Opis projektu
Rola transpozonów w rozwoju łożyska
Rozwój łożyska w dużej mierze zależy od uwarunkowań genetycznych zarówno płodu, jak i matki. Zrozumienie mechanizmów leżących u jego podstaw dostarczy istotnej wiedzy na temat powikłań występujących w trakcie ciąży, takich jak stan przedrzucawkowy czy ograniczenie wzrostu. Zespół finansowanego przez UE projektu InvADeRS prowadzi badania dotyczące roli transpozonów – ruchomych sekwencji DNA występujących w genomach ssaków – które powstały w wyniku infekcji wirusowych w toku ewolucji. Naukowcy chcą ustalić, czy transpozony regulują ekspresję genów w łożysku człowieka, powodując wrastanie łożyska w macicę matki. Rozpoznanie specyficznych transpozonów o potencjale regulacyjnym może wskazać kluczowe szlaki występujące w prawidłowym przebiegu ciąży i stać się impulsem do dalszych badań w tej dziedzinie.
Cel
Aberrant epigenetic regulation of placental function is implicated in several complications of pregnancy, such as preeclampsia, recurrent pregnancy loss and fetal growth restriction. Notably, the placenta has a unique epigenetic landscape, permissive for the activity of transposable element (TE) derived DNA sequences. TEs are often co-opted by the host genome as cis-regulatory elements, driving tissue- and species-specific gene expression programs. Indeed, TEs contribute many placental-specific enhancers in mouse trophoblast. However, the presence and role of a similar TE-derived regulatory network has not been explored in human trophoblast. As TEs are highly species-specific, such a network in humans would be expected to regulate species-specific placental characteristics, such as the deep interstitial invasion unique to great apes. TE-derived regulatory elements may therefore be important for placental homeostasis and be involved in diseases characterised by aberrant placental invasion. I propose to map TE-derived cis-regulatory sequences in human trophoblast ex vivo using their histone modification signatures. I will assess the regulatory potential of candidate TEs through transcriptomic analyses and motif analysis to reveal transcription factor binding sites, highlighting promising candidates of importance in the human placenta. I will then directly test the function of top TE candidates using CRISPR-Cas9 genome editing of the TEs in trophoblast in vitro, and measuring changes in expression of target genes. Finally, I will elucidate epigenetic and coding differences between complicated and normal control placentas at the functional regulatory TE loci I find, to identify correlations with disease. This project will provide a comprehensive analysis of an as-yet unexplored aspect of human placental epigenetic regulation, and potentially identify novel causes of common unexplained complications of human pregnancy.
Dziedzina nauki
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- natural sciencesbiological scienceszoologymammalogyprimatology
- medical and health sciencesmedical biotechnologygenetic engineeringgene therapy
- medical and health sciencesclinical medicineobstetricsfetal medicine
- natural sciencesbiological sciencesgeneticsgenomes
- medical and health sciencesbasic medicinephysiologyhomeostasis
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
MSCA-IF-EF-RI - RI – Reintegration panelKoordynator
E1 4NS London
Zjednoczone Królestwo