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Compartmentalized DNA Computers for In-Vitro Diagnostic Applications

Descrizione del progetto

Una diagnostica basata su MicroRNA attraverso computer a DNA

I cambiamenti nei livelli di microRNA sono associati alle malattie umane e il loro monitoraggio consente ai medici di effettuare diagnosi e valutare l’efficacia terapeutica dei farmaci. I computer a DNA rappresentano una tecnologia emergente che impiega hardware di DNA, biochimica e biologia molecolare al posto delle tradizionali tecnologie basate su silicio. Il progetto DNACom, finanziato dall’UE, stabilirà la prova di concetto di computer a DNA compartimentalizzati per una diagnosi molecolare in vitro e convaliderà l’applicazione commerciale di circuiti a DNA compartimentalizzati come dispositivi per i punti di assistenza per l’individuazione e la classificazione di firme di microRNA. Il progetto sfrutterà lo sviluppo da parte dei partner di computer molecolari compartimentalizzati basati su DNA all’interno di micro compartimenti semipermeabili realizzati con un coniugato albumina-polimero di siero bovino. La piattaforma è in grado di eseguire rilevamento distribuito ed elaborare filamenti di DNA e RNA.

Obiettivo

Changes in human microRNA (miRNA) levels are associated with several important human diseases. Monitoring changes in miRNA levels would enable clinicians to perform diagnosis and evaluate therapeutic efficacy of drugs. In principle, changes in a miRNA signature could be detected by existing methods such as quantitative reverse transcription PCR (RT-qPCR). However, the experimental complexity and computational analysis of the data prevents the measurements of miRNA signatures in a clinical setting. DNA-based molecular computers combine multiplex detection of DNA and RNA strands with molecular computation and are thus able to process and classify miRNA signatures into easy interpretable answers. In my ERC starting grant BioCircuit, we have made a technological breakthrough by compartmentalizing DNA-based molecular computers inside semipermeable micrometer-sized compartments made from a Bovine serum albumin (BSA) polymer conjugate. We have shown that compartmentalization of DNA circuits improves their speed by an order of magnitude and decreases their overall leakiness. Importantly, our work has revealed that this platform is capable of distributed sensing and processing of DNA and RNA strands.
In 'DNACom' we will 1) establish the technical proof of concept of compartmentalized DNA computers for in-vitro molecular diagnostics (IVDs) and 2) validate the commercial application of compartmentalized DNA circuits as low-cost, portable point-of-care devices for detection and classification of microRNA signatures.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

ERC-POC - Proof of Concept Grant

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) ERC-2018-PoC

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Istituzione ospitante

TECHNISCHE UNIVERSITEIT EINDHOVEN
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 149 770,00
Indirizzo
GROENE LOPER 3
5612 AE Eindhoven
Paesi Bassi

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Regione
Zuid-Nederland Noord-Brabant Zuidoost-Noord-Brabant
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 149 770,00

Beneficiari (1)

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