Mechanism of ATP Dependent Chromatin Modelling and Editing by INO80 Remodellers

Información del proyecto

INO3D

Identificador del acuerdo de subvención: 833613

DOI

10.3030/833613

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 29 Mayo 2019

Fecha de inicio 1 Octubre 2019

Fecha de finalización 30 Septiembre 2025

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 2 201 875,00

Aportación de la UE

€ 2 201 875,00

Coordinado por

LUDWIG-MAXIMILIANS-UNIVERSITAET MUENCHEN
Germany

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Publicaciones

Peer reviewed articles (9)

Hexasome-INO80 complex reveals structural basis of noncanonical nucleosome remodeling

Autores: Zhang M, Jungblut A, Kunert F, Hauptmann L, Hoffmann T, Kolesnikova O, Metzner F, Moldt M, Weis F, DiMaio F, Hopfner KP, Eustermann S.
Publicado en: Science, 2023, ISSN 0036-8075
Editor: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.adf6287

Megadalton chromatin remodelers: common principles for versatile functions.

Autores: Anna Jungblut; Sebastian Eustermann; Karl-Peter Hopfner
Publicado en: Current Opinion Struct Biol, Edición 1, 2020, ISSN 0959-440X
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2020.06.024

Structural mechanism of extranucleosomal DNA readout by the INO80 complex

Autores: Franziska Kunert; Felix J. Metzner; James Jung; Markus Höpfler; Stephan Woike; Kevin Schall; Dirk Kostrewa; Manuela Moldt; Jia-Xuan Chen; Susanne Bantele; Boris Pfander; Sebastian Eustermann; Karl-Peter Hopfner
Publicado en: Science Advances, Edición 1, 2022, ISSN 2375-2548
Editor: AAAS
DOI: 10.1126/sciadv.add3189

A SAM-key domain required for enzymatic activity of the Fun30 nucleosome remodeler

Autores: Karl, Leonhard A; Galanti, Lorenzo; Bantele, Susanne CS; Metzner, Felix; Šafarić, Barbara; Rajappa, Lional; Foster, Benjamin; Borges Pires, Vanessa; Bansal, Priyanka; Chacin, Erika; Basquin, Jerôme; Duderstadt, Karl E; Kurat, Christoph F; Bartke, Till; Hopfner, Karl-Peter; Pfander, Boris
Publicado en: Life Science Alliance, Edición 1, 2023, ISSN 2575-1077
Editor: Life Science Alliance LLC
DOI: 10.26508/lsa.202201790

Measuring DNA mechanics on the genome scale

Autores: Aakash Basu, Dmitriy G. Bobrovnikov, Zan Qureshi, Tunc Kayikcioglu, Thuy T. M. Ngo, Anand Ranjan, Sebastian Eustermann, Basilio Cieza, Michael T. Morgan, Miroslav Hejna, H. Tomas Rube, Karl-Peter Hopfner, Cynthia Wolberger, Jun S. Song, Taekjip Ha
Publicado en: Nature, Edición 589/7842, 2021, Página(s) 462-467, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-03052-3

Structural basis for TBP displacement from TATA box DNA by the Swi2/Snf2 ATPase Mot1

Autores: Woike S, Eustermann S, Jung J, Wenzl SJ, Hagemann G, Bartho J, Lammens K, Butryn A, Herzog F, Hopfner KP
Publicado en: Nature Structural & Molecular Biology, 2023, ISSN 1545-9993
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-023-00966-0

Ruler elements in chromatin remodelers set nucleosome array spacing and phasing

Autores: Elisa Oberbeckmann, Vanessa Niebauer, Shinya Watanabe, Lucas Farnung, Manuela Moldt, Andrea Schmid, Patrick Cramer, Craig L. Peterson, Sebastian Eustermann, Karl-Peter Hopfner, Philipp Korber
Publicado en: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2020.02.28.969618

Structural basis for human OGG1 processing 8-oxodGuo within nucleosome core particles

Autores: Mengtian Ren, Fabian Gut, Yilan Fan, Jingke Ma, Xiajing Shan, Aysenur Yikilmazsoy, Mariia Likhodeeva, Karl-Peter Hopfner, Chuanzheng Zhou
Publicado en: Nature Communications, Edición 15, 2024, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-53811-3

Genome information processing by the INO80 chromatin remodeler positions nucleosomes

Autores: Elisa Oberbeckmann, Nils Krietenstein, Vanessa Niebauer, Yingfei Wang, Kevin Schall, Manuela Moldt, Tobias Straub, Remo Rohs, Karl-Peter Hopfner, Philipp Korber, Sebastian Eustermann
Publicado en: Nature Communications, 2021, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2020.11.03.366690

Other (3)

Recognition and remodelling of nucleosomes and hexasomes by the human INO80 complex

Autores: Priyanka Aggarwal, Manmohan Sharma, Stephan Woike, Franziska Kunert, Manuela Moldt, Karl-Peter Hopfner
Publicado en: BioRxiv, 2025
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2025.08.25.671740

Sequence- and chemical specificity define the functional landscape of intrinsically disordered regions

Autores: Iris Langstein-Skora, Andrea Schmid, Frauke Huth, Drin Shabani, Lorenz Spechtenhauser, Mariia Likhodeeva, Franziska Kunert, Felix J. Metzner, Ryan J. Emenecker, Mary O.G. Richardson, Wasim Aftab, Maximilian J. Götz, Sarah K. Payer, Niccoló Pietrantoni, Valentina Sjeničić, Sakthi K. Ravichandran, Till Bartke, Karl-Peter Hopfner, Ulrich Gerland, Philipp Korber, Alex S. Holehouse
Publicado en: BioRxiv, 2024
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2022.02.10.480018

Chromatin Protection by the Chromosomal Passenger Complex

Autores: A. Gireesh, M.A. Abad, R.-S. Nozawa, P. Sotelo-Parrilla, L.C. Dury, M. Likhodeeva, C. Spanos, C. Cardenal Peralta, J. Rappsilber, K.P. Hopfner, M.D. Wilson, W. Vanderlinden, T. Hirota, A.A. Jeyaprakash
Publicado en: BioRXiv, 2025
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2025.05.15.654082