudia Bank; Ricardo S Ramiro; Isabel Gordo
Publié dans: Plos Biology, Numéro 2, 2020, ISSN 1544-9173
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.3000617

Solving the stochastic dynamics of population growth

Auteurs: L. Marrec, C. Bank, T. Bertrand
Publié dans: Ecology and Evolution, 2023, ISSN 2045-7758
Éditeur: John Wiley and Sons Ltd
DOI: 10.1002/ece3.10295