Descrizione del progetto
Chiarire la struttura e la funzione degli elementi di regolazione del DNA
Gli elementi di regolazione del DNA sono implicati nella regolazione dell’espressione genica attraverso il reclutamento dei fattori di trascrizione come enhancer o il mantenimento della struttura tridimensionale della cromatina. I progressi nell’editing genomico hanno permesso una particolareggiata caratterizzazione degli elementi di regolazione del DNA con modalità mai utilizzate prima. Gli scienziati del progetto Breakborder, finanziato dall’UE, hanno identificato enhancer oncogeni e di soppressione tumorale e intendono ampliare la loro strategia agli elementi di regolazione del DNA strutturali. La logica è quella di stabilire il ruolo dell’architettura della cromatina nell’espressione genica e individuare i principali fattori della proliferazione, della differenziazione e della sopravvivenza cellulare. Inoltre, il progetto fornirà informazioni sull’impatto delle aberrazioni genetiche degli elementi di regolazione del DNA nell’insorgenza del cancro.
Obiettivo
The human genome carries genetic information in two distinct forms: Transcribed genes and regulatory DNA elements (rDEs). rDEs control the magnitude and pattern of gene expression, and are indispensable for organismal development and cellular homeostasis. Nevertheless, while large-scale functional genetic screens greatly advanced our knowledge in studying mammalian genes, such tools to study rDEs were lacking, impeding scientific progress. Interestingly, recent advance in genome editing technologies has not only expanded the available screening toolbox to examine genes, but also opened up novel opportunities in studying rDEs. We distinguish two types of rDEs: Transcriptional rDEs that recruit transcription factors to enhancers, and structural rDEs that maintain chromatin 3D structure to insulate transcriptional activities, a feature postulated to be essential for gene expression regulation by enhancers. Recently, we developed a CRISPR strategy to target enhancers. We showed its scalability and effectivity in identifying potential oncogenic and tumour-suppressive enhancers. Here, we will exploit this line of research and develop novel strategies to target structural rDEs (e.g. insulators). By setting up functional genetic screens, we will identify key players in cell proliferation, differentiation, and survival, which are related to cancer development, metastasis induction, and acquired therapy resistance. We will validate key insulators and decipher underlying mechanisms of action that control phenotypes. In a parallel approach, we will analyse whole genome sequencing datasets of cancer to identify and characterize genetic aberrations occurring in the identified regions. Altogether, the outlined research plan forms a natural extension of our successful functional approaches to study gene regulation. Our results will setup the foundation to better understand principles of chromatin architecture in gene expression regulation in development and cancer.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze mediche e della salute medicina clinica oncologia
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
- scienze mediche e della salute medicina di base fisiologia omeostasi
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
ERC-ADG - Advanced Grant
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2018-ADG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
1066 CX AMSTERDAM
Paesi Bassi
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.