Tracing the origin and early evolution of animal cell type regulation with genomics and single-cell approaches

Projektinformationen

EvoCellMap

ID Finanzhilfevereinbarung: 851647

DOI

10.3030/851647

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 13 November 2019

Startdatum 1 Januar 2020

Enddatum 30 November 2025

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 498 070,00

EU-Beitrag

€ 1 498 070,00

Koordiniert durch

FUNDACIO CENTRE DE REGULACIO GENOMICA
Spain

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Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan (DMP)

The DMP will explainathe handling of research data during after the end of the projectbwhat data will be collected processed andor generatedcwhich methodology standards will be applieddwhether data will be sharedmade open access andehow data will be curated preserved including after the end of the project

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (12)

Evolutionary cell type mapping with single-cell genomics

Autoren: Amos Tanay, Arnau Sebé-Pedrós
Veröffentlicht in: Trends in Genetics, Ausgabe 10, 2021, Seite(n) 919-932, ISSN 0168-9525
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tig.2021.04.008

A stony coral cell atlas illuminates the molecular and cellular basis of coral symbiosis, calcification, and immunity

Autoren: Shani Levy, Anamaria Elek, Xavier Grau-Bové, Simón Menéndez-Bravo, Marta Iglesias, Amos Tanay, Tali Mass, Arnau Sebé-Pedrós
Veröffentlicht in: Cell, Ausgabe 184/11, 2021, Seite(n) 2973-2987.e18, ISSN 0092-8674
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2021.04.005

The evolution of facultative symbiosis in stony corals

Autoren: Shani Levy, Xavier Grau-Bové, Iana V. Kim, Sebastian R. Najle, Ewa Księżopolska, Anamaria Elek, Laia Montes-Espuña, Sean A. Montgomery, Tali Mass, Arnau Sebé-Pedrós
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 648, 2025, Seite(n) 368-376, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-025-09623-6

An amphioxus neurula stage cell atlas supports a complex scenario for the emergence of vertebrate head mesoderm

Autoren: Xavier Grau-Bové, Lucie Subirana, Lydvina Meister, Anaël Soubigou, Ana Neto, Anamaria Elek, Silvia Naranjo, Oscar Fornas, Jose Luis Gomez-Skarmeta, Juan J. Tena, Manuel Irimia, Stéphanie Bertrand,
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 15, 2024, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-48774-4

Pancreas agenesis mutations disrupt a lead enhancer controlling a developmental enhancer cluster

Autoren: Irene Miguel-Escalada, Miguel Ángel Maestro, Diego Balboa, Anamaria Elek, Aina Bernal, Edgar Bernardo, Vanessa Grau, Javier García-Hurtado, Arnau Sebé-Pedrós, Jorge Ferrer
Veröffentlicht in: Developmental Cell, Ausgabe 57, 2024, Seite(n) 1922-1936.e9, ISSN 1534-5807
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2022.07.014

cGLRs are a diverse family of pattern recognition receptors in innate immunity

Autoren: Yao Li, Kailey M. Slavik, Hunter C. Toyoda, Benjamin R. Morehouse, Carina C. de Oliveira Mann, Anamaria Elek, Shani Levy, Zhenwei Wang, Kepler S. Mears, Jingjing Liu, Dmitry Kashin, Ximing Guo, Tali Mass, Arnau Sebé-Pedrós, Frank Schwede, Philip J. Kranzusch
Veröffentlicht in: Cell, Ausgabe 186, 2024, Seite(n) 3261-3276.e20, ISSN 0092-8674
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2023.05.038

A phylogenetic and proteomic reconstruction of eukaryotic chromatin evolution

Autoren: Xavier Grau-Bové, Cristina Navarrete, Cristina Chiva, Thomas Pribasnig, Meritxell Antó, Guifré Torruella, Luis Javier Galindo, Bernd Franz Lang, David Moreira, Purificación López-Garcia, Iñaki R
Veröffentlicht in: Nature Ecology & Evolution, Ausgabe 6, 2022, Seite(n) pages1007–1023, ISSN 2397-334X
Herausgeber: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s41559-022-01771-6

DNA methylation enables recurrent endogenization of giant viruses in an animal relative

Autoren: Luke A. Sarre, Iana V. Kim, Vladimir Ovchinnikov, Marine Olivetta, Hiroshi Suga, Omaya Dudin, Arnau Sebé-Pedrós, Alex de Mendoza
Veröffentlicht in: Science Advances, Ausgabe 10, 2024, ISSN 2375-2548
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/sciadv.ado6406

Single cell atlas of Xenoturbella bocki highlights limited cell-type complexity

Autoren: Helen E. Robertson, Arnau Sebé-Pedrós, Baptiste Saudemont, Yann Loe-Mie, Anne-C. Zakrzewski, Xavier Grau-Bové, Marie-Pierre Mailhe, Philipp Schiffer, Maximilian J. Telford, Heather Marlow
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 15, 2024, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-45956-y

Orthology clusters from gene trees with Possvm

Autoren: Xavier Grau-Bové; Arnau Sebé-Pedrós
Veröffentlicht in: Molecular Biology and Evolution, Ausgabe 38, 2021, Seite(n) 5204-5208, ISSN 0737-4038
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2021.05.03.442399

Chromatin loops are an ancestral hallmark of the animal regulatory genome

Autoren: Iana V. Kim, Cristina Navarrete, Xavier Grau-Bové, Marta Iglesias, Anamaria Elek, Grygoriy Zolotarov, Nikolai S. Bykov, Sean A. Montgomery, Ewa Ksiezopolska, Didac Cañas-Armenteros, Joan J. Soto-Ang
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 642, 2025, Seite(n) 1097-1105, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-025-08960-w

Stepwise emergence of the neuronal gene expression program in early animal evolution

Autoren: Sebastián R. Najle, Xavier Grau-Bové, Anamaria Elek, Cristina Navarrete, Damiano Cianferoni, Cristina Chiva, Didac Cañas-Armenteros, Arrate Mallabiabarrena, Kai Kamm, Eduard Sabidó, Harald Gruber-Vodicka, Bernd Schierwater, Luis Serrano, Arnau Sebé-Pedrós
Veröffentlicht in: Cell, Ausgabe 186, 2024, Seite(n) 4676-4693.e29, ISSN 0092-8674
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2023.08.027