Next generation variety testing for improved cropping on European farmland

Leistungen

Researcher focussed website established - M30

LESP will develop a researcherfocused website that will allow researchers to query modify and update variety data and information Month 30

Road map reports detailing how new methods could be applied to each selected crop type

This report will provide a road map on how new methods could be applied to the crop subset Collaboration with INVITE is anticipated in the task relating to this report

Veröffentlichungen

Analysis of the chromosomal clustering of Fusarium-responsive wheat genes uncovers new players in the defence against head blight disease

Autoren: Alexandre Perochon, Harriet R. Benbow, Katarzyna Ślęczka-Brady, Keshav B. Malla, Fiona M. Doohan
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 11/1, 2021, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-021-86362-4

TrainSel: An R Package for Selection of Training Populations

Autoren: Deniz Akdemir, Simon Rio, Julio Isidro y Sánchez
Veröffentlicht in: Frontiers in Genetics, Ausgabe 12, 2021, ISSN 1664-8021
Herausgeber: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fgene.2021.655287

Genotype by Environment Interaction Analysis of Agronomic Spring Barley Traits in Iceland Using AMMI, Factorial Regression Model and Linear Mixed Model

Autoren: Hrannar Smári Hilmarsson, Simon Rio, Julio Isidro y Sánchez
Veröffentlicht in: Agronomy, Ausgabe 11/3, 2021, Seite(n) 499, ISSN 2073-4395
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/agronomy11030499

Modelling Excess Zeros in Count Data: A New Perspective on Modelling Approaches

Autoren: John Haslett; Andrew C. Parnell; John Hinde; Rafael de Andrade Moral
Veröffentlicht in: International Statistical Review, Ausgabe 2, 2021, ISSN 0306-7734
Herausgeber: International Statistical Institute
DOI: 10.1111/insr.12479

Evaluation of the susceptibility of modern, wild, ancestral, and mutational wheat lines to Septoria tritici blotch disease

Autoren: Sobia Ajaz, Harriet R. Benbow, Thalia Christodoulou, Cristobal Uauy, Fiona M. Doohan
Veröffentlicht in: Plant Pathology, Ausgabe 70/5, 2021, Seite(n) 1123-1137, ISSN 0032-0862
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/ppa.13369

Comprehensive analysis of pathogen-responsive wheat NAC transcription factors: new candidates for crop improvement

Autoren: Monika Vranic, Alexandre Perochon, Harriet Benbow, Fiona M Doohan
Veröffentlicht in: G3 Genes|Genomes|Genetics, 2022, ISSN 2160-1836
Herausgeber: Genetics Society of America
DOI: 10.1093/g3journal/jkac247

Bayesian multi-species N-mixture models for unmarked animal communities

Autoren: Niamh Mimnagh, Andrew Parnell, Estevão Prado, Rafael de Andrade Moral
Veröffentlicht in: Environmental and Ecological Statistics, Ausgabe 29, 2022, Seite(n) 755-778, ISSN 1352-8505
Herausgeber: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s10651-022-00542-7

Genomic prediction and training set optimization in a structured Mediterranean oat population.

Autoren: Simon Rio; Luis M. Gallego-Sánchez; Gracia Montilla-Bascón; Francisco José Canales; Julio Isidro y Sánchez; Elena Prats
Veröffentlicht in: Theoretical and Applied Genetics volume, Ausgabe 134, 2021, ISSN 0040-5752
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00122-021-03916-w

Transcriptional Profiling Reveals the Wheat Defences against Fusarium Head Blight Disease Regulated by a NAC Transcription Factor

Autoren: Monika Vranić; Alexandre Perochon; Fiona M. Doohan
Veröffentlicht in: Plants, Ausgabe 12, 2023, ISSN 2223-7747
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/plants12142708

Training Set Optimization for Sparse Phenotyping in Genomic Selection: A Conceptual Overview

Autoren: Julio Isidro y Sánchez, Deniz Akdemir
Veröffentlicht in: Frontiers in Plant Science, Ausgabe 12, 2021, ISSN 1664-462X
Herausgeber: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fpls.2021.715910

GP-BART: A novel Bayesian additive regression trees approach using Gaussian processes

