A toolbox for fitness landscapes in evolution

Informacje na temat projektu

FIT2GO

Identyfikator umowy o grant: 804569

DOI

10.3030/804569

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 19 Listopada 2018

Data rozpoczęcia 1 Marca 2019

Data zakończenia 31 Sierpnia 2024

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 366 250,00

Wkład UE

€ 1 366 250,00

Koordynowany przez

UNIVERSITAET BERN
Switzerland

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan (DMP)

Publikacje

Peer reviewed articles (25)

In search of the Goldilocks zone for hybrid speciation II: hard times for hybrid speciation?

Autorzy: A. Blanckaert, V. Sriram, C. Bank
Opublikowane w: Evolution, 2023, ISSN 0014-3820
Wydawca: Society for the Study of Evolution
DOI: 10.1093/evolut/qpad125

Adaptive Potential of Epigenetic Switching During Adaptation to Fluctuating Environments

Autorzy: Dragan Stajic, Claudia Bank, Isabel Gordo
Opublikowane w: Genome Biology and Evolution, 2022, ISSN 1759-6653
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gbe/evac065

Challenges and pitfalls of inferring microbial growth rates from lab cultures

Autorzy: Ana-Hermina Ghenu, Loïc Marrec, Claudia Bank
Opublikowane w: Frontiers in Ecology and Evolution, Numer 11, 2024, ISSN 2296-701X
Wydawca: frontiers
DOI: 10.3389/fevo.2023.1313500

Towards evolutionary predictions: Current promises and challenges

Autorzy: Meike T. Wortel, Deepa Agashe, Susan F. Bailey, Claudia Bank, Karen Bisschop, Thomas Blankers, Johannes Cairns, Enrico Sandro Colizzi, Davide Cusseddu, Michael M. Desai, Bram van Dijk, Martijn Egas, Jacintha Ellers, Astrid T. Groot, David G. Heckel, Marcelle L. Johnson, Ken Kraaijeveld, Joachim Krug, Liedewij Laan, Michael Lässig, Peter A. Lind, Jeroen Meijer, Luke M. Noble, Samir Okasha, Paul B.
Opublikowane w: Evolutionary Applications, 2022, ISSN 1752-4571
Wydawca: Wiley-Blackwell
DOI: 10.1111/eva.13513

Deleterious mutation accumulation and the long-term fate of chromosomal inversions

Autorzy: Emma L. Berdan, Alexandre Blanckaert, Roger K. Butlin, Claudia Bank
Opublikowane w: PLOS Genetics, Numer 17/3, 2021, Strona(/y) e1009411, ISSN 1553-7404
Wydawca: Plos
DOI: 10.1371/journal.pgen.1009411

Evolutionary models predict potential mechanisms of escape from mutational meltdown

Autorzy: C. Bank, M.A. Schmitz, A.Y. Morales-Arce
Opublikowane w: Frontiers in Virology, 2022, ISSN 2673-818X
Wydawca: Frontiers
DOI: 10.3389/fviro.2022.886655

Unpredictability of the Fitness Effects of Antimicrobial Resistance Mutations Across Environments in <i>Escherichia coli</i>

Autorzy: Aaron Hinz, André Amado, Rees Kassen, Claudia Bank, Alex Wong
Opublikowane w: Molecular Biology and Evolution, Numer 41, 2024, ISSN 0737-4038
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msae086

Dominance and multi-locus interaction

Autorzy: Juan Li, Claudia Bank
Opublikowane w: Trends in Genetics, Numer 40, 2024, Strona(/y) 364-378, ISSN 0168-9525
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tig.2023.12.003

Epistasis and Adaptation on Fitness Landscapes

Autorzy: Claudia Bank
Opublikowane w: Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics, 2022, ISSN 1545-2069
Wydawca: Annual Reviews
DOI: 10.1146/annurev-ecolsys-102320-112153

Patterns of selection against centrosome amplification in human cell lines

Autorzy: Marco António Dias Louro, Mónica Bettencourt-Dias, Claudia Bank
Opublikowane w: PLOS Computational Biology, Numer 17/5, 2021, Strona(/y) e1008765, ISSN 1553-7358
Wydawca: Plos
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1008765

The limits to parapatric speciation 3: evolution of strong reproductive isolation in presence of gene flow despite limited ecological differentiation

Autorzy: Alexandre Blanckaert, Claudia Bank, Joachim Hermisson
Opublikowane w: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Numer 375/1806, 2020, Strona(/y) 20190532, ISSN 0962-8436
Wydawca: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rstb.2019.0532

