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Deciphering the mechanisms of antiviral RNA interference in mammals

Descripción del proyecto

La ribointerferencia como arma antivírica en mamíferos

La ribointerferencia (iARN, o RNAi por sus siglas en inglés) es un mecanismo biológico muy conservado que suprime la expresión génica. En este proceso participan moléculas pequeñas de ARN que se unen a los ARN diana y los degradan. La iARN se describió originalmente como un mecanismo de defensa contra virus en gusanos, plantas e insectos, pero su papel en mamíferos sigue siendo controvertido. El objetivo del proyecto UncoveRNAi, financiado con fondos europeos, es identificar dónde y cómo tiene lugar el mecanismo de iARN antivírica en mamíferos. Los resultados proporcionarán información relevante sobre la importancia «in vivo» de la iARN como mecanismo antivírico en comparación con los interferones de tipo I, responsables de organizar las respuestas antivíricas en mamíferos.

Objetivo

Organisms such as plants, worms or insects rely on RNA interference (RNAi) to mount an antiviral immune response. On the other hand, it is widely believed that the type I interferon (IFN-I) pathway replaced antiviral RNAi as a primary line of defence against viral infections in chordates. However, recent work from multiple teams, including the host laboratory, has described a possible antiviral role for RNAi in cultured mammalian cells and in mice during infection with different RNA viruses. The importance of RNAi as an antiviral mechanism in mammals remains a matter of great controversy, in part due to a dearth of in vivo studies. In particular, the cell type(s) performing RNAi in vivo remains unknown, as is the relative importance of antiviral RNAi compare to the IFN-I response. I propose to decipher the mechanism and importance of antiviral RNAi in mice, by answering three main questions: 1) Where is antiviral RNAi happening? I will identify cell types implicated in antiviral RNAi using reporter viruses and permanent genetic marking of RNAi-competent cells. In parallel with these unbiased approaches, I will study antiviral immune responses in specific cell types likely to rely on antiviral RNAi, such as stem cells. 2) How is antiviral RNAi happening? I hypothesise that antiviral RNAi relies on truncated isoforms of Dicer expressed in specific cell types, and/or production of viral DNA as a means of boosting the RNAi response. I will explore both possibilities in detail. 3) What is the importance of antiviral RNAi? I will specifically ablate antiviral RNAi in cell niches that use this defence mechanism to assess its importance with respect to IFN-I. Overall, my work aims at dissecting antiviral RNAi pathways in mammals and assessing their in vivo significance. This work will provide answers to important questions in the field of antiviral immunity and will potentially open up new areas of research in human health.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véase: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Régimen de financiación

MSCA-IF-EF-ST -

Coordinador

THE FRANCIS CRICK INSTITUTE LIMITED
Aportación neta de la UEn
€ 212 933,76
Dirección
1 MIDLAND ROAD
NW1 1AT London
Reino Unido

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Región
London Inner London — West Camden and City of London
Tipo de actividad
Organismos de investigación
Enlaces
Coste total
€ 212 933,76
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