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Deciphering and predicting the evolution of cancer cell populations

Descrizione del progetto

Una tecnologia di sequenziamento innovativa per l’analisi dell’evoluzione del cancro

È risaputo che i tumori subiscono un’evoluzione, dando origine a diversi cloni genetici durante il proprio ciclo di vita. Il progetto CANCEREVO, finanziato dall’UE, si dedica alla comprensione delle dinamiche di tali mutamenti e delle loro ramificazioni a livello clinico. A questo proposito, alcuni scienziati studieranno il DNA tumorale circolante (ctDNA) proveniente da carcinomi gastro-esofagei metastatici utilizzando una tecnologia innovativa per il sequenziamento profondo dell’esoma. Questa tecnologia fornisce la sensibilità necessaria per il rilevamento di subcloni tumorali rari e il tracciamento dell’evoluzione dell’intera popolazione delle cellule tumorali. Tuttavia, l’aspetto più importante è che questa tecnologia può essere impiegata sia in ambito clinico che per la previsione dei meccanismi di resistenza ai farmaci per la chemioterapia e l’immunoterapia.

Obiettivo

The fundamental evolutionary nature of cancer is well recognized but an understanding of the dynamic evolutionary changes occurring throughout a tumour’s lifetime and their clinical implications is in its infancy. Current approaches to reveal cancer evolution by sequencing of multiple biopsies remain of limited use in the clinic due to sample access problems in multi-metastatic disease. Circulating tumour DNA (ctDNA) is thought to comprehensively sample subclones across metastatic sites. However, available technologies either have high sensitivity but are restricted to the analysis of small gene panels or they allow sequencing of large target regions such as exomes but with too limited sensitivity to detect rare subclones. We developed a novel error corrected sequencing technology that will be applied to perform deep exome sequencing on longitudinal ctDNA samples from highly heterogeneous metastatic gastro-oesophageal carcinomas. This will track the evolution of the entire cancer population over the lifetime of these tumours, from metastatic disease over drug therapy to end-stage disease and enable ground breaking insights into cancer population evolution rules and mechanisms. Specifically, we will: 1. Define the genomic landscape and drivers of metastatic and end stage disease. 2. Understand the rules of cancer evolutionary dynamics of entire cancer cell populations. 3. Predict cancer evolution and define the limits of predictability. 4. Rapidly identify drug resistance mechanisms to chemo- and immunotherapy based on signals of Darwinian selection such as parallel and convergent evolution. Our sequencing technology and analysis framework will also transform the way cancer evolution metrics can be accessed and interpreted in the clinic which will have major impacts, ranging from better biomarkers to predict cancer evolution to the identification of drug targets that drive disease progression and therapy resistance.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

ERC-COG - Consolidator Grant

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) ERC-2018-COG

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Istituzione ospitante

QUEEN MARY UNIVERSITY OF LONDON
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 1 250 303,75
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 1 250 303,75

Beneficiari (2)

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