A toolbox for fitness landscapes in evolution

Projektinformationen

FIT2GO

ID Finanzhilfevereinbarung: 804569

DOI

10.3030/804569

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 19 November 2018

Startdatum 1 März 2019

Enddatum 31 August 2024

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 366 250,00

EU-Beitrag

€ 1 366 250,00

Koordiniert durch

UNIVERSITAET BERN
Switzerland

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Leistungen

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan (DMP)

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (25)

In search of the Goldilocks zone for hybrid speciation II: hard times for hybrid speciation?

Autoren: A. Blanckaert, V. Sriram, C. Bank
Veröffentlicht in: Evolution, 2023, ISSN 0014-3820
Herausgeber: Society for the Study of Evolution
DOI: 10.1093/evolut/qpad125

Adaptive Potential of Epigenetic Switching During Adaptation to Fluctuating Environments

Autoren: Dragan Stajic, Claudia Bank, Isabel Gordo
Veröffentlicht in: Genome Biology and Evolution, 2022, ISSN 1759-6653
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gbe/evac065

Challenges and pitfalls of inferring microbial growth rates from lab cultures

Autoren: Ana-Hermina Ghenu, Loïc Marrec, Claudia Bank
Veröffentlicht in: Frontiers in Ecology and Evolution, Ausgabe 11, 2024, ISSN 2296-701X
Herausgeber: frontiers
DOI: 10.3389/fevo.2023.1313500

Towards evolutionary predictions: Current promises and challenges

Autoren: Meike T. Wortel, Deepa Agashe, Susan F. Bailey, Claudia Bank, Karen Bisschop, Thomas Blankers, Johannes Cairns, Enrico Sandro Colizzi, Davide Cusseddu, Michael M. Desai, Bram van Dijk, Martijn Egas, Jacintha Ellers, Astrid T. Groot, David G. Heckel, Marcelle L. Johnson, Ken Kraaijeveld, Joachim Krug, Liedewij Laan, Michael Lässig, Peter A. Lind, Jeroen Meijer, Luke M. Noble, Samir Okasha, Paul B.
Veröffentlicht in: Evolutionary Applications, 2022, ISSN 1752-4571
Herausgeber: Wiley-Blackwell
DOI: 10.1111/eva.13513

Deleterious mutation accumulation and the long-term fate of chromosomal inversions

Autoren: Emma L. Berdan, Alexandre Blanckaert, Roger K. Butlin, Claudia Bank
Veröffentlicht in: PLOS Genetics, Ausgabe 17/3, 2021, Seite(n) e1009411, ISSN 1553-7404
Herausgeber: Plos
DOI: 10.1371/journal.pgen.1009411

Evolutionary models predict potential mechanisms of escape from mutational meltdown

Autoren: C. Bank, M.A. Schmitz, A.Y. Morales-Arce
Veröffentlicht in: Frontiers in Virology, 2022, ISSN 2673-818X
Herausgeber: Frontiers
DOI: 10.3389/fviro.2022.886655

Unpredictability of the Fitness Effects of Antimicrobial Resistance Mutations Across Environments in <i>Escherichia coli</i>

Autoren: Aaron Hinz, André Amado, Rees Kassen, Claudia Bank, Alex Wong
Veröffentlicht in: Molecular Biology and Evolution, Ausgabe 41, 2024, ISSN 0737-4038
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msae086

Dominance and multi-locus interaction

Autoren: Juan Li, Claudia Bank
Veröffentlicht in: Trends in Genetics, Ausgabe 40, 2024, Seite(n) 364-378, ISSN 0168-9525
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tig.2023.12.003

Epistasis and Adaptation on Fitness Landscapes

Autoren: Claudia Bank
Veröffentlicht in: Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics, 2022, ISSN 1545-2069
Herausgeber: Annual Reviews
DOI: 10.1146/annurev-ecolsys-102320-112153

Patterns of selection against centrosome amplification in human cell lines

Autoren: Marco António Dias Louro, Mónica Bettencourt-Dias, Claudia Bank
Veröffentlicht in: PLOS Computational Biology, Ausgabe 17/5, 2021, Seite(n) e1008765, ISSN 1553-7358
Herausgeber: Plos
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1008765

The limits to parapatric speciation 3: evolution of strong reproductive isolation in presence of gene flow despite limited ecological differentiation

Autoren: Alexandre Blanckaert, Claudia Bank, Joachim Hermisson
Veröffentlicht in: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Ausgabe 375/1806, 2020, Seite(n) 20190532, ISSN 0962-8436
Herausgeber: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rstb.2019.0532

