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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Investigating impact of schizophrenia-associated non-coding variants on enhancer activity using brain organoids

Descripción del proyecto

A la búsqueda de variaciones no codificantes en el genoma relacionadas con la esquizofrenia

Nuestro ADN determina lo que somos física, emocional y cognitivamente, pero esta influencia no se limita a las proteínas codificadas por nuestros genes. Solo un 1 % de nuestro ADN está formado por genes que codifican proteínas. El resto son regiones no codificantes y muchas de ellas tienen un impacto en la expresión génica. Por si esto fuera poco, en los procesos de muchas enfermedades interviene más de una mutación. Con el apoyo de las Acciones Marie Skłodowska-Curie, el proyecto JS_SCZ investiga el desarrollo de la esquizofrenia, utilizando para ello organoides corticales como sistema experimental. La hipótesis es que el fenotipo de la esquizofrenia que aparece al final de la adolescencia es una manifestación de defectos en la neurogénesis y la maduración neuronal relacionados con variantes no codificantes.

Objetivo

What makes us susceptible to a genetic disease is a central question in human genetics. Although, coding mutations have revealed the mechanisms of many genetic diseases, the same approach is not adequate to unravel the etiology of complex diseases such as schizophrenia (SCZ). Genome wide association studies revealed that the majority of SCZ-associated polymorphisms map to the non-coding regions and possibly alter gene expression. However, the functional consequence of these polymorphisms on gene regulation remains largely unknown. Although the onset of SCZ symptoms occurs in late adolescence, SCZ patients show differential expression of neurodevelopmental genes and defects in neuronal maturation. Therefore, it is postulated that the SCZ phenotype is a late manifestation of defects in neurogenesis and neuronal maturation. Based on the neurodevelopmental model of SCZ, I hypothesize that these SCZ-associated non-coding variants disrupt the function of enhancers active during neurogenesis/ neuronal maturation. Therefore, using cortical organoids as an experimental system, I plan to investigate 1) Which SCZ-associated non-coding polymorphisms are located in neurodevelopmentally active enhancers. 2) Whether and how these non-coding variants affect enhancer function. To this end, I will perform massively parallel reporter assay to inspect the enhancer activity of both control and mutant sequences of SCZ-linked cis regulatory elements in the neural progenitors and neurons of the developing cortical organoids. This assay will reveal any effect of non-coding variants on the level, cell type or developmental stage of reporter transcription. This effect can be then verified by analyzing the expression of associated genes to reveal how common, low disease-risk alleles contribute to SCZ-susceptibility. Furthermore, this novel combination of organoids and functional genomics will pave the way for investigation of non-coding variation for diverse human diseases and traits.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2018

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Coordinador

INSTITUT FUER MOLEKULARE BIOTECHNOLOGIE GMBH
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 186 167,04
Dirección
DR BOHRGASSE 3
1030 WIEN
Austria

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Región
Ostösterreich Wien Wien
Tipo de actividad
Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

€ 186 167,04
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