Descrizione del progetto
Il ruolo dei trasposoni nello sviluppo della placenta
Lo sviluppo della placenta dipende in gran parte dalla genetica del feto e della madre. Comprendere i meccanismi sottostanti a tale sviluppo fornirebbe conoscenze importanti sulle complicazioni della gravidanza, come la preeclampsia e la limitazione della crescita fetale. Il progetto InvADeRS, finanziato dall’UE, sta approfondendo il ruolo degli elementi trasponibili (ET), ovvero quegli elementi mobili del DNA presenti nel genoma dei mammiferi emersi durante l’evoluzione a causa di infezioni virali. I ricercatori desiderano comprendere se gli ET regolano l’espressione genica nella placenta degli esseri umani, causando l’invasione della placenta nell’utero materno. Identificare i trasposoni specifici con potenziale regolatorio indica i percorsi chiave coinvolti in una gravidanza regolare e potrebbe promuovere ulteriori ricerche in questo campo.
Obiettivo
Aberrant epigenetic regulation of placental function is implicated in several complications of pregnancy, such as preeclampsia, recurrent pregnancy loss and fetal growth restriction. Notably, the placenta has a unique epigenetic landscape, permissive for the activity of transposable element (TE) derived DNA sequences. TEs are often co-opted by the host genome as cis-regulatory elements, driving tissue- and species-specific gene expression programs. Indeed, TEs contribute many placental-specific enhancers in mouse trophoblast. However, the presence and role of a similar TE-derived regulatory network has not been explored in human trophoblast. As TEs are highly species-specific, such a network in humans would be expected to regulate species-specific placental characteristics, such as the deep interstitial invasion unique to great apes. TE-derived regulatory elements may therefore be important for placental homeostasis and be involved in diseases characterised by aberrant placental invasion. I propose to map TE-derived cis-regulatory sequences in human trophoblast ex vivo using their histone modification signatures. I will assess the regulatory potential of candidate TEs through transcriptomic analyses and motif analysis to reveal transcription factor binding sites, highlighting promising candidates of importance in the human placenta. I will then directly test the function of top TE candidates using CRISPR-Cas9 genome editing of the TEs in trophoblast in vitro, and measuring changes in expression of target genes. Finally, I will elucidate epigenetic and coding differences between complicated and normal control placentas at the functional regulatory TE loci I find, to identify correlations with disease. This project will provide a comprehensive analysis of an as-yet unexplored aspect of human placental epigenetic regulation, and potentially identify novel causes of common unexplained complications of human pregnancy.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze biologiche zoologia mammologia primatologia
- scienze mediche e della salute biotecnologia medica ingegneria genetica terapia genica
- scienze mediche e della salute medicina clinica ostetricia medicina fetale
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
- scienze mediche e della salute medicina di base fisiologia omeostasi
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMMA PRINCIPALE
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
MSCA-IF-EF-RI - RI – Reintegration panel
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2018
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
E1 4NS LONDON
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.