A toolbox for fitness landscapes in evolution

Informazioni relative al progetto

FIT2GO

ID dell’accordo di sovvenzione: 804569

DOI

10.3030/804569

Progetto chiuso

Data della firma CE 19 Novembre 2018

Data di avvio 1 Marzo 2019

Data di completamento 31 Agosto 2024

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 366 250,00

Contributo UE

€ 1 366 250,00

Coordinato da

UNIVERSITAET BERN
Switzerland

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Risultati finali

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan (DMP)

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (25)

In search of the Goldilocks zone for hybrid speciation II: hard times for hybrid speciation?

Autori: A. Blanckaert, V. Sriram, C. Bank
Pubblicato in: Evolution, 2023, ISSN 0014-3820
Editore: Society for the Study of Evolution
DOI: 10.1093/evolut/qpad125

Adaptive Potential of Epigenetic Switching During Adaptation to Fluctuating Environments

Autori: Dragan Stajic, Claudia Bank, Isabel Gordo
Pubblicato in: Genome Biology and Evolution, 2022, ISSN 1759-6653
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gbe/evac065

Challenges and pitfalls of inferring microbial growth rates from lab cultures

Autori: Ana-Hermina Ghenu, Loïc Marrec, Claudia Bank
Pubblicato in: Frontiers in Ecology and Evolution, Numero 11, 2024, ISSN 2296-701X
Editore: frontiers
DOI: 10.3389/fevo.2023.1313500

Towards evolutionary predictions: Current promises and challenges

Autori: Meike T. Wortel, Deepa Agashe, Susan F. Bailey, Claudia Bank, Karen Bisschop, Thomas Blankers, Johannes Cairns, Enrico Sandro Colizzi, Davide Cusseddu, Michael M. Desai, Bram van Dijk, Martijn Egas, Jacintha Ellers, Astrid T. Groot, David G. Heckel, Marcelle L. Johnson, Ken Kraaijeveld, Joachim Krug, Liedewij Laan, Michael Lässig, Peter A. Lind, Jeroen Meijer, Luke M. Noble, Samir Okasha, Paul B.
Pubblicato in: Evolutionary Applications, 2022, ISSN 1752-4571
Editore: Wiley-Blackwell
DOI: 10.1111/eva.13513

Deleterious mutation accumulation and the long-term fate of chromosomal inversions

Autori: Emma L. Berdan, Alexandre Blanckaert, Roger K. Butlin, Claudia Bank
Pubblicato in: PLOS Genetics, Numero 17/3, 2021, Pagina/e e1009411, ISSN 1553-7404
Editore: Plos
DOI: 10.1371/journal.pgen.1009411

Evolutionary models predict potential mechanisms of escape from mutational meltdown

Autori: C. Bank, M.A. Schmitz, A.Y. Morales-Arce
Pubblicato in: Frontiers in Virology, 2022, ISSN 2673-818X
Editore: Frontiers
DOI: 10.3389/fviro.2022.886655

Unpredictability of the Fitness Effects of Antimicrobial Resistance Mutations Across Environments in <i>Escherichia coli</i>

Autori: Aaron Hinz, André Amado, Rees Kassen, Claudia Bank, Alex Wong
Pubblicato in: Molecular Biology and Evolution, Numero 41, 2024, ISSN 0737-4038
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msae086

Dominance and multi-locus interaction

Autori: Juan Li, Claudia Bank
Pubblicato in: Trends in Genetics, Numero 40, 2024, Pagina/e 364-378, ISSN 0168-9525
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tig.2023.12.003

Epistasis and Adaptation on Fitness Landscapes

Autori: Claudia Bank
Pubblicato in: Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics, 2022, ISSN 1545-2069
Editore: Annual Reviews
DOI: 10.1146/annurev-ecolsys-102320-112153

Patterns of selection against centrosome amplification in human cell lines

Autori: Marco António Dias Louro, Mónica Bettencourt-Dias, Claudia Bank
Pubblicato in: PLOS Computational Biology, Numero 17/5, 2021, Pagina/e e1008765, ISSN 1553-7358
Editore: Plos
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1008765

The limits to parapatric speciation 3: evolution of strong reproductive isolation in presence of gene flow despite limited ecological differentiation

Autori: Alexandre Blanckaert, Claudia Bank, Joachim Hermisson
Pubblicato in: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Numero 375/1806, 2020, Pagina/e 20190532, ISSN 0962-8436
Editore: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rstb.2019.0532

