Descripción del proyecto
Expresión génica rítmica durante el desarrollo
Nuevas pruebas indican que la expresión de ciertos genes durante el desarrollo está controlada de forma rítmica. Sin embargo, aún se desconoce el mecanismo molecular preciso. En el nematodo «Caenorhabditis elegans», cerca de dos mil setecientos genes presentan una expresión oscilante durante la fase larvaria, incluidos ciertos genes miARN reguladores. El proyecto financiado con fondos europeos miRhythm aplicará un enfoque multidisciplinario para delinear la función del miARN oscilante específico en la expresión génica rítmica. Los resultados arrojarán luz sobre la orquestación temporal de eventos clave del desarrollo, como la proliferación y diferenciación celular. miRhythm nos ayudará a comprender los importantes mecanismos subyacentes a la sincronización biológica.
Objetivo
Successful development of an organism relies on careful temporal orchestration of a large number of diverse events. Although processes such as cell proliferation, migration and differentiation are thus under precise temporal control, molecular mechanisms of the relevant biological timers have remained largely enigmatic. I propose to exploit the repetitive development and robust oscillatory gene expression of the nematode C. elegans to identify fundamental principles of temporal control of organismal development through rhythmic gene expression. High temporal reproducibility of developmental progression and genetic tractability are additional major assets of this novel experimental paradigm.
Previous work in my host-lab uncovered high-amplitude oscillatory expression of ~2700 genes peaking exactly once per larval stage, with an ~8-hr period. These oscillations appear to orchestrate periodic developmental events encompassing synthesis and shedding of the cuticle, cell proliferation and differentiation. A small set of regulatory miRNAs also exhibit oscillations with large amplitudes. This is surprising given that miRNAs are generally quite stable, and that the transcript level oscillations appear to be rely mostly on rhythmic transcription. Here, I propose to delineate the function of oscillatory miRNAs in rhythmic gene expression and development, and the mechanisms that render them sufficiently unstable to facilitate oscillation. Thus, through a combination of high-throughput developmental tracking, single-cell sequencing, bioinformatics, and biophysics approaches, I expect to uncover molecular mechanisms that control developmental timing and miRNA metabolism.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
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Programa(s)
Régimen de financiación
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinador
4056 BASEL
Suiza