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Investigating the Activity of transposon Derived Regulatory Sequences in the placenta

Projektbeschreibung

Die Rolle der Transposonen in der Entwicklung der Plazenta

Die Entwicklung der Plazenta hängt größtenteils von der Genetik des Fötus und der Mutter ab. Tiefergehendes Wissen zu den Mechanismen hinter dieser Entwicklung könnte wichtige Erkenntnisse zu Schwangerschaftskomplikationen wie Präeklampsie und Wachstumseinschränkungen liefern. Das EU-finanzierte Projekt InvADeRS untersucht die Rolle von transponiblen Elementen, mobilen DNA-Elementen in Säugetiergenomen, die im Laufe der Evolution aus Virusinfektionen aufkamen. Die Forschenden wollen verstehen, ob diese Elemente die Genexpression in der menschlichen Plazenta regulieren und so die Verankerung der Plazenta in der Gebärmutter ermöglichen. Die Bestimmung bestimmter transponibler Elemente mit Regulierungspotenzial deutet auf wichtige Pfade der normalen Schwangerschaft hin und könnte weitere Forschung auf diesem Gebiet anregen.

Ziel

Aberrant epigenetic regulation of placental function is implicated in several complications of pregnancy, such as preeclampsia, recurrent pregnancy loss and fetal growth restriction. Notably, the placenta has a unique epigenetic landscape, permissive for the activity of transposable element (TE) derived DNA sequences. TEs are often co-opted by the host genome as cis-regulatory elements, driving tissue- and species-specific gene expression programs. Indeed, TEs contribute many placental-specific enhancers in mouse trophoblast. However, the presence and role of a similar TE-derived regulatory network has not been explored in human trophoblast. As TEs are highly species-specific, such a network in humans would be expected to regulate species-specific placental characteristics, such as the deep interstitial invasion unique to great apes. TE-derived regulatory elements may therefore be important for placental homeostasis and be involved in diseases characterised by aberrant placental invasion. I propose to map TE-derived cis-regulatory sequences in human trophoblast ex vivo using their histone modification signatures. I will assess the regulatory potential of candidate TEs through transcriptomic analyses and motif analysis to reveal transcription factor binding sites, highlighting promising candidates of importance in the human placenta. I will then directly test the function of top TE candidates using CRISPR-Cas9 genome editing of the TEs in trophoblast in vitro, and measuring changes in expression of target genes. Finally, I will elucidate epigenetic and coding differences between complicated and normal control placentas at the functional regulatory TE loci I find, to identify correlations with disease. This project will provide a comprehensive analysis of an as-yet unexplored aspect of human placental epigenetic regulation, and potentially identify novel causes of common unexplained complications of human pregnancy.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

MSCA-IF-EF-RI - RI – Reintegration panel

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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) H2020-MSCA-IF-2018

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Koordinator

QUEEN MARY UNIVERSITY OF LONDON
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 224 933,76
Adresse
327 MILE END ROAD
E1 4NS LONDON
Vereinigtes Königreich

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Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

€ 224 933,76
Mein Booklet 0 0