Autoren: Mateus Maia, Keefe Murphy, Andrew C. Parnell
Veröffentlicht in: Computational Statistics & Data Analysis, Ausgabe 190, 2024, Seite(n) 107858, ISSN 0167-9473
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.csda.2023.107858

Assessment of genomic prediction reliability and optimization of experimental designs in multi-environment trials

Autoren: Simon Rio; Deniz Akdemir; Tiago Carvalho; Julio Isidro y Sánchez
Veröffentlicht in: Theoretical and Applied Genetics, Ausgabe 2, 2022, ISSN 0040-5752
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00122-021-03972-2

Visualizing Variable Importance and Variable Interaction Effects in Machine Learning Models

Autoren: Alan Inglis; Andrew C. Parnell; Catherine B. Hurley
Veröffentlicht in: Journal of Computational and Graphical Statistics, Ausgabe 2, 2021, ISSN 1061-8600
Herausgeber: American Statistical Association
DOI: 10.48550/arxiv.2108.04310

Changes in the Rhizosphere Biome Depending on the Variety of Wheat, Timing of Its Growing Season, and Agrochemical Components in the Soils of Italy

Autoren: Tommaso Bardelli, Flavio Fornasier, Elena Novarina, Antonella Donniacuo, Elio Romano, Pier Giacomo Bianchi, Anna Pia Maria Giulini
Veröffentlicht in: Agronomy, Ausgabe 14, 2024, Seite(n) 832, ISSN 2073-4395
Herausgeber: MDPI
DOI: 10.3390/agronomy14040832

Pollen Geochronology from the Atlantic Coast of the United States during the Last 500 Years

Autoren: Margaret Christie, Christopher Bernhardt, Andrew Parnell, Timothy Shaw, Nicole Khan, D. Corbett, Ane García-Artola, Jennifer Clear, Jennifer Walker, Jeffrey Donnelly, Tobias Hasse, Benjamin Horton
Veröffentlicht in: Water, Ausgabe 13/3, 2021, Seite(n) 362, ISSN 2073-4441
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/w13030362

Towards a Digital Twin of the Earth System: Geo-Soft-CoRe, a Geoscientific Software & Code Repository

Autoren: Irene DeFelipe; Juan Alcalde; Eldar Baykiev; Isabel Bernal; Kittiphon Boonma; Ramon Carbonell; Stephanie Flude; Arnau Folch; Javier Fullea; Daniel García-Castellanos; Adelina Geyer; Santiago Giralt; Armand Hernández; Ivone Jiménez-Munt; Ajay Kumar; Maria-Gema Llorens; Joan Martí; Cecilia Molina; Andrés Olivar-Castaño; Andrew Parnell; Martin Schimmel; Montserrat Torné; Sergi Ventosa
Veröffentlicht in: Frontiers in Earth Science, Ausgabe 10, 2022, ISSN 2296-6463
Herausgeber: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/feart.2022.828005

Visualisations for Bayesian Additive Regression Trees

Autoren: Alan Inglis, Andrew Parnell, Catherine Hurley
Veröffentlicht in: Journal of Data Science, Statistics, and Visualisation, Ausgabe 4, 2024, ISSN 2773-0689
Herausgeber: IASC
DOI: 10.52933/jdssv.v4i1.79

AFBI Science Impacts 2021: InnoVar: Next generation variety testing for improved cropping on European farmland

Autoren: Gareth Burns, Lisa Black
Veröffentlicht in: AFBI Science Impacts, 2021
Herausgeber: AFBI

How InterTradeIreland helped InnoVar secure H2020 funding

Autoren: Lisa Black, Fiona Doohan, Elaine Groom, IntertradeIreland
Veröffentlicht in: 2020
Herausgeber: Intertrade Ireland

InnoVar Kicks Off!

Autoren: Lisa Black, Hazel Brown, Gerry Hoppe
Veröffentlicht in: 2019
Herausgeber: AFBI

Tystoftes deltagelse i EU projektet InnoVar

Autoren: Preben Klarskov Hansen
Veröffentlicht in: 2020
Herausgeber: Tystoftefonden

Fænotypiske forskelle mellem sorter EU projektet InnoVar

Autoren: Preben Klarskov Hansen
Veröffentlicht in: 2020
Herausgeber: Tystofte

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Veröffentlichungen

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