Tracing the origin and early evolution of animal cell type regulation with genomics and single-cell approaches

Informazioni relative al progetto

EvoCellMap

ID dell’accordo di sovvenzione: 851647

DOI

10.3030/851647

Progetto chiuso

Data della firma CE 13 Novembre 2019

Data di avvio 1 Gennaio 2020

Data di completamento 30 Novembre 2025

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 498 070,00

Contributo UE

€ 1 498 070,00

Coordinato da

FUNDACIO CENTRE DE REGULACIO GENOMICA
Spain

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Risultati finali

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan (DMP)

The DMP will explainathe handling of research data during after the end of the projectbwhat data will be collected processed andor generatedcwhich methodology standards will be applieddwhether data will be sharedmade open access andehow data will be curated preserved including after the end of the project

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (12)

Evolutionary cell type mapping with single-cell genomics

Autori: Amos Tanay, Arnau Sebé-Pedrós
Pubblicato in: Trends in Genetics, Numero 10, 2021, Pagina/e 919-932, ISSN 0168-9525
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tig.2021.04.008

A stony coral cell atlas illuminates the molecular and cellular basis of coral symbiosis, calcification, and immunity

Autori: Shani Levy, Anamaria Elek, Xavier Grau-Bové, Simón Menéndez-Bravo, Marta Iglesias, Amos Tanay, Tali Mass, Arnau Sebé-Pedrós
Pubblicato in: Cell, Numero 184/11, 2021, Pagina/e 2973-2987.e18, ISSN 0092-8674
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2021.04.005

The evolution of facultative symbiosis in stony corals

Autori: Shani Levy, Xavier Grau-Bové, Iana V. Kim, Sebastian R. Najle, Ewa Księżopolska, Anamaria Elek, Laia Montes-Espuña, Sean A. Montgomery, Tali Mass, Arnau Sebé-Pedrós
Pubblicato in: Nature, Numero 648, 2025, Pagina/e 368-376, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-025-09623-6

An amphioxus neurula stage cell atlas supports a complex scenario for the emergence of vertebrate head mesoderm

Autori: Xavier Grau-Bové, Lucie Subirana, Lydvina Meister, Anaël Soubigou, Ana Neto, Anamaria Elek, Silvia Naranjo, Oscar Fornas, Jose Luis Gomez-Skarmeta, Juan J. Tena, Manuel Irimia, Stéphanie Bertrand,
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 15, 2024, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-48774-4

Pancreas agenesis mutations disrupt a lead enhancer controlling a developmental enhancer cluster

Autori: Irene Miguel-Escalada, Miguel Ángel Maestro, Diego Balboa, Anamaria Elek, Aina Bernal, Edgar Bernardo, Vanessa Grau, Javier García-Hurtado, Arnau Sebé-Pedrós, Jorge Ferrer
Pubblicato in: Developmental Cell, Numero 57, 2024, Pagina/e 1922-1936.e9, ISSN 1534-5807
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2022.07.014

cGLRs are a diverse family of pattern recognition receptors in innate immunity

Autori: Yao Li, Kailey M. Slavik, Hunter C. Toyoda, Benjamin R. Morehouse, Carina C. de Oliveira Mann, Anamaria Elek, Shani Levy, Zhenwei Wang, Kepler S. Mears, Jingjing Liu, Dmitry Kashin, Ximing Guo, Tali Mass, Arnau Sebé-Pedrós, Frank Schwede, Philip J. Kranzusch
Pubblicato in: Cell, Numero 186, 2024, Pagina/e 3261-3276.e20, ISSN 0092-8674
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2023.05.038

A phylogenetic and proteomic reconstruction of eukaryotic chromatin evolution

Autori: Xavier Grau-Bové, Cristina Navarrete, Cristina Chiva, Thomas Pribasnig, Meritxell Antó, Guifré Torruella, Luis Javier Galindo, Bernd Franz Lang, David Moreira, Purificación López-Garcia, Iñaki R
Pubblicato in: Nature Ecology & Evolution, Numero 6, 2022, Pagina/e pages1007–1023, ISSN 2397-334X
Editore: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s41559-022-01771-6

DNA methylation enables recurrent endogenization of giant viruses in an animal relative

Autori: Luke A. Sarre, Iana V. Kim, Vladimir Ovchinnikov, Marine Olivetta, Hiroshi Suga, Omaya Dudin, Arnau Sebé-Pedrós, Alex de Mendoza
Pubblicato in: Science Advances, Numero 10, 2024, ISSN 2375-2548
Editore: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/sciadv.ado6406

Single cell atlas of Xenoturbella bocki highlights limited cell-type complexity

Autori: Helen E. Robertson, Arnau Sebé-Pedrós, Baptiste Saudemont, Yann Loe-Mie, Anne-C. Zakrzewski, Xavier Grau-Bové, Marie-Pierre Mailhe, Philipp Schiffer, Maximilian J. Telford, Heather Marlow
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 15, 2024, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-45956-y

Orthology clusters from gene trees with Possvm

Autori: Xavier Grau-Bové; Arnau Sebé-Pedrós
Pubblicato in: Molecular Biology and Evolution, Numero 38, 2021, Pagina/e 5204-5208, ISSN 0737-4038
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2021.05.03.442399

Chromatin loops are an ancestral hallmark of the animal regulatory genome

Autori: Iana V. Kim, Cristina Navarrete, Xavier Grau-Bové, Marta Iglesias, Anamaria Elek, Grygoriy Zolotarov, Nikolai S. Bykov, Sean A. Montgomery, Ewa Ksiezopolska, Didac Cañas-Armenteros, Joan J. Soto-Ang
Pubblicato in: Nature, Numero 642, 2025, Pagina/e 1097-1105, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-025-08960-w

Stepwise emergence of the neuronal gene expression program in early animal evolution

Autori: Sebastián R. Najle, Xavier Grau-Bové, Anamaria Elek, Cristina Navarrete, Damiano Cianferoni, Cristina Chiva, Didac Cañas-Armenteros, Arrate Mallabiabarrena, Kai Kamm, Eduard Sabidó, Harald Gruber-Vodicka, Bernd Schierwater, Luis Serrano, Arnau Sebé-Pedrós
Pubblicato in: Cell, Numero 186, 2024, Pagina/e 4676-4693.e29, ISSN 0092-8674
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2023.08.027