Repurposing small RNA from ciliates for genome editing: single-molecule study

Informazioni relative al progetto

MIGHTY_RNA

ID dell’accordo di sovvenzione: 819299

DOI

10.3030/819299

Progetto chiuso

Data della firma CE 18 Dicembre 2018

Data di avvio 1 Maggio 2019

Data di completamento 30 Aprile 2024

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 792 850,00

Contributo UE

€ 1 792 850,00

Coordinato da

TECHNISCHE UNIVERSITEIT DELFT
Netherlands

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Pubblicazioni

Peer reviewed articles (8)

the road to next-generation single-molecule biophysics

Autori: Severins, I.W.H.; Joo, C.; Noort, S.J.T. van
Pubblicato in: Molecular Cell, Numero 4, 2022, ISSN 1097-2765
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2022.04.024

RNA-guided RNA silencing by an Asgard archaeal Argonaute

Autori: Carolien Bastiaanssen, Pilar Bobadilla Ugarte, Kijun Kim, Giada Finocchio, Yanlei Feng, Todd A. Anzelon, Stephan Köstlbacher, Daniel Tamarit, Thijs J. G. Ettema, Martin Jinek, Ian J. MacRae, Chirlmin Joo, Daan C. Swarts & Fabai Wu
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 15, 2024, Pagina/e 5499, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-49452-1

mRNA structural dynamics shape Argonaute-target interactions

Autori: Suzan Ruijtenberg, Stijn Sonneveld, Tao Ju Cui, Ive Logister, Dion de Steenwinkel, Yao Xiao, Ian J. MacRae, Chirlmin Joo, Marvin E. Tanenbaum
Pubblicato in: Nature Structural & Molecular Biology, Numero 27/9, 2020, Pagina/e 790-801, ISSN 1545-9993
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-020-0461-1

High-Speed Super-Resolution Imaging Using Protein-Assisted DNA-PAINT

Autori: Mike Filius, Tao Ju Cui, Adithya N. Ananth, Margreet W. Docter, Jorrit W. Hegge, John van der Oost, Chirlmin Joo
Pubblicato in: Nano Letters, Numero 20/4, 2020, Pagina/e 2264-2270, ISSN 1530-6984
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.nanolett.9b04277

FRET-based dynamic structural biology: Challenges, perspectives and an appeal for open-science practices

Autori: Lerner, Eitan; Barth, Anders; Hendrix, Jelle; Ambrose, Benjamin; Birkedal, Victoria; Blanchard, Scott C.; Börner, Richard; Chung, Hoi Sung; Cordes, Thorben; Craggs, Timothy D.; Deniz, Ashok A.; Diao, Jiajia; Fei, Jingyi; Gonzalez, Ruben L.; Gopich, Irina V.; Ha, Taekjip; Hanke, Christian A.; Haran, Gilad; Hatzakis, Nikos S.; Hohng, Sungchul; Hong, Seok Cheol; Hugel, Thorsten; Ingargiola, Antonino
Pubblicato in: eLife, Numero 2, 2021, ISSN 2050-084X
Editore: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.60416

Argonaute bypasses cellular obstacles without hindrance during target search

Autori: Tao Ju Cui, Misha Klein, Jorrit W. Hegge, Stanley D. Chandradoss, John van der Oost, Martin Depken, Chirlmin Joo
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-12415-y

Targeting G-quadruplex Forming Sequences with Cas9

Autori: Hamza Balci; Hamza Balci; Viktorija Globyte; Chirlmin Joo
Pubblicato in: ACS Chemical Biology, Numero 2, 2021, ISSN 1554-8929
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1101/2020.09.19.304816

Small RNA-directed DNA elimination: the molecular mechanism and its potential for genome editing.

Autori: C.K.J.M.L. Bastiaanssen; Chirlmin Joo
Pubblicato in: RNA Biology, Numero 2, 2021, ISSN 1547-6286
Editore: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/15476286.2021.1885208