Imbalanced segregation of recombinant haplotypes in hybrid populations reveals inter- and intrachromosomal Dobzhansky-Muller incompatibilities

Autori: Juan Li, Molly Schumer, Claudia Bank
Pubblicato in: Plos Genetics, 2022, ISSN 1553-7390
Editore: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pgen.1010120

Rapid adaptation of recombining populations on tunable fitness landscapes

Autori: J. Li, A. Amado, C. Bank
Pubblicato in: Molecular Ecology, 2023, ISSN 0962-1083
Editore: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/mec.16900

The role of gene presence–absence variations on genetic incompatibility in Asian rice

Autori: Juan Li, Cheng‐Ruei Lee
Pubblicato in: New Phytologist, Numero 239, 2023, Pagina/e 778-791, ISSN 0028-646X
Editore: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.18969

The Adaptive Potential of the Middle Domain of Yeast Hsp90

Autori: Pamela A Cote-Hammarlof, Inês Fragata, Julia Flynn, David Mavor, Konstantin B Zeldovich, Claudia Bank, Daniel N A Bolon
Pubblicato in: Molecular Biology and Evolution, Numero 38/2, 2020, Pagina/e 368-379, ISSN 1537-1719
Editore: Wiley
DOI: 10.1093/molbev/msaa211

STUN: forward-time simulation on TUnable fitNess landscapes in recombining populations

Autori: André Amado, Juan Li, Claudia Bank
Pubblicato in: Bioinformatics Advances, Numero 3, 2023, ISSN 2635-0041
Editore: Oxford Academic
DOI: 10.1093/bioadv/vbad164

Ecological tradeoffs lead to complex evolutionary trajectories and sustained diversity on dynamic fitness landscapes

Autori: André Amado, Claudia Bank
Pubblicato in: Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical, Numero 57, 2024, Pagina/e 195601, ISSN 1751-8113
Editore: Institute of Physics Publishing
DOI: 10.1088/1751-8121/ad30d0

The extinction time under mutational meltdown driven by high mutation rates

Autori: L. Lansch-Justen, D. Cusseddu, M.A. Schmitz, C. Bank
Pubblicato in: Ecology and Evolution, 2022, ISSN 2045-7758
Editore: John Wiley and Sons Ltd
DOI: 10.1002/ece3.9046

Evolutionary rescue in a fluctuating environment: periodic versus quasi-periodic environmental changes

Autori: Loïc Marrec, Claudia Bank
Pubblicato in: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, Numero 290, 2023, ISSN 0962-8452
Editore: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rspb.2023.0770

A multilocus perspective on the evolutionary dynamics of multistrain pathogens

Autori: David V. McLeod, Claudia Bank, Sylvain Gandon
Pubblicato in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numero 121, 2024, ISSN 0027-8424
Editore: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2401578121

Understanding Admixture: Haplodiploidy to the Rescue

Autori: Pierre Nouhaud, Alexandre Blanckaert, Claudia Bank, Jonna Kulmuni
Pubblicato in: Trends in Ecology & Evolution, Numero 35/1, 2020, Pagina/e 34-42, ISSN 0169-5347
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tree.2019.08.013

Epistasis decreases with increasing antibiotic pressure but not temperature

Autori: Ana-Hermina Ghenu, André Amado, Isabel Gordo, Claudia Bank
Pubblicato in: Philosophical Transactions B, 2023, ISSN 0962-8436
Editore: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rstb.2022.0058

Comprehensive fitness maps of Hsp90 show widespread environmental dependence

Autori: Julia M Flynn, Ammeret Rossouw, Pamela Cote-Hammarlof, Inês Fragata, David Mavor, Carl Hollins, Claudia Bank, Daniel NA Bolon
Pubblicato in: eLife, Numero 9, 2020, ISSN 2050-084X
Editore: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/eLife.53810

Low mutational load and high mutation rate variation in gut commensal bacteria.

Autori: Paulo Durao; Claudia Bank; Ricardo S Ramiro; Isabel Gordo
Pubblicato in: Plos Biology, Numero 2, 2020, ISSN 1544-9173
Editore: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.3000617

Solving the stochastic dynamics of population growth

Autori: L. Marrec, C. Bank, T. Bertrand
Pubblicato in: Ecology and Evolution, 2023, ISSN 2045-7758
Editore: John Wiley and Sons Ltd
DOI: 10.1002/ece3.10295