Tracing the origin and early evolution of animal cell type regulation with genomics and single-cell approaches

Informacje na temat projektu

EvoCellMap

Identyfikator umowy o grant: 851647

DOI

10.3030/851647

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 13 Listopada 2019

Data rozpoczęcia 1 Stycznia 2020

Data zakończenia 30 Listopada 2025

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 498 070,00

Wkład UE

€ 1 498 070,00

Koordynowany przez

FUNDACIO CENTRE DE REGULACIO GENOMICA
Spain

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan (DMP)

The DMP will explainathe handling of research data during after the end of the projectbwhat data will be collected processed andor generatedcwhich methodology standards will be applieddwhether data will be sharedmade open access andehow data will be curated preserved including after the end of the project

Publikacje

Peer reviewed articles (12)

Evolutionary cell type mapping with single-cell genomics

Autorzy: Amos Tanay, Arnau Sebé-Pedrós
Opublikowane w: Trends in Genetics, Numer 10, 2021, Strona(/y) 919-932, ISSN 0168-9525
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tig.2021.04.008

A stony coral cell atlas illuminates the molecular and cellular basis of coral symbiosis, calcification, and immunity

Autorzy: Shani Levy, Anamaria Elek, Xavier Grau-Bové, Simón Menéndez-Bravo, Marta Iglesias, Amos Tanay, Tali Mass, Arnau Sebé-Pedrós
Opublikowane w: Cell, Numer 184/11, 2021, Strona(/y) 2973-2987.e18, ISSN 0092-8674
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2021.04.005

The evolution of facultative symbiosis in stony corals

Autorzy: Shani Levy, Xavier Grau-Bové, Iana V. Kim, Sebastian R. Najle, Ewa Księżopolska, Anamaria Elek, Laia Montes-Espuña, Sean A. Montgomery, Tali Mass, Arnau Sebé-Pedrós
Opublikowane w: Nature, Numer 648, 2025, Strona(/y) 368-376, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-025-09623-6

An amphioxus neurula stage cell atlas supports a complex scenario for the emergence of vertebrate head mesoderm

Autorzy: Xavier Grau-Bové, Lucie Subirana, Lydvina Meister, Anaël Soubigou, Ana Neto, Anamaria Elek, Silvia Naranjo, Oscar Fornas, Jose Luis Gomez-Skarmeta, Juan J. Tena, Manuel Irimia, Stéphanie Bertrand,
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 15, 2024, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-48774-4

Pancreas agenesis mutations disrupt a lead enhancer controlling a developmental enhancer cluster

Autorzy: Irene Miguel-Escalada, Miguel Ángel Maestro, Diego Balboa, Anamaria Elek, Aina Bernal, Edgar Bernardo, Vanessa Grau, Javier García-Hurtado, Arnau Sebé-Pedrós, Jorge Ferrer
Opublikowane w: Developmental Cell, Numer 57, 2024, Strona(/y) 1922-1936.e9, ISSN 1534-5807
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2022.07.014

cGLRs are a diverse family of pattern recognition receptors in innate immunity

Autorzy: Yao Li, Kailey M. Slavik, Hunter C. Toyoda, Benjamin R. Morehouse, Carina C. de Oliveira Mann, Anamaria Elek, Shani Levy, Zhenwei Wang, Kepler S. Mears, Jingjing Liu, Dmitry Kashin, Ximing Guo, Tali Mass, Arnau Sebé-Pedrós, Frank Schwede, Philip J. Kranzusch
Opublikowane w: Cell, Numer 186, 2024, Strona(/y) 3261-3276.e20, ISSN 0092-8674
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2023.05.038

A phylogenetic and proteomic reconstruction of eukaryotic chromatin evolution

Autorzy: Xavier Grau-Bové, Cristina Navarrete, Cristina Chiva, Thomas Pribasnig, Meritxell Antó, Guifré Torruella, Luis Javier Galindo, Bernd Franz Lang, David Moreira, Purificación López-Garcia, Iñaki R
Opublikowane w: Nature Ecology & Evolution, Numer 6, 2022, Strona(/y) pages1007–1023, ISSN 2397-334X
Wydawca: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s41559-022-01771-6

DNA methylation enables recurrent endogenization of giant viruses in an animal relative

Autorzy: Luke A. Sarre, Iana V. Kim, Vladimir Ovchinnikov, Marine Olivetta, Hiroshi Suga, Omaya Dudin, Arnau Sebé-Pedrós, Alex de Mendoza
Opublikowane w: Science Advances, Numer 10, 2024, ISSN 2375-2548
Wydawca: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/sciadv.ado6406

Single cell atlas of Xenoturbella bocki highlights limited cell-type complexity

Autorzy: Helen E. Robertson, Arnau Sebé-Pedrós, Baptiste Saudemont, Yann Loe-Mie, Anne-C. Zakrzewski, Xavier Grau-Bové, Marie-Pierre Mailhe, Philipp Schiffer, Maximilian J. Telford, Heather Marlow
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 15, 2024, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-45956-y

Orthology clusters from gene trees with Possvm

Autorzy: Xavier Grau-Bové; Arnau Sebé-Pedrós
Opublikowane w: Molecular Biology and Evolution, Numer 38, 2021, Strona(/y) 5204-5208, ISSN 0737-4038
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2021.05.03.442399

Chromatin loops are an ancestral hallmark of the animal regulatory genome

Autorzy: Iana V. Kim, Cristina Navarrete, Xavier Grau-Bové, Marta Iglesias, Anamaria Elek, Grygoriy Zolotarov, Nikolai S. Bykov, Sean A. Montgomery, Ewa Ksiezopolska, Didac Cañas-Armenteros, Joan J. Soto-Ang
Opublikowane w: Nature, Numer 642, 2025, Strona(/y) 1097-1105, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-025-08960-w

Stepwise emergence of the neuronal gene expression program in early animal evolution

Autorzy: Sebastián R. Najle, Xavier Grau-Bové, Anamaria Elek, Cristina Navarrete, Damiano Cianferoni, Cristina Chiva, Didac Cañas-Armenteros, Arrate Mallabiabarrena, Kai Kamm, Eduard Sabidó, Harald Gruber-Vodicka, Bernd Schierwater, Luis Serrano, Arnau Sebé-Pedrós
Opublikowane w: Cell, Numer 186, 2024, Strona(/y) 4676-4693.e29, ISSN 0092-8674
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2023.08.027