Tracing the origin and early evolution of animal cell type regulation with genomics and single-cell approaches

Información del proyecto

EvoCellMap

Identificador del acuerdo de subvención: 851647

DOI

10.3030/851647

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 13 Noviembre 2019

Fecha de inicio 1 Enero 2020

Fecha de finalización 30 Noviembre 2025

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 1 498 070,00

Aportación de la UE

€ 1 498 070,00

Coordinado por

FUNDACIO CENTRE DE REGULACIO GENOMICA
Spain

CORDIS proporciona enlaces a los documentos públicos y las publicaciones de los proyectos de los programas marco HORIZONTE.

Los enlaces a los documentos y las publicaciones de los proyectos del Séptimo Programa Marco, así como los enlaces a algunos tipos de resultados específicos, como conjuntos de datos y «software», se obtienen dinámicamente de OpenAIRE .

Resultado final

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan (DMP)

The DMP will explainathe handling of research data during after the end of the projectbwhat data will be collected processed andor generatedcwhich methodology standards will be applieddwhether data will be sharedmade open access andehow data will be curated preserved including after the end of the project

Publicaciones

Peer reviewed articles (12)

Evolutionary cell type mapping with single-cell genomics

Autores: Amos Tanay, Arnau Sebé-Pedrós
Publicado en: Trends in Genetics, Edición 10, 2021, Página(s) 919-932, ISSN 0168-9525
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tig.2021.04.008

A stony coral cell atlas illuminates the molecular and cellular basis of coral symbiosis, calcification, and immunity

Autores: Shani Levy, Anamaria Elek, Xavier Grau-Bové, Simón Menéndez-Bravo, Marta Iglesias, Amos Tanay, Tali Mass, Arnau Sebé-Pedrós
Publicado en: Cell, Edición 184/11, 2021, Página(s) 2973-2987.e18, ISSN 0092-8674
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2021.04.005

The evolution of facultative symbiosis in stony corals

Autores: Shani Levy, Xavier Grau-Bové, Iana V. Kim, Sebastian R. Najle, Ewa Księżopolska, Anamaria Elek, Laia Montes-Espuña, Sean A. Montgomery, Tali Mass, Arnau Sebé-Pedrós
Publicado en: Nature, Edición 648, 2025, Página(s) 368-376, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-025-09623-6

An amphioxus neurula stage cell atlas supports a complex scenario for the emergence of vertebrate head mesoderm

Autores: Xavier Grau-Bové, Lucie Subirana, Lydvina Meister, Anaël Soubigou, Ana Neto, Anamaria Elek, Silvia Naranjo, Oscar Fornas, Jose Luis Gomez-Skarmeta, Juan J. Tena, Manuel Irimia, Stéphanie Bertrand,
Publicado en: Nature Communications, Edición 15, 2024, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-48774-4

Pancreas agenesis mutations disrupt a lead enhancer controlling a developmental enhancer cluster

Autores: Irene Miguel-Escalada, Miguel Ángel Maestro, Diego Balboa, Anamaria Elek, Aina Bernal, Edgar Bernardo, Vanessa Grau, Javier García-Hurtado, Arnau Sebé-Pedrós, Jorge Ferrer
Publicado en: Developmental Cell, Edición 57, 2024, Página(s) 1922-1936.e9, ISSN 1534-5807
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2022.07.014

cGLRs are a diverse family of pattern recognition receptors in innate immunity

Autores: Yao Li, Kailey M. Slavik, Hunter C. Toyoda, Benjamin R. Morehouse, Carina C. de Oliveira Mann, Anamaria Elek, Shani Levy, Zhenwei Wang, Kepler S. Mears, Jingjing Liu, Dmitry Kashin, Ximing Guo, Tali Mass, Arnau Sebé-Pedrós, Frank Schwede, Philip J. Kranzusch
Publicado en: Cell, Edición 186, 2024, Página(s) 3261-3276.e20, ISSN 0092-8674
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2023.05.038

A phylogenetic and proteomic reconstruction of eukaryotic chromatin evolution

Autores: Xavier Grau-Bové, Cristina Navarrete, Cristina Chiva, Thomas Pribasnig, Meritxell Antó, Guifré Torruella, Luis Javier Galindo, Bernd Franz Lang, David Moreira, Purificación López-Garcia, Iñaki R
Publicado en: Nature Ecology & Evolution, Edición 6, 2022, Página(s) pages1007–1023, ISSN 2397-334X
Editor: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s41559-022-01771-6

DNA methylation enables recurrent endogenization of giant viruses in an animal relative

Autores: Luke A. Sarre, Iana V. Kim, Vladimir Ovchinnikov, Marine Olivetta, Hiroshi Suga, Omaya Dudin, Arnau Sebé-Pedrós, Alex de Mendoza
Publicado en: Science Advances, Edición 10, 2024, ISSN 2375-2548
Editor: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/sciadv.ado6406

Single cell atlas of Xenoturbella bocki highlights limited cell-type complexity

Autores: Helen E. Robertson, Arnau Sebé-Pedrós, Baptiste Saudemont, Yann Loe-Mie, Anne-C. Zakrzewski, Xavier Grau-Bové, Marie-Pierre Mailhe, Philipp Schiffer, Maximilian J. Telford, Heather Marlow
Publicado en: Nature Communications, Edición 15, 2024, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-45956-y

Orthology clusters from gene trees with Possvm

Autores: Xavier Grau-Bové; Arnau Sebé-Pedrós
Publicado en: Molecular Biology and Evolution, Edición 38, 2021, Página(s) 5204-5208, ISSN 0737-4038
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2021.05.03.442399

Chromatin loops are an ancestral hallmark of the animal regulatory genome

Autores: Iana V. Kim, Cristina Navarrete, Xavier Grau-Bové, Marta Iglesias, Anamaria Elek, Grygoriy Zolotarov, Nikolai S. Bykov, Sean A. Montgomery, Ewa Ksiezopolska, Didac Cañas-Armenteros, Joan J. Soto-Ang
Publicado en: Nature, Edición 642, 2025, Página(s) 1097-1105, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-025-08960-w

Stepwise emergence of the neuronal gene expression program in early animal evolution

Autores: Sebastián R. Najle, Xavier Grau-Bové, Anamaria Elek, Cristina Navarrete, Damiano Cianferoni, Cristina Chiva, Didac Cañas-Armenteros, Arrate Mallabiabarrena, Kai Kamm, Eduard Sabidó, Harald Gruber-Vodicka, Bernd Schierwater, Luis Serrano, Arnau Sebé-Pedrós
Publicado en: Cell, Edición 186, 2024, Página(s) 4676-4693.e29, ISSN 0092-8674
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2023.08.027