Opis projektu
Rytmiczna ekspresja genów podczas rozwoju
Coraz więcej dowodów wskazuje na to, że ekspresja pewnych genów w trakcie rozwoju podlega rytmicznej kontroli. Jednakże dokładny mechanizm molekularny tego zjawiska pozostaje niejasny. Ekspresję oscylacyjną stwierdzono w niemal 2 700 genów nicienia Caenorhabditis elegans w stadium larwalnym, w tym w pewnych regulacyjnych genach miRNA. Badacze z finansowanego ze środków UE projektu miRhythm obiorą podejście multidyscyplinarne do wyjaśnienia funkcji określonych oscylacyjnych miRNA w rytmicznej ekspresji genów. Wyniki projektu rzucą więcej światła na czasowe zawiadywanie kluczowymi zdarzeniami rozwojowymi, takimi jak proliferacja komórek i ich różnicowanie. Co istotne, projekt miRhythm pomoże w zrozumieniu mechanizmów leżących u podstaw zjawiska synchronizacji biologicznej.
Cel
Successful development of an organism relies on careful temporal orchestration of a large number of diverse events. Although processes such as cell proliferation, migration and differentiation are thus under precise temporal control, molecular mechanisms of the relevant biological timers have remained largely enigmatic. I propose to exploit the repetitive development and robust oscillatory gene expression of the nematode C. elegans to identify fundamental principles of temporal control of organismal development through rhythmic gene expression. High temporal reproducibility of developmental progression and genetic tractability are additional major assets of this novel experimental paradigm.
Previous work in my host-lab uncovered high-amplitude oscillatory expression of ~2700 genes peaking exactly once per larval stage, with an ~8-hr period. These oscillations appear to orchestrate periodic developmental events encompassing synthesis and shedding of the cuticle, cell proliferation and differentiation. A small set of regulatory miRNAs also exhibit oscillations with large amplitudes. This is surprising given that miRNAs are generally quite stable, and that the transcript level oscillations appear to be rely mostly on rhythmic transcription. Here, I propose to delineate the function of oscillatory miRNAs in rhythmic gene expression and development, and the mechanisms that render them sufficiently unstable to facilitate oscillation. Thus, through a combination of high-throughput developmental tracking, single-cell sequencing, bioinformatics, and biophysics approaches, I expect to uncover molecular mechanisms that control developmental timing and miRNA metabolism.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Koordynator
4056 BASEL
Szwajcaria