Imbalanced segregation of recombinant haplotypes in hybrid populations reveals inter- and intrachromosomal Dobzhansky-Muller incompatibilities

Autorzy: Juan Li, Molly Schumer, Claudia Bank
Opublikowane w: Plos Genetics, 2022, ISSN 1553-7390
Wydawca: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pgen.1010120

Rapid adaptation of recombining populations on tunable fitness landscapes

Autorzy: J. Li, A. Amado, C. Bank
Opublikowane w: Molecular Ecology, 2023, ISSN 0962-1083
Wydawca: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/mec.16900

The role of gene presence–absence variations on genetic incompatibility in Asian rice

Autorzy: Juan Li, Cheng‐Ruei Lee
Opublikowane w: New Phytologist, Numer 239, 2023, Strona(/y) 778-791, ISSN 0028-646X
Wydawca: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.18969

The Adaptive Potential of the Middle Domain of Yeast Hsp90

Autorzy: Pamela A Cote-Hammarlof, Inês Fragata, Julia Flynn, David Mavor, Konstantin B Zeldovich, Claudia Bank, Daniel N A Bolon
Opublikowane w: Molecular Biology and Evolution, Numer 38/2, 2020, Strona(/y) 368-379, ISSN 1537-1719
Wydawca: Wiley
DOI: 10.1093/molbev/msaa211

STUN: forward-time simulation on TUnable fitNess landscapes in recombining populations

Autorzy: André Amado, Juan Li, Claudia Bank
Opublikowane w: Bioinformatics Advances, Numer 3, 2023, ISSN 2635-0041
Wydawca: Oxford Academic
DOI: 10.1093/bioadv/vbad164

Ecological tradeoffs lead to complex evolutionary trajectories and sustained diversity on dynamic fitness landscapes

Autorzy: André Amado, Claudia Bank
Opublikowane w: Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical, Numer 57, 2024, Strona(/y) 195601, ISSN 1751-8113
Wydawca: Institute of Physics Publishing
DOI: 10.1088/1751-8121/ad30d0

The extinction time under mutational meltdown driven by high mutation rates

Autorzy: L. Lansch-Justen, D. Cusseddu, M.A. Schmitz, C. Bank
Opublikowane w: Ecology and Evolution, 2022, ISSN 2045-7758
Wydawca: John Wiley and Sons Ltd
DOI: 10.1002/ece3.9046

Evolutionary rescue in a fluctuating environment: periodic versus quasi-periodic environmental changes

Autorzy: Loïc Marrec, Claudia Bank
Opublikowane w: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, Numer 290, 2023, ISSN 0962-8452
Wydawca: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rspb.2023.0770

A multilocus perspective on the evolutionary dynamics of multistrain pathogens

Autorzy: David V. McLeod, Claudia Bank, Sylvain Gandon
Opublikowane w: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numer 121, 2024, ISSN 0027-8424
Wydawca: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2401578121

Understanding Admixture: Haplodiploidy to the Rescue

Autorzy: Pierre Nouhaud, Alexandre Blanckaert, Claudia Bank, Jonna Kulmuni
Opublikowane w: Trends in Ecology & Evolution, Numer 35/1, 2020, Strona(/y) 34-42, ISSN 0169-5347
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tree.2019.08.013

Epistasis decreases with increasing antibiotic pressure but not temperature

Autorzy: Ana-Hermina Ghenu, André Amado, Isabel Gordo, Claudia Bank
Opublikowane w: Philosophical Transactions B, 2023, ISSN 0962-8436
Wydawca: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rstb.2022.0058

Comprehensive fitness maps of Hsp90 show widespread environmental dependence

Autorzy: Julia M Flynn, Ammeret Rossouw, Pamela Cote-Hammarlof, Inês Fragata, David Mavor, Carl Hollins, Claudia Bank, Daniel NA Bolon
Opublikowane w: eLife, Numer 9, 2020, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/eLife.53810

Low mutational load and high mutation rate variation in gut commensal bacteria.

Autorzy: Paulo Durao; Claudia Bank; Ricardo S Ramiro; Isabel Gordo
Opublikowane w: Plos Biology, Numer 2, 2020, ISSN 1544-9173
Wydawca: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.3000617

Solving the stochastic dynamics of population growth

Autorzy: L. Marrec, C. Bank, T. Bertrand
Opublikowane w: Ecology and Evolution, 2023, ISSN 2045-7758
Wydawca: John Wiley and Sons Ltd
DOI: 10.1002/ece3.10295