Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Investigating impact of schizophrenia-associated non-coding variants on enhancer activity using brain organoids

Opis projektu

Na tropie wariantów niekodujących w genomie związanych z rozwojem schizofrenii

To, w jaki sposób DNA kształtuje nasz wygląd fizyczny, nasze emocje i funkcje poznawcze, jest procesem dużo bardziej złożonym niż zwyczajne kodowanie białek przez nasze geny. Prawda jest taka, że tylko mniej więcej jeden procent regionów DNA odpowiada za kodowanie białka, a resztę stanowią tak zwane regiony niekodujące, spośród których wiele wpływa na ekspresję genów. Sprawy komplikują się jeszcze bardziej, gdy zważymy na fakt, że wiele procesów chorobowych zachodzi w wyniku większej liczby mutacji. Wspierany z działań „Maria Skłodowska-Curie” zespół projektu JS_SCZ prowadzi badania dotyczące rozwoju schizofrenii, wykorzystując organoidy korowe jako system doświadczalny. Jego celem jest sprawdzenie hipotezy zakładającej, że fenotyp schizofrenii, który uwidacznia się w późniejszym okresie dojrzewania, jest wynikiem nieprawidłowości w procesach neurogenezy i dojrzewania neuronów, mających związek z regionami niekodującymi.

Cel

What makes us susceptible to a genetic disease is a central question in human genetics. Although, coding mutations have revealed the mechanisms of many genetic diseases, the same approach is not adequate to unravel the etiology of complex diseases such as schizophrenia (SCZ). Genome wide association studies revealed that the majority of SCZ-associated polymorphisms map to the non-coding regions and possibly alter gene expression. However, the functional consequence of these polymorphisms on gene regulation remains largely unknown. Although the onset of SCZ symptoms occurs in late adolescence, SCZ patients show differential expression of neurodevelopmental genes and defects in neuronal maturation. Therefore, it is postulated that the SCZ phenotype is a late manifestation of defects in neurogenesis and neuronal maturation. Based on the neurodevelopmental model of SCZ, I hypothesize that these SCZ-associated non-coding variants disrupt the function of enhancers active during neurogenesis/ neuronal maturation. Therefore, using cortical organoids as an experimental system, I plan to investigate 1) Which SCZ-associated non-coding polymorphisms are located in neurodevelopmentally active enhancers. 2) Whether and how these non-coding variants affect enhancer function. To this end, I will perform massively parallel reporter assay to inspect the enhancer activity of both control and mutant sequences of SCZ-linked cis regulatory elements in the neural progenitors and neurons of the developing cortical organoids. This assay will reveal any effect of non-coding variants on the level, cell type or developmental stage of reporter transcription. This effect can be then verified by analyzing the expression of associated genes to reveal how common, low disease-risk alleles contribute to SCZ-susceptibility. Furthermore, this novel combination of organoids and functional genomics will pave the way for investigation of non-coding variation for diverse human diseases and traits.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2018

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

INSTITUT FUER MOLEKULARE BIOTECHNOLOGIE GMBH
Wkład UE netto
€ 186 167,04
Adres
DR BOHRGASSE 3
1030 Wien
Austria
Region
Ostösterreich Wien Wien
Rodzaj działalności
Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
Linki
Koszt całkowity
€ 186 167,04