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Mechanism of ATP Dependent Chromatin Modelling and Editing by INO80 Remodellers

Descripción del proyecto

Estudio detallado de la remodelación de la cromatina

Las largas cadenas de ADN que forman los cromosomas están envueltas alrededor de proteínas, de forma parecida al hilo en un carrete, para que quepan en el núcleo. Esta forma condensada de ADN se llama cromatina. Para que se den la transcripción y la división celular, la cromatina se «remodela» a fin de facilitar el acceso al ADN. Se trata de un paso crítico en el desarrollo, la diferenciación celular y algunos procesos patológicos como el cáncer. Sin embargo, no se conocen bien sus mecanismos debido a la complejidad estructural de las moléculas. INO3D está utilizando la criomicroscopía electrónica de transmisión (cryo-TEM) ganadora de un Nobel para permitir explorar las estructuras biológicas a escala atómica durante la remodelación de la cromatina por parte de la molécula INO80. Los resultados podrían proporcionar los primeros atisbos de INO80 en acción.

Objetivo

Nucleosomes, ~147 base pairs of DNA wrapped around an histone protein octamer, package and protect nuclear DNA but also carry important biological information. The position and composition of nucleosomes along chromosomal DNA is a key element of defining the state and identity of a cell. Chromatin remodellers are ATP dependent molecular machines that position, move or edit nucleosomes in a genome wide manner. Collectively, they shape the nucleosome landscape and play central roles in the maintenance and differentiation of cells, but also in pathological transformations. INO80, a megadalton large remodeller consisting of 15 or more subunits, is involved in replication, gene expression and DNA repair. It models chromatin by positioning barrier nucleosomes around nucleosome free regions, editing nucleosomes and generating nucleosome arrays. However, structural mechanisms for INO80 and other remodelling machines are poorly understood due to their complexity. To provide a comprehensive mechanistic framework, to understand how INO80 senses nucleosome free regions to position barrier nucleosomes and how it generates arrays or senses DNA breaks, I propose a challenging but ground-breaking endeavour using a combination of cryo-EM and functional approaches. We address structures of fungal and human INO80 complexes at promoter regions, on di-nucleosomes and at DNA ends and develop quantitative positioning assays to reveal common and distinct features of shaping chromatin in different species. We also explore cryo-EM as tool towards revealing distinct steps the chemo-mechanical remodelling reactions. The proposed research will help derive fundamental molecular principles underlying the modelling of the nucleosome landscape.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

ERC-ADG - Advanced Grant

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Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2018-ADG

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Institución de acogida

LUDWIG-MAXIMILIANS-UNIVERSITAET MUENCHEN
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 2 201 875,00
Dirección
GESCHWISTER SCHOLL PLATZ 1
80539 MUNCHEN
Alemania

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Región
Bayern Oberbayern München, Kreisfreie Stadt
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

€ 2 201 875,00

Beneficiarios (1)

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