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The genomic signature of rapid coevolution within a wild host-parasite system

Projektbeschreibung

Gemeinsame Evolution: Parasiten und ihre Wirte liefern Erkenntnisse über die antagonistische Symbiose

Parasitismus ist ein symbiotisches Verhältnis, das oft zur Koevolution von Parasit und Wirt führt. Trotz der umfassenden Auswirkungen auf Landwirtschaft, Viehhaltung, Aquakultur und die menschliche Gesundheit ist noch wenig über die Grundlage der Koevolution bekannt. Im EU-finanzierten Projekt Coevolution soll jetzt am Modellsystem des kleinen Planktonkrebses Daphnia magna und eines seiner Bakterienparasiten der Prozess der Koevolution aus genomischer Perspektive erforscht werden. Durch die Untersuchung des Genoms beider Arten über längere Zeiträume hinweg werden nicht nur völlig neue Belege für die antagonistische Koevolution in einer natürlichen Population geliefert, sondern auch dafür, wie diese die genetische Diversität, lokale Anpassungen und Differenzierungen vorantreibt.

Ziel

Parasites infect nearly all forms of metazoan life, and act to shape the evolution of host populations and drive the dynamics of entire biological communities. Parasitism also acts a 2-way street: As host populations evolve in response to selection imposed by their parasites, so too does the parasite evolve in response to its host. This antagonistic coevolution between host and parasite may generate much of the genetic diversity found in natural populations, and is likely a strong driver of local adaptation and population differentiation. Host-parasite coevolution is also of enormous practical concern for human society, as parasites impose considerable costs in respect to agriculture, livestock production, aquaculture, and human health. Unfortunately though, very little empirical evidence is available to evaluate some of the most fundamental predictions of coevolutionary theory, especially in respect to the genomic basis of coevolution, as past studies of antagonistic coevolution have typically been conducted at the phenotypic level, or using simplified host-parasite systems in a laboratory setting. I therefore propose to conduct a direct genome-level investigation of antagonistic coevolution between wild populations of a host (Daphnia magna) and its bacterial parasite (Pasteuria ramosa). This research will capitalize upon recent technical and theoretical advances in the D. magna / P. ramosa system, and will center upon the measurement of interspecies linkage disequilibrium across the genomes of both species. This investigation will be conducted across multiple timescales: A single point in time, across the course of one year, and across a 50-year sediment core time-series. I expect that these experiments will yield direct genomic evidence of antagonistic coevolution in a natural population, a clear test of Red Queen coevolutionary dynamics, and the first genetic time-series of such resolution and duration.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

MSCA-IF-EF-ST - Standard EF

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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) H2020-MSCA-IF-2018

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

UNIVERSITAT BASEL
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 203 149,44
Adresse
PETERSPLATZ 1
4051 Basel
Schweiz

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Region
Schweiz/Suisse/Svizzera Nordwestschweiz Basel-Stadt
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

€ 203 149,44
Mein Booklet 0 0