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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Innovative Statistical modelling for a better Understanding of Longitudinal multivariate responses in relation to Omic datasets

Description du projet

Les outils statistiques aident à révéler les relations entre les données «omiques» et les caractères spécifiques

Les scientifiques rassemblent des groupes de données dites «omiques» pour mieux comprendre l’évolution des caractères dans le temps. Par exemple, la génomique est l’étude de l’ensemble du génome ou de tous les gènes d’un organisme, et la transcriptomique est l’étude du transcriptome, c’est-à-dire de l’ensemble des transcriptions d’ARN produites par le génome. Les scientifiques analysent ensuite ces deux ensembles et en mesurent les caractéristiques les plus intéressantes, ainsi que leur évolution au fil du temps, dans le cadre d’études à long terme. Le projet ISULO, financé par l’UE, travaille actuellement sur des méthodes statistiques avancées pour analyser simultanément ces deux types de données et explorer les interrelations entre les jeux de données «omiques» dans l’objectif d’obtenir de nouvelles informations importantes sur l’évolution.

Objectif

In medicine and agronomy, there is a growing interest in identifying biological mechanisms involved in the evolution of traits along time. Nowadays, this challenging objective is achieved through the acquisition of high-dimensional –omic datasets from various biological levels, and with the collection of phenotype measures along time on the same individuals, so-called longitudinal data. A new research focus is emerging with the objective to analyze jointly these two types of data. In this project, we propose to develop innovative statistical methods to simultaneously analyze these types of data and to deal with their respective characteristics. Novel methodologies will be developed by combining statistical concepts from linear mixed model and variable selection in a Bayesian framework, and by incorporating or inferring biological relationships. The first aim will focus on the analysis of one or more longitudinal outcomes with one –omic data. Flexible modeling for approximating time-varying covariate effects combined with variable selection approaches will be proposed. Thus, a better understanding of the relationships along time between the outcomes and the relevant covariates will be reached. The second objective is to investigate the integration of multiple –omic datasets for explaining one univariate outcome, then one longitudinal response variable, and finally multivariate longitudinal outcomes. Bayesian hierarchical modeling with prior distributions allowing to capture relationships among –omic datasets will be investigated and new relationships among –omic datasets will be explored. The developments and findings of this project research will greatly contribute to the statistical and biological domains. New generic statistical methods will be developed and will be available for transversal applications in various fields. Finally, this project will highlight the added value brought by a collaborative and interdisciplinary work with experienced researchers.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2018

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

CENTRE DE COOPERATION INTERNATIONALE EN RECHERCHE AGRONOMIQUE POUR LEDEVELOPPEMENT - C.I.R.A.D. EPIC
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 275 619,84
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 275 619,84

Partenaires (1)

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