Imbalanced segregation of recombinant haplotypes in hybrid populations reveals inter- and intrachromosomal Dobzhansky-Muller incompatibilities

Autoren: Juan Li, Molly Schumer, Claudia Bank
Veröffentlicht in: Plos Genetics, 2022, ISSN 1553-7390
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pgen.1010120

Rapid adaptation of recombining populations on tunable fitness landscapes

Autoren: J. Li, A. Amado, C. Bank
Veröffentlicht in: Molecular Ecology, 2023, ISSN 0962-1083
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/mec.16900

The role of gene presence–absence variations on genetic incompatibility in Asian rice

Autoren: Juan Li, Cheng‐Ruei Lee
Veröffentlicht in: New Phytologist, Ausgabe 239, 2023, Seite(n) 778-791, ISSN 0028-646X
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.18969

The Adaptive Potential of the Middle Domain of Yeast Hsp90

Autoren: Pamela A Cote-Hammarlof, Inês Fragata, Julia Flynn, David Mavor, Konstantin B Zeldovich, Claudia Bank, Daniel N A Bolon
Veröffentlicht in: Molecular Biology and Evolution, Ausgabe 38/2, 2020, Seite(n) 368-379, ISSN 1537-1719
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1093/molbev/msaa211

STUN: forward-time simulation on TUnable fitNess landscapes in recombining populations

Autoren: André Amado, Juan Li, Claudia Bank
Veröffentlicht in: Bioinformatics Advances, Ausgabe 3, 2023, ISSN 2635-0041
Herausgeber: Oxford Academic
DOI: 10.1093/bioadv/vbad164

Ecological tradeoffs lead to complex evolutionary trajectories and sustained diversity on dynamic fitness landscapes

Autoren: André Amado, Claudia Bank
Veröffentlicht in: Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical, Ausgabe 57, 2024, Seite(n) 195601, ISSN 1751-8113
Herausgeber: Institute of Physics Publishing
DOI: 10.1088/1751-8121/ad30d0

The extinction time under mutational meltdown driven by high mutation rates

Autoren: L. Lansch-Justen, D. Cusseddu, M.A. Schmitz, C. Bank
Veröffentlicht in: Ecology and Evolution, 2022, ISSN 2045-7758
Herausgeber: John Wiley and Sons Ltd
DOI: 10.1002/ece3.9046

Evolutionary rescue in a fluctuating environment: periodic versus quasi-periodic environmental changes

Autoren: Loïc Marrec, Claudia Bank
Veröffentlicht in: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, Ausgabe 290, 2023, ISSN 0962-8452
Herausgeber: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rspb.2023.0770

A multilocus perspective on the evolutionary dynamics of multistrain pathogens

Autoren: David V. McLeod, Claudia Bank, Sylvain Gandon
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 121, 2024, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2401578121

Understanding Admixture: Haplodiploidy to the Rescue

Autoren: Pierre Nouhaud, Alexandre Blanckaert, Claudia Bank, Jonna Kulmuni
Veröffentlicht in: Trends in Ecology & Evolution, Ausgabe 35/1, 2020, Seite(n) 34-42, ISSN 0169-5347
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tree.2019.08.013

Epistasis decreases with increasing antibiotic pressure but not temperature

Autoren: Ana-Hermina Ghenu, André Amado, Isabel Gordo, Claudia Bank
Veröffentlicht in: Philosophical Transactions B, 2023, ISSN 0962-8436
Herausgeber: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rstb.2022.0058

Comprehensive fitness maps of Hsp90 show widespread environmental dependence

Autoren: Julia M Flynn, Ammeret Rossouw, Pamela Cote-Hammarlof, Inês Fragata, David Mavor, Carl Hollins, Claudia Bank, Daniel NA Bolon
Veröffentlicht in: eLife, Ausgabe 9, 2020, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/eLife.53810

Low mutational load and high mutation rate variation in gut commensal bacteria.

Autoren: Paulo Durao; Claudia Bank; Ricardo S Ramiro; Isabel Gordo
Veröffentlicht in: Plos Biology, Ausgabe 2, 2020, ISSN 1544-9173
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.3000617

Solving the stochastic dynamics of population growth

Autoren: L. Marrec, C. Bank, T. Bertrand
Veröffentlicht in: Ecology and Evolution, 2023, ISSN 2045-7758
Herausgeber: John Wiley and Sons Ltd
DOI: 10.1002/ece3.10295