Repurposing small RNA from ciliates for genome editing: single-molecule study

Projektinformationen

MIGHTY_RNA

ID Finanzhilfevereinbarung: 819299

DOI 10.3030/819299

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 18 Dezember 2018

Startdatum 1 Mai 2019

Enddatum 30 April 2024

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten € 1 792 850,00

EU-Beitrag € 1 792 850,00

Koordiniert durch

TECHNISCHE UNIVERSITEIT DELFT
Niederlande

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Veröffentlichungen

Fachlich begutachtete Artikel (8)

the road to next-generation single-molecule biophysics

Autoren: Severins, I.W.H.; Joo, C.; Noort, S.J.T. van
Veröffentlicht in: Molecular Cell, Ausgabe 4, 2022, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2022.04.024

RNA-guided RNA silencing by an Asgard archaeal Argonaute

Autoren: Carolien Bastiaanssen, Pilar Bobadilla Ugarte, Kijun Kim, Giada Finocchio, Yanlei Feng, Todd A. Anzelon, Stephan Köstlbacher, Daniel Tamarit, Thijs J. G. Ettema, Martin Jinek, Ian J. MacRae, Chirlmin Joo, Daan C. Swarts & Fabai Wu
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 15, 2024, Seite(n) 5499, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-49452-1

mRNA structural dynamics shape Argonaute-target interactions

Autoren: Suzan Ruijtenberg, Stijn Sonneveld, Tao Ju Cui, Ive Logister, Dion de Steenwinkel, Yao Xiao, Ian J. MacRae, Chirlmin Joo, Marvin E. Tanenbaum
Veröffentlicht in: Nature Structural & Molecular Biology, Ausgabe 27/9, 2020, Seite(n) 790-801, ISSN 1545-9993
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-020-0461-1

High-Speed Super-Resolution Imaging Using Protein-Assisted DNA-PAINT

Autoren: Mike Filius, Tao Ju Cui, Adithya N. Ananth, Margreet W. Docter, Jorrit W. Hegge, John van der Oost, Chirlmin Joo
Veröffentlicht in: Nano Letters, Ausgabe 20/4, 2020, Seite(n) 2264-2270, ISSN 1530-6984
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.nanolett.9b04277

FRET-based dynamic structural biology: Challenges, perspectives and an appeal for open-science practices

Autoren: Lerner, Eitan; Barth, Anders; Hendrix, Jelle; Ambrose, Benjamin; Birkedal, Victoria; Blanchard, Scott C.; Börner, Richard; Chung, Hoi Sung; Cordes, Thorben; Craggs, Timothy D.; Deniz, Ashok A.; Diao, Jiajia; Fei, Jingyi; Gonzalez, Ruben L.; Gopich, Irina V.; Ha, Taekjip; Hanke, Christian A.; Haran, Gilad; Hatzakis, Nikos S.; Hohng, Sungchul; Hong, Seok Cheol; Hugel, Thorsten; Ingargiola, Antonino
Veröffentlicht in: eLife, Ausgabe 2, 2021, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.60416

Argonaute bypasses cellular obstacles without hindrance during target search

Autoren: Tao Ju Cui, Misha Klein, Jorrit W. Hegge, Stanley D. Chandradoss, John van der Oost, Martin Depken, Chirlmin Joo
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-12415-y

Targeting G-quadruplex Forming Sequences with Cas9

Autoren: Hamza Balci; Hamza Balci; Viktorija Globyte; Chirlmin Joo
Veröffentlicht in: ACS Chemical Biology, Ausgabe 2, 2021, ISSN 1554-8929
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1101/2020.09.19.304816

Small RNA-directed DNA elimination: the molecular mechanism and its potential for genome editing.

Autoren: C.K.J.M.L. Bastiaanssen; Chirlmin Joo
Veröffentlicht in: RNA Biology, Ausgabe 2, 2021, ISSN 1547-6286
Herausgeber: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/15476286.2021.1885208